Protein–RNA interactions for Protein: Q99PN3

Trim26, Tripartite motif-containing protein 26, mousemouse

Predictions only

Length 545 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim26Q99PN3 Gm14025-201ENSMUST00000145798 4242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Trim26Q99PN3 Nemp1-203ENSMUST00000118728 2362 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Trim26Q99PN3 Klhl6-201ENSMUST00000058839 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Trim26Q99PN3 Prag1-201ENSMUST00000110492 4780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Trim26Q99PN3 Rims4-201ENSMUST00000044734 4962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Trim26Q99PN3 Dcaf11-202ENSMUST00000117236 2538 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Trim26Q99PN3 Mfsd4b5-202ENSMUST00000073618 2978 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Trim26Q99PN3 Ngef-202ENSMUST00000068681 3109 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Trim26Q99PN3 Lsg1-201ENSMUST00000117363 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Trim26Q99PN3 Arhgef9-206ENSMUST00000113884 3784 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Trim26Q99PN3 Src-201ENSMUST00000029175 3906 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Trim26Q99PN3 Tanc1-201ENSMUST00000037526 7873 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Trim26Q99PN3 Patl1-201ENSMUST00000061618 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Trim26Q99PN3 Gm5936-201ENSMUST00000114116 2857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Trim26Q99PN3 Gm5640-201ENSMUST00000114119 2861 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Trim26Q99PN3 Cdk15-201ENSMUST00000114248 1477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Trim26Q99PN3 Mamld1-202ENSMUST00000114629 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Trim26Q99PN3 3110062M04Rik-203ENSMUST00000115007 3326 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Trim26Q99PN3 Gm11511-201ENSMUST00000118146 540 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Trim26Q99PN3 Atp8a2-202ENSMUST00000131670 1725 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Trim26Q99PN3 Pdzd7-203ENSMUST00000169459 3903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Trim26Q99PN3 Rpl19-201ENSMUST00000017548 751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Trim26Q99PN3 Pbx1-205ENSMUST00000176540 6876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Trim26Q99PN3 Gm21859-201ENSMUST00000178424 1045 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Trim26Q99PN3 Foxl2os-201ENSMUST00000181706 3095 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Trim26Q99PN3 1110008E08Rik-202ENSMUST00000183621 723 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Trim26Q99PN3 Myo1b-201ENSMUST00000018561 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Trim26Q99PN3 Gm34728-201ENSMUST00000201510 414 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Trim26Q99PN3 Zfp512-208ENSMUST00000202244 3045 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Trim26Q99PN3 Gm43371-201ENSMUST00000202838 1031 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Trim26Q99PN3 Gm45833-201ENSMUST00000211931 2730 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Trim26Q99PN3 AC163354.1-205ENSMUST00000223262 1511 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Trim26Q99PN3 Pebp4-201ENSMUST00000022678 1079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Trim26Q99PN3 Cul5-201ENSMUST00000034529 3585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Trim26Q99PN3 Cd207-201ENSMUST00000037882 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Trim26Q99PN3 Phpt1-201ENSMUST00000039156 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Trim26Q99PN3 Olfr450-201ENSMUST00000067503 933 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Trim26Q99PN3 Nr1i3-202ENSMUST00000075469 1305 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Trim26Q99PN3 DXBay18-201ENSMUST00000080324 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Trim26Q99PN3 Gm14685-201ENSMUST00000088459 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Trim26Q99PN3 Gm6994-201ENSMUST00000088880 1163 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Trim26Q99PN3 Rpl19-202ENSMUST00000092425 737 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Trim26Q99PN3 Zfp932-201ENSMUST00000099484 451 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Trim26Q99PN3 Fhdc1-202ENSMUST00000107689 5918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Trim26Q99PN3 Als2cl-206ENSMUST00000155014 5150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Trim26Q99PN3 Dna2-203ENSMUST00000131422 4122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Trim26Q99PN3 Grin1-206ENSMUST00000114314 3882 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Trim26Q99PN3 Pdxk-201ENSMUST00000041616 5124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Trim26Q99PN3 Sstr2-203ENSMUST00000146390 2143 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Trim26Q99PN3 