Protein–RNA interactions for Protein: Q9CUN6

Smurf1, E3 ubiquitin-protein ligase SMURF1, mousemouse

Predictions only

Length 731 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smurf1Q9CUN6 Pck1-201ENSMUST00000029017 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Smurf1Q9CUN6 Hsd3b6-201ENSMUST00000029463 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Smurf1Q9CUN6 Larp7-201ENSMUST00000029588 2121 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Smurf1Q9CUN6 Tomm7-201ENSMUST00000030851 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Smurf1Q9CUN6 Trpv6-201ENSMUST00000031902 2923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Smurf1Q9CUN6 Them4-201ENSMUST00000049822 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Smurf1Q9CUN6 Lclat1-201ENSMUST00000067545 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Smurf1Q9CUN6 Myh6-201ENSMUST00000081857 6113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Smurf1Q9CUN6 Hnrnpa2b1-202ENSMUST00000090002 1662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Smurf1Q9CUN6 Scn5a-202ENSMUST00000117911 8453 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
Smurf1Q9CUN6 Exoc3l4-201ENSMUST00000072646 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
Smurf1Q9CUN6 Ank2-221ENSMUST00000182994 2715 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
Smurf1Q9CUN6 Eif3a-201ENSMUST00000025955 5176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
Smurf1Q9CUN6 Slc9a8-201ENSMUST00000047815 4521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Smurf1Q9CUN6 Cad-211ENSMUST00000202795 6559 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Smurf1Q9CUN6 Ddx54-201ENSMUST00000031598 4322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Smurf1Q9CUN6 Zfp608-201ENSMUST00000064763 6112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Smurf1Q9CUN6 Gdap2-202ENSMUST00000106997 2014 ntTSL 2 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Smurf1Q9CUN6 Dcaf4-208ENSMUST00000223291 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Smurf1Q9CUN6 Fgl2-201ENSMUST00000035799 3788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Smurf1Q9CUN6 Scrn3-202ENSMUST00000112050 1897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Smurf1Q9CUN6 Acrbp-202ENSMUST00000088294 1883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Smurf1Q9CUN6 Camk2g-203ENSMUST00000100837 3564 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Smurf1Q9CUN6 Cldn18-202ENSMUST00000112882 1750 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Smurf1Q9CUN6 App-206ENSMUST00000227723 8167 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Smurf1Q9CUN6 Poldip3-202ENSMUST00000100375 3157 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Smurf1Q9CUN6 Cyp2s1-202ENSMUST00000108395 3161 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Smurf1Q9CUN6 Oxsm-202ENSMUST00000112624 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Smurf1Q9CUN6 4732491K20Rik-201ENSMUST00000181774 3142 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Smurf1Q9CUN6 1600014C10Rik-201ENSMUST00000067854 3143 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Smurf1Q9CUN6 Tpx2-206ENSMUST00000164120 4365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Smurf1Q9CUN6 Crybg3-205ENSMUST00000172910 2870 ntTSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Smurf1Q9CUN6 Aldh3a2-201ENSMUST00000066277 2892 ntTSL 2 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Smurf1Q9CUN6 Gm2885-201ENSMUST00000181895 1442 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Smurf1Q9CUN6 Skp1a-201ENSMUST00000037324 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Smurf1Q9CUN6 Axin2-201ENSMUST00000052915 4260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Smurf1Q9CUN6 Nab1-204ENSMUST00000170269 1371 ntTSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Smurf1Q9CUN6 Klk1b16-201ENSMUST00000005933 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Smurf1Q9CUN6 Ppih-203ENSMUST00000106318 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Smurf1Q9CUN6 Tpd52l2-203ENSMUST00000108799 985 ntTSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Smurf1Q9CUN6 9230102O04Rik-201ENSMUST00000114915 528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Smurf1Q9CUN6 Snhg20-201ENSMUST00000145438 459 ntTSL 3 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Smurf1Q9CUN6 Snhg17-206ENSMUST00000152125 1046 ntTSL 3 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Smurf1Q9CUN6 1600014C10Rik-203ENSMUST00000177983 403 ntTSL 2 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Smurf1Q9CUN6 Gm43275-201ENSMUST00000202053 1020 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Smurf1Q9CUN6 Gm45691-201ENSMUST00000206905 1120 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Smurf1Q9CUN6 AC122463.1-201ENSMUST00000214559 597 ntTSL 3 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Smurf1Q9CUN6 Gm36634-201ENSMUST00000218356 1259 ntTSL 3 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Smurf1Q9CUN6 AC166349.1-201ENSMUST00000220866 695 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Smurf1Q9CUN6 