Protein–RNA interactions for Protein: Q9CPR4

Rpl17, 60S ribosomal protein L17, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 184 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpl17Q9CPR4 Gm3764-205ENSMUST00000181134 2203 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Rpl17Q9CPR4 Xndc1-201ENSMUST00000094130 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Rpl17Q9CPR4 Rbak-202ENSMUST00000165318 3480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Rpl17Q9CPR4 B4galt4-201ENSMUST00000023482 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Rpl17Q9CPR4 Pou2f2-203ENSMUST00000108415 7095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Rpl17Q9CPR4 Gm23272-201ENSMUST00000104053 129 ntBASIC12.25□□□□□ -0.45
Rpl17Q9CPR4 Acrbp-204ENSMUST00000112413 672 ntTSL 2 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Rpl17Q9CPR4 Gm12036-201ENSMUST00000120008 530 ntBASIC12.25□□□□□ -0.45
Rpl17Q9CPR4 Smim1-204ENSMUST00000130175 477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Rpl17Q9CPR4 Smim1-206ENSMUST00000132541 490 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Rpl17Q9CPR4 Gm14236-201ENSMUST00000142374 872 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Rpl17Q9CPR4 Cdpf1-205ENSMUST00000150995 566 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Rpl17Q9CPR4 9430093N23Rik-201ENSMUST00000152494 515 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Rpl17Q9CPR4 Gm20442-201ENSMUST00000174630 492 ntTSL 3 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Rpl17Q9CPR4 Gm37406-201ENSMUST00000192478 500 ntTSL 3 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Rpl17Q9CPR4 Ighv1-60-201ENSMUST00000195816 405 ntBASIC12.25□□□□□ -0.45
Rpl17Q9CPR4 Gm7504-201ENSMUST00000201449 424 ntBASIC12.25□□□□□ -0.45
Rpl17Q9CPR4 AA545190-201ENSMUST00000203495 1053 ntTSL 2 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Rpl17Q9CPR4 CT025553.1-201ENSMUST00000226292 299 ntBASIC12.25□□□□□ -0.45
Rpl17Q9CPR4 Smco2-201ENSMUST00000032433 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Rpl17Q9CPR4 Snu13-202ENSMUST00000080622 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Rpl17Q9CPR4 Gm23105-201ENSMUST00000083719 134 ntBASIC12.25□□□□□ -0.45
Rpl17Q9CPR4 Nphs1os-201ENSMUST00000152625 1339 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Rpl17Q9CPR4 Brinp2-201ENSMUST00000004133 4167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Rpl17Q9CPR4 5430405H02Rik-201ENSMUST00000153616 1431 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Rpl17Q9CPR4 Srsf5-201ENSMUST00000094693 1527 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Rpl17Q9CPR4 Iqsec3-203ENSMUST00000151397 8067 ntTSL 2 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Rpl17Q9CPR4 Gbf1-201ENSMUST00000026254 6450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Rpl17Q9CPR4 Col6a3-208ENSMUST00000188587 8285 ntTSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Rpl17Q9CPR4 Abi2-205ENSMUST00000187709 1671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Rpl17Q9CPR4 Fam155a-201ENSMUST00000110969 3388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Rpl17Q9CPR4 Ephx1-201ENSMUST00000036928 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Rpl17Q9CPR4 Gm12198-201ENSMUST00000154068 1809 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Rpl17Q9CPR4 Kcnn2-201ENSMUST00000066890 3682 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Rpl17Q9CPR4 Runx1-201ENSMUST00000023673 5861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Rpl17Q9CPR4 Ly6e-210ENSMUST00000188866 2068 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Rpl17Q9CPR4 A430093F15Rik-204ENSMUST00000186596 2115 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Rpl17Q9CPR4 Gramd1b-201ENSMUST00000045682 7488 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Rpl17Q9CPR4 Txndc5-203ENSMUST00000160653 2586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Rpl17Q9CPR4 Papss1-201ENSMUST00000029666 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Rpl17Q9CPR4 Enah-201ENSMUST00000078719 2889 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Rpl17Q9CPR4 Zfp341-202ENSMUST00000109702 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.24□□□□□ -0.45
Rpl17Q9CPR4 Zbtb1-201ENSMUST00000042779 12190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Rpl17Q9CPR4 Aldoc-202ENSMUST00000102478 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Rpl17Q9CPR4 Hist1h3d-201ENSMUST00000105105 1249 ntAPPRIS P1 BASIC12.24□□□□□ -0.45
Rpl17Q9CPR4 Gm5150-201ENSMUST00000108347 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Rpl17Q9CPR4 Kifc1-201ENSMUST00000114361 2260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.24□□□□□ -0.45
Rpl17Q9CPR4 Gm4993-201ENSMUST00000118719 1174 ntBASIC12.24□□□□□ -0.45
Rpl17Q9CPR4 Vps25-205ENSMUST00000121331 790 ntTSL 2 BASIC12.24□□□□□ -0.45
