Protein–RNA interactions for Protein: Q99NF3

Cep41, Centrosomal protein of 41 kDa, mousemouse

Predictions only

Length 373 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cep41Q99NF3 Rita1-207ENSMUST00000177800 1668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Cep41Q99NF3 Il2rg-201ENSMUST00000033664 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Cep41Q99NF3 D130051D11Rik-201ENSMUST00000189171 6188 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Cep41Q99NF3 Gtf2ird1-202ENSMUST00000074114 3330 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Cep41Q99NF3 Mindy1-202ENSMUST00000107187 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Cep41Q99NF3 Gm37580-201ENSMUST00000192408 2800 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Cep41Q99NF3 Ncor2-202ENSMUST00000086083 8575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Cep41Q99NF3 Rgs6-209ENSMUST00000186848 1472 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Cep41Q99NF3 Tnfaip8l3-201ENSMUST00000098760 4403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Cep41Q99NF3 Rpap2-204ENSMUST00000112654 2914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Cep41Q99NF3 Nlrx1-202ENSMUST00000168499 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Cep41Q99NF3 Stx5a-213ENSMUST00000176381 2251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Cep41Q99NF3 Tmem25-201ENSMUST00000002100 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Cep41Q99NF3 Sp140-201ENSMUST00000080204 2417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Cep41Q99NF3 4933406P04Rik-201ENSMUST00000092680 1789 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Cep41Q99NF3 Chst4-201ENSMUST00000109222 1942 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Cep41Q99NF3 Fthl17d-201ENSMUST00000105004 856 ntAPPRIS P1 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Cep41Q99NF3 Fam166b-203ENSMUST00000107929 865 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Cep41Q99NF3 Pla2g1b-202ENSMUST00000112071 361 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Cep41Q99NF3 Gm16481-201ENSMUST00000119074 1227 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Cep41Q99NF3 Gm12286-201ENSMUST00000119246 1002 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Cep41Q99NF3 Zfp629-204ENSMUST00000128731 823 ntTSL 3 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Cep41Q99NF3 Gm14064-201ENSMUST00000134833 727 ntTSL 3 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Cep41Q99NF3 4732440D04Rik-202ENSMUST00000159618 413 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Cep41Q99NF3 Gm3625-201ENSMUST00000170816 102 ntAPPRIS P1 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Cep41Q99NF3 Nat8f7-202ENSMUST00000179613 686 ntAPPRIS P1 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Cep41Q99NF3 Gm9022-201ENSMUST00000182482 992 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Cep41Q99NF3 Ip6k2-202ENSMUST00000192028 1199 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Cep41Q99NF3 Vdac1-201ENSMUST00000020673 891 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Cep41Q99NF3 Abracl-204ENSMUST00000220110 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Cep41Q99NF3 Spata24-201ENSMUST00000025209 701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Cep41Q99NF3 Pex11b-201ENSMUST00000048766 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Cep41Q99NF3 Gm9996-201ENSMUST00000070359 913 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Cep41Q99NF3 Gm17080-201ENSMUST00000087588 811 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Cep41Q99NF3 Spata24-202ENSMUST00000096573 709 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Cep41Q99NF3 Slc38a3-202ENSMUST00000167868 3151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Cep41Q99NF3 Gpr173-201ENSMUST00000070316 4855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Cep41Q99NF3 Gm10829-201ENSMUST00000202084 2988 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Cep41Q99NF3 Usp2-201ENSMUST00000034508 3867 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Cep41Q99NF3 Rnf123-218ENSMUST00000178267 4309 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Cep41Q99NF3 Lhx9-205ENSMUST00000112030 4633 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Cep41Q99NF3 Spice1-201ENSMUST00000050897 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Cep41Q99NF3 Gm45496-201ENSMUST00000209918 2917 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Cep41Q99NF3 Olfr1419-202ENSMUST00000213954 2918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Cep41Q99NF3 Gm45342-201ENSMUST00000210903 1363 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Cep41Q99NF3 Pfkfb3-204ENSMUST00000114844 2107 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Cep41Q99NF3 Myocd-201ENSMUST00000101042 2585 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Cep41Q99NF3 Gm26599-201ENSMUST00000180590 3189 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Cep41Q99NF3 Rcor3-202ENSMUST00000110849 3791 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Cep41Q99NF3 