Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQ10

Chmp3, Charged multivesicular body protein 3, mousemouse

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Length 224 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chmp3Q9CQ10 B4galt1-201ENSMUST00000030121 3983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Chmp3Q9CQ10 Togaram1-207ENSMUST00000223166 6386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Chmp3Q9CQ10 Tacc3-202ENSMUST00000079534 2899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Chmp3Q9CQ10 Dmbt1-201ENSMUST00000084509 6243 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Chmp3Q9CQ10 Ube2c-201ENSMUST00000001439 2191 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Chmp3Q9CQ10 Lgals8-203ENSMUST00000124888 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Chmp3Q9CQ10 Igfbp5-201ENSMUST00000027377 6006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Chmp3Q9CQ10 Npr2-201ENSMUST00000030191 3660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Chmp3Q9CQ10 Mmab-201ENSMUST00000031560 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Chmp3Q9CQ10 Tfdp1-201ENSMUST00000170909 1700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Chmp3Q9CQ10 Vmn1r193-202ENSMUST00000227457 6429 ntAPPRIS P1 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Chmp3Q9CQ10 Padi6-201ENSMUST00000038749 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Chmp3Q9CQ10 Tram1l1-201ENSMUST00000058994 3889 ntAPPRIS P1 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Chmp3Q9CQ10 Pnpla6-202ENSMUST00000111070 4496 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Chmp3Q9CQ10 Cngb1-203ENSMUST00000120044 3243 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Chmp3Q9CQ10 Slc25a21-205ENSMUST00000217690 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Chmp3Q9CQ10 Zfp423-201ENSMUST00000052250 4510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Chmp3Q9CQ10 Slc6a9-210ENSMUST00000169885 1876 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Chmp3Q9CQ10 6230400D17Rik-201ENSMUST00000180987 1554 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Chmp3Q9CQ10 Zfp157-203ENSMUST00000110912 886 ntTSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Chmp3Q9CQ10 Cd27-203ENSMUST00000112282 588 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Chmp3Q9CQ10 4931406G06Rik-201ENSMUST00000147848 1252 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Chmp3Q9CQ10 Gm44805-202ENSMUST00000150569 587 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Chmp3Q9CQ10 Gm20442-201ENSMUST00000174630 492 ntTSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Chmp3Q9CQ10 Gm26838-201ENSMUST00000180485 911 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Chmp3Q9CQ10 Dusp13-211ENSMUST00000183943 779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Chmp3Q9CQ10 Gm5852-201ENSMUST00000194119 1021 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Chmp3Q9CQ10 Gm38804-201ENSMUST00000203998 767 ntTSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
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Chmp3Q9CQ10 Gm10109-202ENSMUST00000206890 1211 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Chmp3Q9CQ10 Saa2-202ENSMUST00000210272 511 ntTSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Chmp3Q9CQ10 AC101677.2-201ENSMUST00000218733 741 ntTSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Chmp3Q9CQ10 AC154290.1-201ENSMUST00000223786 1240 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Chmp3Q9CQ10 Pf4-201ENSMUST00000031320 588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Chmp3Q9CQ10 Gm10109-201ENSMUST00000072123 1078 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Chmp3Q9CQ10 Mybphl-201ENSMUST00000090563 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Chmp3Q9CQ10 Tmc4-201ENSMUST00000038743 2310 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Chmp3Q9CQ10 Tmem269-201ENSMUST00000030394 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Chmp3Q9CQ10 Immt-202ENSMUST00000101301 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Chmp3Q9CQ10 Plekhn1-203ENSMUST00000217885 1982 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Chmp3Q9CQ10 Ank2-203ENSMUST00000182008 2474 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Chmp3Q9CQ10 Gsdma-201ENSMUST00000017348 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Chmp3Q9CQ10 4930453L07Rik-201ENSMUST00000209053 1439 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Chmp3Q9CQ10 Hr-205ENSMUST00000163060 5278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Chmp3Q9CQ10 Kalrn-210ENSMUST00000114964 2693 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Chmp3Q9CQ10 Eps15l1-203ENSMUST00000212121 