Rpl17Q9CPR4 Gm9089-201ENSMUST00000122027 526 ntBASIC12.24□□□□□ -0.45
Rpl17Q9CPR4 Gm28037-201ENSMUST00000122365 611 ntTSL 3 BASIC12.24□□□□□ -0.45
Rpl17Q9CPR4 n-R5s84-201ENSMUST00000122591 109 ntBASIC12.24□□□□□ -0.45
Rpl17Q9CPR4 A830082K12Rik-201ENSMUST00000123998 2203 ntTSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Rpl17Q9CPR4 Acin1-208ENSMUST00000126166 2369 ntTSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Rpl17Q9CPR4 Gm16001-201ENSMUST00000127989 875 ntTSL 3 BASIC12.24□□□□□ -0.45
Rpl17Q9CPR4 Trim26-205ENSMUST00000130367 3187 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.24□□□□□ -0.45
Rpl17Q9CPR4 4931415C17Rik-202ENSMUST00000131064 2255 ntTSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Rpl17Q9CPR4 Acin1-216ENSMUST00000141453 2381 ntTSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Rpl17Q9CPR4 Gm11494-201ENSMUST00000142279 1738 ntTSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Rpl17Q9CPR4 Gzmc-201ENSMUST00000015585 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Rpl17Q9CPR4 Gm7593-201ENSMUST00000187246 644 ntBASIC12.24□□□□□ -0.45
Rpl17Q9CPR4 Gm19166-201ENSMUST00000196041 1063 ntBASIC12.24□□□□□ -0.45
Rpl17Q9CPR4 Gm42980-201ENSMUST00000200582 1028 ntTSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Rpl17Q9CPR4 Aurkc-203ENSMUST00000207711 1320 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Rpl17Q9CPR4 Tex10-201ENSMUST00000030030 3102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Rpl17Q9CPR4 Tmem269-201ENSMUST00000030394 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Rpl17Q9CPR4 Jak3-201ENSMUST00000051995 4019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Rpl17Q9CPR4 Cr1l-201ENSMUST00000075451 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Rpl17Q9CPR4 Krtap6-2-201ENSMUST00000082065 786 ntAPPRIS P1 BASIC12.24□□□□□ -0.45
Rpl17Q9CPR4 Col14a1-202ENSMUST00000110217 6457 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.24□□□□□ -0.45
Rpl17Q9CPR4 Myo18a-220ENSMUST00000164334 5381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.24□□□□□ -0.45
Rpl17Q9CPR4 Sorcs1-203ENSMUST00000164039 7241 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.24□□□□□ -0.45
Rpl17Q9CPR4 Syvn1-207ENSMUST00000156550 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.24□□□□□ -0.45
Rpl17Q9CPR4 Gjb2-201ENSMUST00000055698 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Rpl17Q9CPR4 Epha5-202ENSMUST00000113398 4830 ntTSL 5 BASIC12.23□□□□□ -0.45
Rpl17Q9CPR4 Cln3-201ENSMUST00000032962 2386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Rpl17Q9CPR4 Slc29a1-204ENSMUST00000163492 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Rpl17Q9CPR4 Plcg1-202ENSMUST00000103115 4435 ntTSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Rpl17Q9CPR4 Ephb3-201ENSMUST00000006112 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Rpl17Q9CPR4 Plekhn1-203ENSMUST00000217885 1982 ntTSL 5 BASIC12.23□□□□□ -0.45
Rpl17Q9CPR4 Zfp593-201ENSMUST00000030644 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Rpl17Q9CPR4 Nt5dc2-206ENSMUST00000227794 1858 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.23□□□□□ -0.45
Rpl17Q9CPR4 Vwf-201ENSMUST00000100941 1807 ntTSL 5 BASIC12.23□□□□□ -0.45
Rpl17Q9CPR4 Uba6-202ENSMUST00000113373 3504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Rpl17Q9CPR4 Aifm2-203ENSMUST00000099706 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Rpl17Q9CPR4 Kcnk2-206ENSMUST00000193319 1548 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Rpl17Q9CPR4 Asap1-203ENSMUST00000110115 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.23□□□□□ -0.45
Rpl17Q9CPR4 Tjp3-205ENSMUST00000219479 2901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Rpl17Q9CPR4 Ttc29-202ENSMUST00000109902 1416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.23□□□□□ -0.45
Rpl17Q9CPR4 Ptcd3-201ENSMUST00000082094 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Rpl17Q9CPR4 Clic3-201ENSMUST00000102918 791 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC12.23□□□□□ -0.45
Rpl17Q9CPR4 1110028F11Rik-201ENSMUST00000137077 837 ntTSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Rpl17Q9CPR4 Nop16-202ENSMUST00000148222 790 ntTSL 5 BASIC12.23□□□□□ -0.45
Rpl17Q9CPR4 Gm15744-201ENSMUST00000161734 213 ntBASIC12.23□□□□□ -0.45
Rpl17Q9CPR4 Fam166b-206ENSMUST00000171134 1198 ntTSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Rpl17Q9CPR4 Rn7s6-201ENSMUST00000175005 291 ntBASIC12.23□□□□□ -0.45
Rpl17Q9CPR4 Dpf3-206ENSMUST00000177959 1298 ntTSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Rpl17Q9CPR4 A430105J06Rik-201ENSMUST00000180869 1275 ntTSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Rpl17Q9CPR4 Gm3671-201ENSMUST00000182463 1007 ntBASIC12.23□□□□□ -0.45
Rpl17Q9CPR4 Gm5982-201ENSMUST00000196234 512 ntBASIC12.23□□□□□ -0.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 77.3 ms