H1foo-201ENSMUST00000037831 1113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Smurf1Q9CUN6 Atp6v1d-201ENSMUST00000021536 3667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Smurf1Q9CUN6 Lbr-201ENSMUST00000005003 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Smurf1Q9CUN6 Mroh8-202ENSMUST00000143663 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Smurf1Q9CUN6 Ikbkg-205ENSMUST00000114129 2222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Smurf1Q9CUN6 Baiap3-206ENSMUST00000182825 3862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Smurf1Q9CUN6 BC034090-201ENSMUST00000035914 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Smurf1Q9CUN6 Olfr56-204ENSMUST00000203149 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Smurf1Q9CUN6 Als2-204ENSMUST00000163058 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Smurf1Q9CUN6 Kcnh3-201ENSMUST00000041415 3583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Smurf1Q9CUN6 B230317F23Rik-201ENSMUST00000052189 2472 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Smurf1Q9CUN6 Rhoj-203ENSMUST00000118966 4892 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Smurf1Q9CUN6 Odf2l-204ENSMUST00000106192 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Smurf1Q9CUN6 Pbx1-208ENSMUST00000188912 3970 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Smurf1Q9CUN6 Araf-201ENSMUST00000001155 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Smurf1Q9CUN6 Prdx2-202ENSMUST00000109733 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Smurf1Q9CUN6 Syn2-202ENSMUST00000169345 3854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Smurf1Q9CUN6 Txlna-201ENSMUST00000046425 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Smurf1Q9CUN6 Flad1-202ENSMUST00000107426 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Smurf1Q9CUN6 Foxn2-201ENSMUST00000112238 5085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Smurf1Q9CUN6 Dgkh-202ENSMUST00000226342 15261 ntAPPRIS P1 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Smurf1Q9CUN6 Gm9200-201ENSMUST00000118513 1354 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Smurf1Q9CUN6 Ric8a-201ENSMUST00000026558 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Smurf1Q9CUN6 Htr1b-202ENSMUST00000183482 4724 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Smurf1Q9CUN6 Gm42941-201ENSMUST00000200347 1321 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Smurf1Q9CUN6 Arfgap1-202ENSMUST00000108859 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Smurf1Q9CUN6 Synj2-203ENSMUST00000115784 2634 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Smurf1Q9CUN6 Gm10646-201ENSMUST00000213227 3293 ntTSL 2 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Smurf1Q9CUN6 Derl2-202ENSMUST00000108523 884 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Smurf1Q9CUN6 Nr2f1-203ENSMUST00000127137 991 ntTSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Smurf1Q9CUN6 Nrg4-204ENSMUST00000130158 1000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Smurf1Q9CUN6 Dcdc2b-203ENSMUST00000179209 864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Smurf1Q9CUN6 Gm5370-201ENSMUST00000187187 574 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Smurf1Q9CUN6 Gm42980-201ENSMUST00000200582 1028 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Smurf1Q9CUN6 Olfr812-202ENSMUST00000203571 1232 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Smurf1Q9CUN6 Dhrs4-202ENSMUST00000226168 828 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Smurf1Q9CUN6 Cd37-201ENSMUST00000033063 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Smurf1Q9CUN6 Rpl10l-201ENSMUST00000081908 1023 ntAPPRIS P1 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Smurf1Q9CUN6 Tpd52-204ENSMUST00000094381 1074 ntTSL 3 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Smurf1Q9CUN6 Tas1r2-202ENSMUST00000166773 2524 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Smurf1Q9CUN6 Arc-202ENSMUST00000110009 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Smurf1Q9CUN6 Arc-201ENSMUST00000023268 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Smurf1Q9CUN6 Hspa5-201ENSMUST00000028222 3672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Smurf1Q9CUN6 Cd93-201ENSMUST00000099269 6677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Smurf1Q9CUN6 Mageb4-202ENSMUST00000113969 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Smurf1Q9CUN6 Pbld1-201ENSMUST00000020266 2407 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Smurf1Q9CUN6 Pyurf-201ENSMUST00000053386 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Smurf1Q9CUN6 Ifi47-202ENSMUST00000109202 1773 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Smurf1Q9CUN6 Slc19a1-201ENSMUST00000105410 2347 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Smurf1Q9CUN6 Dcaf12l1-202ENSMUST00000115056 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Smurf1Q9CUN6 Cd6-202ENSMUST00000039043 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
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