Protein–RNA interactions for Protein: Q99P91

Gpnmb, Transmembrane glycoprotein NMB, mousemouse

Predictions only

Length 574 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GpnmbQ99P91 Pkp1-201ENSMUST00000027667 4669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
GpnmbQ99P91 Gm15541-201ENSMUST00000147449 2713 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
GpnmbQ99P91 Klhl8-202ENSMUST00000112811 2577 ntTSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.66
GpnmbQ99P91 Slx4ip-201ENSMUST00000028737 2556 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
GpnmbQ99P91 Rasgef1b-203ENSMUST00000146396 3339 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
GpnmbQ99P91 Gtf2i-203ENSMUST00000111261 4381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
GpnmbQ99P91 Sfxn3-201ENSMUST00000062213 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
GpnmbQ99P91 Cflar-202ENSMUST00000097722 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
GpnmbQ99P91 Gm4755-201ENSMUST00000181803 2647 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
GpnmbQ99P91 Gm9072-201ENSMUST00000218390 1514 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
GpnmbQ99P91 Gm36855-203ENSMUST00000216660 1406 ntTSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
GpnmbQ99P91 Lrrc3-201ENSMUST00000057608 4296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
GpnmbQ99P91 Dnajc16-201ENSMUST00000038014 5969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
GpnmbQ99P91 Kpna1-201ENSMUST00000004054 5039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
GpnmbQ99P91 Gm15987-201ENSMUST00000141700 2231 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
GpnmbQ99P91 Aurkc-203ENSMUST00000207711 1320 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
GpnmbQ99P91 Brap-202ENSMUST00000111765 3861 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
GpnmbQ99P91 Timm22-202ENSMUST00000120699 746 ntTSL 3 BASIC10.95□□□□□ -0.66
GpnmbQ99P91 Gm11354-201ENSMUST00000121974 422 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
GpnmbQ99P91 Gm12984-201ENSMUST00000145711 273 ntTSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
GpnmbQ99P91 D630008O14Rik-202ENSMUST00000149909 1043 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
GpnmbQ99P91 BC016548-202ENSMUST00000153797 805 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
GpnmbQ99P91 Gm15523-201ENSMUST00000160463 439 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
GpnmbQ99P91 Cldn16-202ENSMUST00000161053 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
GpnmbQ99P91 Rpl41-203ENSMUST00000176683 437 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.95□□□□□ -0.66
GpnmbQ99P91 Dpf3-206ENSMUST00000177959 1298 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
GpnmbQ99P91 Ighv1-48-201ENSMUST00000191795 294 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
GpnmbQ99P91 Gm2965-201ENSMUST00000198365 343 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
GpnmbQ99P91 C530044C16Rik-202ENSMUST00000205217 1239 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
GpnmbQ99P91 Gm35713-201ENSMUST00000210516 199 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
GpnmbQ99P91 AC027700.1-201ENSMUST00000213965 370 ntTSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
GpnmbQ99P91 Mmachc-201ENSMUST00000030453 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
GpnmbQ99P91 Gm6685-201ENSMUST00000042595 764 ntAPPRIS P1 BASIC10.95□□□□□ -0.66
GpnmbQ99P91 Commd4-201ENSMUST00000065358 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
GpnmbQ99P91 Cmbl-201ENSMUST00000070918 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
GpnmbQ99P91 Aldh1a7-201ENSMUST00000025656 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
GpnmbQ99P91 Hcls1-201ENSMUST00000023531 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
GpnmbQ99P91 Armcx3-202ENSMUST00000086880 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.95□□□□□ -0.66
GpnmbQ99P91 Dram1-201ENSMUST00000020249 2807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
GpnmbQ99P91 1110051M20Rik-203ENSMUST00000102594 1977 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
GpnmbQ99P91 Mylip-202ENSMUST00000222178 1954 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
GpnmbQ99P91 Slc39a3-205ENSMUST00000168076 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
GpnmbQ99P91 Grm7-202ENSMUST00000172951 4197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
GpnmbQ99P91 Arhgap35-202ENSMUST00000171937 6251 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
GpnmbQ99P91 Atp1a2-201ENSMUST00000085913 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
GpnmbQ99P91 Plod3-201ENSMUST00000004968 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
GpnmbQ99P91 Hmgcs2-202ENSMUST00000120541 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
GpnmbQ99P91 Inip-201ENSMUST00000095063 3237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
