Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQD0

Rpl39l, RIKEN cDNA 4930517K11, mousemouse

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Length 51 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpl39lQ9CQD0 Plxnb3-201ENSMUST00000002079 6030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.61□□□□□ -1.19
Rpl39lQ9CQD0 Ano1-202ENSMUST00000118556 4566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.61□□□□□ -1.19
Rpl39lQ9CQD0 Gm13556-201ENSMUST00000132692 1412 ntTSL 3 BASIC7.61□□□□□ -1.19
Rpl39lQ9CQD0 Cnmd-201ENSMUST00000022603 1433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.61□□□□□ -1.19
Rpl39lQ9CQD0 Gm9035-201ENSMUST00000218318 1697 ntBASIC7.6□□□□□ -1.19
Rpl39lQ9CQD0 Sirpa-201ENSMUST00000049262 3644 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.6□□□□□ -1.19
Rpl39lQ9CQD0 Ptpn21-202ENSMUST00000170188 5562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.6□□□□□ -1.19
Rpl39lQ9CQD0 Gpatch2-204ENSMUST00000110943 4702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.6□□□□□ -1.19
Rpl39lQ9CQD0 Mst1r-201ENSMUST00000035203 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.6□□□□□ -1.19
Rpl39lQ9CQD0 Ddx21-201ENSMUST00000045866 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.6□□□□□ -1.19
Rpl39lQ9CQD0 Zswim9-201ENSMUST00000108532 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.6□□□□□ -1.19
Rpl39lQ9CQD0 Ckmt1-201ENSMUST00000000317 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.6□□□□□ -1.19
Rpl39lQ9CQD0 Spem2-201ENSMUST00000056941 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.6□□□□□ -1.19
Rpl39lQ9CQD0 Mx2-202ENSMUST00000188251 2421 ntTSL 1 (best) BASIC7.6□□□□□ -1.19
Rpl39lQ9CQD0 Mx2-201ENSMUST00000024112 2417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.6□□□□□ -1.19
Rpl39lQ9CQD0 Lct-201ENSMUST00000073490 6174 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.6□□□□□ -1.19
Rpl39lQ9CQD0 Rasgef1c-202ENSMUST00000093141 2120 ntTSL 1 (best) BASIC7.6□□□□□ -1.19
Rpl39lQ9CQD0 Golm1-201ENSMUST00000022039 3954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.6□□□□□ -1.19
Rpl39lQ9CQD0 Fsd2-201ENSMUST00000042318 3985 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.6□□□□□ -1.19
Rpl39lQ9CQD0 Ccdc162-212ENSMUST00000219054 3182 ntTSL 5 BASIC7.6□□□□□ -1.19
Rpl39lQ9CQD0 Acsl5-201ENSMUST00000043150 4243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.6□□□□□ -1.19
Rpl39lQ9CQD0 Abi1-208ENSMUST00000139038 2899 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC7.6□□□□□ -1.19
Rpl39lQ9CQD0 Gm23912-201ENSMUST00000104687 87 ntBASIC7.6□□□□□ -1.19
Rpl39lQ9CQD0 Cnn2-202ENSMUST00000105374 926 ntTSL 5 BASIC7.6□□□□□ -1.19
Rpl39lQ9CQD0 Spsb1-202ENSMUST00000105684 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.6□□□□□ -1.19
Rpl39lQ9CQD0 Cpsf4l-203ENSMUST00000106617 1123 ntTSL 1 (best) BASIC7.6□□□□□ -1.19
Rpl39lQ9CQD0 Gm14701-201ENSMUST00000117156 348 ntBASIC7.6□□□□□ -1.19
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Rpl39lQ9CQD0 Gm20499-201ENSMUST00000140374 444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.6□□□□□ -1.19
Rpl39lQ9CQD0 4930515B02Rik-201ENSMUST00000140588 591 ntTSL 1 (best) BASIC7.6□□□□□ -1.19
Rpl39lQ9CQD0 Snhg20-201ENSMUST00000145438 459 ntTSL 3 BASIC7.6□□□□□ -1.19
Rpl39lQ9CQD0 Gm16137-201ENSMUST00000161571 664 ntTSL 5 BASIC7.6□□□□□ -1.19
Rpl39lQ9CQD0 Smyd1-205ENSMUST00000173297 947 ntTSL 5 BASIC7.6□□□□□ -1.19
Rpl39lQ9CQD0 Rnf141-207ENSMUST00000176716 1080 ntTSL 2 BASIC7.6□□□□□ -1.19
Rpl39lQ9CQD0 Lsm10-203ENSMUST00000179323 808 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.6□□□□□ -1.19
Rpl39lQ9CQD0 Gm27838-201ENSMUST00000184829 128 ntBASIC7.6□□□□□ -1.19
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Rpl39lQ9CQD0 Gm37922-201ENSMUST00000195596 455 ntBASIC7.6□□□□□ -1.19
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Rpl39lQ9CQD0 AC099934.4-201ENSMUST00000220745 523 ntTSL 5 BASIC7.6□□□□□ -1.19
