Protein–RNA interactions for Protein: Q9CSN1

Snw1, SNW domain-containing protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 536 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snw1Q9CSN1 AC165351.1-201ENSMUST00000219078 2020 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Snw1Q9CSN1 Xrra1-202ENSMUST00000207855 1334 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Snw1Q9CSN1 Stom-201ENSMUST00000028241 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Snw1Q9CSN1 Tcirg1-204ENSMUST00000126070 3041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Snw1Q9CSN1 Cdnf-201ENSMUST00000036350 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Snw1Q9CSN1 Tfr2-201ENSMUST00000031729 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Snw1Q9CSN1 Myo18a-205ENSMUST00000100794 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Snw1Q9CSN1 Akap5-203ENSMUST00000172992 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Snw1Q9CSN1 Slc2a7-201ENSMUST00000059893 1578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Snw1Q9CSN1 Dpysl4-201ENSMUST00000026551 3552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Snw1Q9CSN1 Spats2l-201ENSMUST00000163239 2313 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Snw1Q9CSN1 Riox2-206ENSMUST00000160571 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Snw1Q9CSN1 Wdr26-208ENSMUST00000162963 6452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Snw1Q9CSN1 Gm11700-201ENSMUST00000119409 403 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Snw1Q9CSN1 Gm16087-201ENSMUST00000124395 964 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Snw1Q9CSN1 Ccdc28a-203ENSMUST00000173243 590 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Snw1Q9CSN1 Trav13d-3-201ENSMUST00000179512 391 ntAPPRIS P1 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Snw1Q9CSN1 Trav13n-3-201ENSMUST00000179580 337 ntAPPRIS P1 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Snw1Q9CSN1 Tfr2-206ENSMUST00000198783 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Snw1Q9CSN1 Snhg8-203ENSMUST00000199645 528 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Snw1Q9CSN1 Gm45799-208ENSMUST00000211054 490 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Snw1Q9CSN1 Gm21769-201ENSMUST00000211922 111 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Snw1Q9CSN1 Spata33-205ENSMUST00000212523 486 ntTSL 3 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Snw1Q9CSN1 Gm33115-201ENSMUST00000220913 743 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Snw1Q9CSN1 Lect2-202ENSMUST00000225183 823 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Snw1Q9CSN1 BC049730-201ENSMUST00000051714 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Snw1Q9CSN1 Lect2-201ENSMUST00000062806 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Snw1Q9CSN1 Nras-201ENSMUST00000029445 4470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Snw1Q9CSN1 Capn3-204ENSMUST00000110716 2752 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Snw1Q9CSN1 Ces3b-201ENSMUST00000074403 1907 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Snw1Q9CSN1 Tdrd9-201ENSMUST00000079009 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Snw1Q9CSN1 Tspan14-202ENSMUST00000224209 2477 ntAPPRIS P1 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Snw1Q9CSN1 Ccnb1-201ENSMUST00000072119 2489 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Snw1Q9CSN1 Npy5r-202ENSMUST00000211920 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Snw1Q9CSN1 Vrk1-201ENSMUST00000021539 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Snw1Q9CSN1 Tef-202ENSMUST00000109553 4401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Snw1Q9CSN1 H2afv-202ENSMUST00000109737 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Snw1Q9CSN1 Zfp251-201ENSMUST00000080406 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Snw1Q9CSN1 Poldip3-201ENSMUST00000058793 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Snw1Q9CSN1 Tuft1-201ENSMUST00000006123 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Snw1Q9CSN1 Slc38a3-202ENSMUST00000167868 3151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Snw1Q9CSN1 Gm15609-201ENSMUST00000155610 2960 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Snw1Q9CSN1 Myh10-204ENSMUST00000108673 1315 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Snw1Q9CSN1 Nhlh2-201ENSMUST00000066187 3761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Snw1Q9CSN1 Mroh1-201ENSMUST00000092595 5111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Snw1Q9CSN1 Hsd3b1-201ENSMUST00000029465 1663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Snw1Q9CSN1 Slc38a3-201ENSMUST00000010208 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Snw1Q9CSN1 Gm21136-201ENSMUST00000186812 2575 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
Snw1Q9CSN1 Gm6605-201ENSMUST00000031488 2574 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