Dip2a-201ENSMUST00000036033 6322 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Trim26Q99PN3 Nfic-203ENSMUST00000105321 6237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Trim26Q99PN3 Lrp12-201ENSMUST00000022916 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Trim26Q99PN3 Ephb2-203ENSMUST00000105846 3653 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Trim26Q99PN3 Serpina1b-203ENSMUST00000186166 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Trim26Q99PN3 Gm43267-201ENSMUST00000199664 1796 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Trim26Q99PN3 Tdrd9-201ENSMUST00000079009 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Trim26Q99PN3 Eps15l1-201ENSMUST00000163643 3129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Trim26Q99PN3 AL670603.1-201ENSMUST00000216692 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Trim26Q99PN3 Olfr658-202ENSMUST00000210641 2915 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Trim26Q99PN3 Jpt2-201ENSMUST00000024981 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Trim26Q99PN3 Olfr658-201ENSMUST00000089296 2912 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Trim26Q99PN3 Cyp2c53-ps-203ENSMUST00000176493 1443 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Trim26Q99PN3 Ffar1-201ENSMUST00000052700 4175 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Trim26Q99PN3 Pitpnb-201ENSMUST00000086635 2761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Trim26Q99PN3 Ccl1-202ENSMUST00000108189 514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Trim26Q99PN3 Nmb-202ENSMUST00000119428 678 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Trim26Q99PN3 Zdhhc4-208ENSMUST00000161915 1216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Trim26Q99PN3 Rpl41-203ENSMUST00000176683 437 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Trim26Q99PN3 Gm29233-201ENSMUST00000190311 281 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Trim26Q99PN3 Ccl1-201ENSMUST00000021043 611 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Trim26Q99PN3 Gm9797-202ENSMUST00000218003 294 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Trim26Q99PN3 Prr15l-202ENSMUST00000062172 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Trim26Q99PN3 Mia-201ENSMUST00000071986 566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Trim26Q99PN3 Rpl18-201ENSMUST00000072503 679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Trim26Q99PN3 Lrmda-201ENSMUST00000075639 908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Trim26Q99PN3 Ralgps2-211ENSMUST00000190648 2498 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Trim26Q99PN3 Camta2-205ENSMUST00000119120 4460 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Trim26Q99PN3 Taf1b-201ENSMUST00000075954 2209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Trim26Q99PN3 Vdr-201ENSMUST00000023119 4370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Trim26Q99PN3 Speg-201ENSMUST00000087122 10801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Trim26Q99PN3 Erbin-201ENSMUST00000022222 6369 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Trim26Q99PN3 Cyth3-201ENSMUST00000110727 2068 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Trim26Q99PN3 Ndrg2-201ENSMUST00000004673 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Trim26Q99PN3 Rgs11-201ENSMUST00000025020 2006 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Trim26Q99PN3 Adgrg5-201ENSMUST00000074570 2802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Trim26Q99PN3 Maged2-202ENSMUST00000112697 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Trim26Q99PN3 Zfp112-204ENSMUST00000215113 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Trim26Q99PN3 Rnf123-218ENSMUST00000178267 4309 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Trim26Q99PN3 Trim55-201ENSMUST00000029139 2595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Trim26Q99PN3 Sema3f-201ENSMUST00000080560 3395 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Trim26Q99PN3 Dach2-201ENSMUST00000067219 2520 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Trim26Q99PN3 1700110I01Rik-201ENSMUST00000112775 1671 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Trim26Q99PN3 Fam118b-202ENSMUST00000063782 1662 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Trim26Q99PN3 H2-M2-201ENSMUST00000016427 1550 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Trim26Q99PN3 Phkg2-201ENSMUST00000033086 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Trim26Q99PN3 Gm44086-201ENSMUST00000203251 2349 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Trim26Q99PN3 1700030J22Rik-201ENSMUST00000070577 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Trim26Q99PN3 Gm7537-201ENSMUST00000221660 1414 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Trim26Q99PN3 Madd-211ENSMUST00000111373 5641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Trim26Q99PN3 Robo3-201ENSMUST00000034643 4712 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.3 ms