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Rpl39lQ9CQD0 S1pr2-201ENSMUST00000054197 6394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.6□□□□□ -1.19
Rpl39lQ9CQD0 Iqcf3-201ENSMUST00000062917 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.6□□□□□ -1.19
Rpl39lQ9CQD0 Smim11-201ENSMUST00000063641 517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.6□□□□□ -1.19
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Rpl39lQ9CQD0 Odf3l2-201ENSMUST00000095464 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.6□□□□□ -1.19
Rpl39lQ9CQD0 Fank1-201ENSMUST00000065359 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.6□□□□□ -1.19
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Rpl39lQ9CQD0 Ascc1-202ENSMUST00000164083 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.6□□□□□ -1.19
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Rpl39lQ9CQD0 Zfp93-201ENSMUST00000032696 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.6□□□□□ -1.19
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Rpl39lQ9CQD0 Ciapin1-209ENSMUST00000162538 4359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.19
Rpl39lQ9CQD0 Pex13-201ENSMUST00000020523 4146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.19
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Rpl39lQ9CQD0 Igtp-203ENSMUST00000168280 1832 ntTSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.19
Rpl39lQ9CQD0 Gm20755-201ENSMUST00000196893 1827 ntTSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.19
Rpl39lQ9CQD0 Mms19-201ENSMUST00000026168 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.59□□□□□ -1.19
Rpl39lQ9CQD0 Ncstn-201ENSMUST00000003550 2901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.19
Rpl39lQ9CQD0 Sdccag8-202ENSMUST00000056773 1551 ntTSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.19
Rpl39lQ9CQD0 Ak8-201ENSMUST00000074156 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.19
Rpl39lQ9CQD0 Tdrd3-202ENSMUST00000168275 2657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.19
Rpl39lQ9CQD0 Slc2a4-203ENSMUST00000141837 1776 ntTSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.19
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Rpl39lQ9CQD0 Kcnn3-201ENSMUST00000000811 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.19
Rpl39lQ9CQD0 Trpm1-201ENSMUST00000085222 5711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.19
Rpl39lQ9CQD0 Gm4755-201ENSMUST00000181803 2647 ntTSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.19
Rpl39lQ9CQD0 Gm13398-201ENSMUST00000149378 2837 ntTSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.19
Rpl39lQ9CQD0 Kcnmb3-201ENSMUST00000164954 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.59□□□□□ -1.19
Rpl39lQ9CQD0 C2cd5-201ENSMUST00000087485 4265 ntTSL 5 BASIC7.59□□□□□ -1.19
Rpl39lQ9CQD0 Vmn1r213-204ENSMUST00000228758 5975 ntAPPRIS P2 BASIC7.59□□□□□ -1.19
Rpl39lQ9CQD0 Flg2-201ENSMUST00000098884 7011 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.59□□□□□ -1.19
Rpl39lQ9CQD0 Gm21586-201ENSMUST00000107988 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.19
Rpl39lQ9CQD0 Gm21953-201ENSMUST00000108002 264 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.59□□□□□ -1.19
Rpl39lQ9CQD0 Bud23-203ENSMUST00000111205 1169 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC7.59□□□□□ -1.19
Rpl39lQ9CQD0 Gm12341-201ENSMUST00000119724 503 ntBASIC7.59□□□□□ -1.19
Rpl39lQ9CQD0 Gm15487-201ENSMUST00000122373 465 ntBASIC7.59□□□□□ -1.19
Rpl39lQ9CQD0 Gm2231-201ENSMUST00000125661 612 ntBASIC7.59□□□□□ -1.19
Rpl39lQ9CQD0 3110056K07Rik-202ENSMUST00000136690 1063 ntTSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.19
Rpl39lQ9CQD0 Snhg17-206ENSMUST00000152125 1046 ntTSL 3 BASIC7.59□□□□□ -1.19
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