2686 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Chmp3Q9CQ10 Cpped1-202ENSMUST00000096272 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Chmp3Q9CQ10 Eya1-202ENSMUST00000080664 3426 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Chmp3Q9CQ10 Arid3b-209ENSMUST00000171444 4171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Chmp3Q9CQ10 Kremen1-201ENSMUST00000020662 4856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Chmp3Q9CQ10 Il22ra1-201ENSMUST00000102546 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Chmp3Q9CQ10 Taf6-202ENSMUST00000110936 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Chmp3Q9CQ10 Oxsm-202ENSMUST00000112624 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Chmp3Q9CQ10 Slc2a7-201ENSMUST00000059893 1578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Chmp3Q9CQ10 Adipor2-202ENSMUST00000169744 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Chmp3Q9CQ10 Tcf12-218ENSMUST00000184783 3489 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Chmp3Q9CQ10 Wdcp-205ENSMUST00000220215 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Chmp3Q9CQ10 Ikzf4-203ENSMUST00000221150 2213 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Chmp3Q9CQ10 Phactr3-202ENSMUST00000103066 2680 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Chmp3Q9CQ10 Wdr45-206ENSMUST00000116634 1250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Chmp3Q9CQ10 Gm14441-201ENSMUST00000121960 540 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Chmp3Q9CQ10 Gm7666-201ENSMUST00000146631 819 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
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Chmp3Q9CQ10 Gm37793-201ENSMUST00000195548 695 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Chmp3Q9CQ10 Gm2511-202ENSMUST00000206158 455 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Chmp3Q9CQ10 Gm4797-201ENSMUST00000219075 1283 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Chmp3Q9CQ10 AC135469.1-201ENSMUST00000225984 772 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Chmp3Q9CQ10 Cby1-201ENSMUST00000023064 1119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Chmp3Q9CQ10 C1qtnf6-201ENSMUST00000023075 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Chmp3Q9CQ10 Apold1-201ENSMUST00000167323 3567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Chmp3Q9CQ10 Nxph2-201ENSMUST00000102945 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Chmp3Q9CQ10 1700001L05Rik-201ENSMUST00000100370 2270 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Chmp3Q9CQ10 Astn1-202ENSMUST00000170718 2927 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Chmp3Q9CQ10 Adh5-201ENSMUST00000005964 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Chmp3Q9CQ10 Zfp597-201ENSMUST00000090522 5668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Chmp3Q9CQ10 Wdr92-201ENSMUST00000046955 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Chmp3Q9CQ10 E2f7-209ENSMUST00000174857 2865 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Chmp3Q9CQ10 Lcmt2-202ENSMUST00000110674 3056 ntAPPRIS P1 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Chmp3Q9CQ10 Ntrk2-202ENSMUST00000109838 6846 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Chmp3Q9CQ10 Plekhg5-204ENSMUST00000118648 3818 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Chmp3Q9CQ10 A430057M04Rik-201ENSMUST00000169054 3835 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Chmp3Q9CQ10 Tor1aip1-202ENSMUST00000097527 4234 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Chmp3Q9CQ10 Sh3pxd2a-201ENSMUST00000081619 10464 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Chmp3Q9CQ10 Cyp4x1-201ENSMUST00000051400 1524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Chmp3Q9CQ10 Lmo7-205ENSMUST00000159314 5774 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Chmp3Q9CQ10 Fyb2-201ENSMUST00000106803 3136 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Chmp3Q9CQ10 AC156031.2-201ENSMUST00000213107 3310 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Chmp3Q9CQ10 Tgfbr2-201ENSMUST00000035014 3476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Chmp3Q9CQ10 Nr1h3-203ENSMUST00000111355 1672 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Chmp3Q9CQ10 Mapkapk5-203ENSMUST00000111782 969 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Chmp3Q9CQ10 Gm11783-201ENSMUST00000119549 885 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Chmp3Q9CQ10 Gm16178-201ENSMUST00000129408 677 ntTSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Chmp3Q9CQ10 Gm14662-201ENSMUST00000145552 734 ntTSL 3 BASIC14.47□□□□□ -0.09
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