GpnmbQ99P91 Aldh3a2-202ENSMUST00000074127 3091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
GpnmbQ99P91 Trf-203ENSMUST00000112645 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
GpnmbQ99P91 Gm44086-201ENSMUST00000203251 2349 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
GpnmbQ99P91 Adtrp-202ENSMUST00000121404 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
GpnmbQ99P91 Gm39822-201ENSMUST00000212253 2284 ntTSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
GpnmbQ99P91 Akt2-201ENSMUST00000051356 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
GpnmbQ99P91 Fn1-216ENSMUST00000189821 7410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
GpnmbQ99P91 Mgmt-201ENSMUST00000081510 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
GpnmbQ99P91 Agtrap-201ENSMUST00000030865 3996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
GpnmbQ99P91 Fam83h-201ENSMUST00000060807 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
GpnmbQ99P91 Gm10767-202ENSMUST00000168767 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
GpnmbQ99P91 Olfr482-202ENSMUST00000217304 2612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
GpnmbQ99P91 Alg14-201ENSMUST00000039442 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
GpnmbQ99P91 Pipox-201ENSMUST00000017597 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
GpnmbQ99P91 Gm29050-201ENSMUST00000190732 2528 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
GpnmbQ99P91 Bckdhb-205ENSMUST00000190166 1398 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
GpnmbQ99P91 Tmem62-202ENSMUST00000110686 2417 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
GpnmbQ99P91 Cfap161-201ENSMUST00000011298 1335 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
GpnmbQ99P91 Sorcs1-201ENSMUST00000072685 4396 ntTSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
GpnmbQ99P91 Vbp1-202ENSMUST00000114070 632 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
GpnmbQ99P91 Gm7541-201ENSMUST00000118361 535 ntBASIC10.94□□□□□ -0.66
GpnmbQ99P91 Gm28686-201ENSMUST00000187404 609 ntBASIC10.94□□□□□ -0.66
GpnmbQ99P91 Gm9645-201ENSMUST00000197131 792 ntBASIC10.94□□□□□ -0.66
GpnmbQ99P91 6430531B16Rik-204ENSMUST00000209335 898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
GpnmbQ99P91 Gm6722-201ENSMUST00000221586 390 ntBASIC10.94□□□□□ -0.66
GpnmbQ99P91 Ggps1-204ENSMUST00000221713 667 ntTSL 3 BASIC10.94□□□□□ -0.66
GpnmbQ99P91 AC166344.1-201ENSMUST00000223745 674 ntBASIC10.94□□□□□ -0.66
GpnmbQ99P91 Arhgef33-207ENSMUST00000224966 490 ntBASIC10.94□□□□□ -0.66
GpnmbQ99P91 Eny2-204ENSMUST00000226827 558 ntAPPRIS P1 BASIC10.94□□□□□ -0.66
GpnmbQ99P91 Phxr2-201ENSMUST00000060761 1159 ntAPPRIS P1 BASIC10.94□□□□□ -0.66
GpnmbQ99P91 Rpl15-201ENSMUST00000079419 883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.94□□□□□ -0.66
GpnmbQ99P91 Taar7e-201ENSMUST00000092656 1077 ntAPPRIS P1 BASIC10.94□□□□□ -0.66
GpnmbQ99P91 Dgcr8-201ENSMUST00000009321 4320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
GpnmbQ99P91 Gm28719-201ENSMUST00000187779 1757 ntBASIC10.94□□□□□ -0.66
GpnmbQ99P91 Psmc2-201ENSMUST00000030769 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
GpnmbQ99P91 Dmp1-201ENSMUST00000066708 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
GpnmbQ99P91 Tmeff2-202ENSMUST00000114565 2718 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
GpnmbQ99P91 Cyp2s1-201ENSMUST00000043314 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
GpnmbQ99P91 Slc6a21-201ENSMUST00000085364 1732 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
GpnmbQ99P91 Setdb1-201ENSMUST00000015841 4658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
GpnmbQ99P91 Atg2b-201ENSMUST00000041055 7546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
GpnmbQ99P91 Phykpl-206ENSMUST00000167797 3116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
GpnmbQ99P91 Pygo1-201ENSMUST00000038489 7916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
GpnmbQ99P91 Il2rg-201ENSMUST00000033664 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
GpnmbQ99P91 Prrxl1-201ENSMUST00000068938 1610 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
GpnmbQ99P91 Slc44a2-201ENSMUST00000034697 3456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
GpnmbQ99P91 Tbcd-201ENSMUST00000103013 3906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
GpnmbQ99P91 Golga4-201ENSMUST00000084820 7583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
GpnmbQ99P91 Slc37a1-202ENSMUST00000171233 2929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
GpnmbQ99P91 Ctsc-201ENSMUST00000032779 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
GpnmbQ99P91 Tspan32-201ENSMUST00000009396 1582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
GpnmbQ99P91 Cmklr1-201ENSMUST00000047936 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 127.7 ms