Snw1Q9CSN1 Erich1-201ENSMUST00000110813 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Snw1Q9CSN1 Polm-201ENSMUST00000020767 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Snw1Q9CSN1 AC122811.1-201ENSMUST00000222257 2921 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
Snw1Q9CSN1 Pla2g4a-202ENSMUST00000111926 2835 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Snw1Q9CSN1 Myo7a-213ENSMUST00000205746 6689 ntTSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Snw1Q9CSN1 Frmd4a-202ENSMUST00000091497 6208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Snw1Q9CSN1 Gypa-201ENSMUST00000063359 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Snw1Q9CSN1 Pou2f1-202ENSMUST00000069609 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Snw1Q9CSN1 Cacna1c-212ENSMUST00000187940 7507 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Snw1Q9CSN1 Gm11989-201ENSMUST00000117240 672 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
Snw1Q9CSN1 Gm11362-201ENSMUST00000118838 850 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
Snw1Q9CSN1 Gm11222-201ENSMUST00000119005 738 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
Snw1Q9CSN1 Gm37259-201ENSMUST00000193903 849 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
Snw1Q9CSN1 Gm5565-201ENSMUST00000199463 1162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Snw1Q9CSN1 Gm45892-201ENSMUST00000212627 273 ntTSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Snw1Q9CSN1 Gm9257-201ENSMUST00000221254 232 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
Snw1Q9CSN1 Gm11361-201ENSMUST00000223428 607 ntAPPRIS P1 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Snw1Q9CSN1 Csf1-201ENSMUST00000014743 4176 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Snw1Q9CSN1 Natd1-201ENSMUST00000019075 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Snw1Q9CSN1 Rufy2-203ENSMUST00000122231 2664 ntTSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Snw1Q9CSN1 Nlrp6-203ENSMUST00000183845 4436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Snw1Q9CSN1 Steap3-201ENSMUST00000112639 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Snw1Q9CSN1 Dbh-201ENSMUST00000000910 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Snw1Q9CSN1 Slc36a1-203ENSMUST00000108872 5264 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Snw1Q9CSN1 Snap29-201ENSMUST00000023449 3429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Snw1Q9CSN1 Nop16-201ENSMUST00000026987 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Snw1Q9CSN1 Mcf2l-203ENSMUST00000110866 5108 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Snw1Q9CSN1 Abi1-208ENSMUST00000139038 2899 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Snw1Q9CSN1 Kcnj11-205ENSMUST00000211674 3142 ntAPPRIS P1 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Snw1Q9CSN1 Nefl-201ENSMUST00000022639 3380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Snw1Q9CSN1 Tonsl-207ENSMUST00000168185 4235 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Snw1Q9CSN1 Kalrn-211ENSMUST00000114966 3857 ntTSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Snw1Q9CSN1 Gm6560-201ENSMUST00000198588 1591 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
Snw1Q9CSN1 Gatb-202ENSMUST00000107672 1820 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Snw1Q9CSN1 Irak4-201ENSMUST00000074936 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Snw1Q9CSN1 Gm43963-201ENSMUST00000203466 2488 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
Snw1Q9CSN1 4930488L21Rik-201ENSMUST00000181864 3244 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Snw1Q9CSN1 Prrc2b-202ENSMUST00000069817 10671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Snw1Q9CSN1 Ccnt1-208ENSMUST00000169707 7397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Snw1Q9CSN1 Gm4780-202ENSMUST00000215200 2644 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
Snw1Q9CSN1 Plcxd3-201ENSMUST00000061925 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Snw1Q9CSN1 Olfm4-201ENSMUST00000088735 1640 ntTSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Snw1Q9CSN1 Dmp1-201ENSMUST00000066708 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Snw1Q9CSN1 Mcam-202ENSMUST00000098852 2772 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Snw1Q9CSN1 Ephb2-203ENSMUST00000105846 3653 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Snw1Q9CSN1 Gpr45-201ENSMUST00000114761 1546 ntAPPRIS P1 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Snw1Q9CSN1 C230014O12Rik-201ENSMUST00000134921 2668 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Snw1Q9CSN1 Fdxacb1-201ENSMUST00000042391 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Snw1Q9CSN1 Abca7-203ENSMUST00000171637 6638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Snw1Q9CSN1 Zmynd8-203ENSMUST00000099084 5232 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Snw1Q9CSN1 Gm24255-201ENSMUST00000104481 128 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.8 ms