Tpx2-206ENSMUST00000164120 4365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Cep41Q99NF3 Pdcd11-201ENSMUST00000072141 6041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Cep41Q99NF3 A1cf-202ENSMUST00000224304 2968 ntAPPRIS ALT1 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Cep41Q99NF3 Snx29-203ENSMUST00000122168 2096 ntTSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Cep41Q99NF3 Fnbp1-202ENSMUST00000075326 1761 ntTSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Cep41Q99NF3 Aire-202ENSMUST00000105395 1630 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Cep41Q99NF3 Gm13142-201ENSMUST00000117213 1453 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Cep41Q99NF3 Hectd4-201ENSMUST00000042614 15482 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Cep41Q99NF3 Akap10-203ENSMUST00000108710 3394 ntTSL 2 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Cep41Q99NF3 Zfp93-201ENSMUST00000032696 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Cep41Q99NF3 Eya1-209ENSMUST00000190337 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Cep41Q99NF3 Ica1-204ENSMUST00000115520 1876 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Cep41Q99NF3 Pla2g16-202ENSMUST00000136465 3048 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Cep41Q99NF3 Med8-204ENSMUST00000106384 1743 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Cep41Q99NF3 Abcc10-204ENSMUST00000167360 4866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Cep41Q99NF3 Styxl1-201ENSMUST00000053906 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Cep41Q99NF3 Dctn1-205ENSMUST00000113919 4292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Cep41Q99NF3 Plpbp-205ENSMUST00000209856 3954 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Cep41Q99NF3 Gm24934-201ENSMUST00000103764 111 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Cep41Q99NF3 Gm23200-201ENSMUST00000104379 132 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Cep41Q99NF3 Cdk2ap1-204ENSMUST00000111474 1286 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Cep41Q99NF3 Mettl1-202ENSMUST00000120542 1044 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Cep41Q99NF3 Rtbdn-203ENSMUST00000121880 1223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Cep41Q99NF3 Gm12690-201ENSMUST00000132108 354 ntTSL 3 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Cep41Q99NF3 4930483J18Rik-202ENSMUST00000138715 1093 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Cep41Q99NF3 Gm22902-201ENSMUST00000158488 302 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Cep41Q99NF3 Magohb-205ENSMUST00000173837 897 ntTSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Cep41Q99NF3 Gm25732-201ENSMUST00000175168 60 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Cep41Q99NF3 Pmvk-203ENSMUST00000184515 1156 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Cep41Q99NF3 Gm18304-201ENSMUST00000189162 546 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Cep41Q99NF3 Gm43378-201ENSMUST00000199336 582 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Cep41Q99NF3 Gm26953-204ENSMUST00000212526 553 ntTSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Cep41Q99NF3 AC153937.1-201ENSMUST00000218734 412 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Cep41Q99NF3 AC163667.3-201ENSMUST00000225774 222 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Cep41Q99NF3 Rps15-202ENSMUST00000068408 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Cep41Q99NF3 Ccdc28a-202ENSMUST00000080860 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Cep41Q99NF3 Spaca4-201ENSMUST00000094424 707 ntAPPRIS P1 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Cep41Q99NF3 Nsd3-208ENSMUST00000146919 3652 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Cep41Q99NF3 Arhgap1-202ENSMUST00000111329 3201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Cep41Q99NF3 Jak3-202ENSMUST00000110012 3774 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Cep41Q99NF3 Sertm1-201ENSMUST00000070342 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Cep41Q99NF3 Pip5k1b-202ENSMUST00000112673 2387 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Cep41Q99NF3 Pip5k1a-206ENSMUST00000107236 3618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Cep41Q99NF3 Ubap1-201ENSMUST00000072866 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Cep41Q99NF3 Cnpy2-202ENSMUST00000219037 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Cep41Q99NF3 Tshz3-201ENSMUST00000021641 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Cep41Q99NF3 Pigh-203ENSMUST00000217998 2868 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Cep41Q99NF3 Zfp710-202ENSMUST00000164056 5871 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Cep41Q99NF3 Cald1-205ENSMUST00000115027 4777 ntTSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Cep41Q99NF3 Cdc7-204ENSMUST00000118261 3129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Cep41Q99NF3 Eif5-212ENSMUST00000222375 3547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 63.5 ms