Protein–RNA interactions for Protein: Q99NE5

Rims1, Regulating synaptic membrane exocytosis protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,463 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rims1Q99NE5 Gm6390-201ENSMUST00000215034 589 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Rims1Q99NE5 AI463170-202ENSMUST00000218453 558 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rims1Q99NE5 Myf6-201ENSMUST00000044210 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rims1Q99NE5 Olfr538-201ENSMUST00000084457 933 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rims1Q99NE5 Lysmd1-201ENSMUST00000066386 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rims1Q99NE5 C1qtnf6-201ENSMUST00000023075 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rims1Q99NE5 Zfp85os-202ENSMUST00000143812 1784 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rims1Q99NE5 Trpv4-205ENSMUST00000112225 3226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rims1Q99NE5 Tsc22d2-201ENSMUST00000099090 9799 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rims1Q99NE5 Mamld1-202ENSMUST00000114629 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rims1Q99NE5 Ivns1abp-202ENSMUST00000097543 3337 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rims1Q99NE5 Gm6157-201ENSMUST00000199935 1897 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Rims1Q99NE5 Lin52-201ENSMUST00000137170 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rims1Q99NE5 Runx2-203ENSMUST00000113572 6463 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rims1Q99NE5 Nuak2-202ENSMUST00000082125 3107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rims1Q99NE5 Tfcp2-201ENSMUST00000009877 3250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rims1Q99NE5 Radil-201ENSMUST00000063635 3700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rims1Q99NE5 Arhgap19-204ENSMUST00000177495 1652 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rims1Q99NE5 Ypel4-201ENSMUST00000090729 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rims1Q99NE5 Marcksl1-ps4-201ENSMUST00000132531 291 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Rims1Q99NE5 Cnot7-211ENSMUST00000149992 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rims1Q99NE5 Pet100-201ENSMUST00000156380 1193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rims1Q99NE5 Nudt12-203ENSMUST00000174122 1244 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rims1Q99NE5 Bhmt-ps1-201ENSMUST00000178743 1224 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Rims1Q99NE5 Gm34379-201ENSMUST00000195036 290 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Rims1Q99NE5 Gm9353-201ENSMUST00000200472 604 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Rims1Q99NE5 Gm44216-201ENSMUST00000203942 157 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Rims1Q99NE5 D830035M03Rik-201ENSMUST00000213677 1041 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rims1Q99NE5 AC122024.3-201ENSMUST00000217719 294 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Rims1Q99NE5 Prss51-204ENSMUST00000224112 1042 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rims1Q99NE5 Tspo2-201ENSMUST00000024794 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rims1Q99NE5 4921508M14Rik-201ENSMUST00000061679 1099 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Rims1Q99NE5 Klhl12-201ENSMUST00000027725 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rims1Q99NE5 Vtn-201ENSMUST00000017488 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rims1Q99NE5 Cep170b-203ENSMUST00000179041 6565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rims1Q99NE5 Usp32-202ENSMUST00000108075 7053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rims1Q99NE5 Tnxb-202ENSMUST00000168533 9381 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rims1Q99NE5 Igtp-203ENSMUST00000168280 1832 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.14
Rims1Q99NE5 Ffar2-201ENSMUST00000053156 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rims1Q99NE5 Smg7-203ENSMUST00000111836 3928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rims1Q99NE5 Esyt1-201ENSMUST00000026427 3981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rims1Q99NE5 Gm19680-201ENSMUST00000095050 1513 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Rims1Q99NE5 Zfp108-202ENSMUST00000205982 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rims1Q99NE5 2610301B20Rik-202ENSMUST00000101504 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rims1Q99NE5 Wdr89-201ENSMUST00000062370 2979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rims1Q99NE5 Tnfrsf21-201ENSMUST00000024708 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rims1Q99NE5 Eef1d-207ENSMUST00000116440 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rims1Q99NE5 Gm14213-201ENSMUST00000119778 768 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Rims1Q99NE5 Utp23-202ENSMUST00000136129 779 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rims1Q99NE5 Gm25604-201ENSMUST00000158359 133 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Rims1Q99NE5 Fxyd5-209ENSMUST00000162087 762 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rims1Q99NE5 Gm39397-201ENSMUST00000212331 228 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rims1Q99NE5 Acy1-211ENSMUST00000216400 1030 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rims1Q99NE5 Arhgef33-210ENSMUST00000225548 456 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Rims1Q99NE5 Retnla-201ENSMUST00000023329 598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rims1Q99NE5 Vgll3-201ENSMUST00000168064 7009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rims1Q99NE5 Oxr1-204ENSMUST00000110297 4596 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rims1Q99NE5 Gm29684-201ENSMUST00000220248 1982 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rims1Q99NE5 Shank1-202ENSMUST00000107935 6649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rims1Q99NE5 Polm-202ENSMUST00000109837 2697 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rims1Q99NE5 Trim27-201ENSMUST00000021761 4204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rims1Q99NE5 Hdac7-202ENSMUST00000088402 4223 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rims1Q99NE5 Prdm9-205ENSMUST00000147532 1447 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rims1Q99NE5 Ap5s1-201ENSMUST00000089506 1432 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rims1Q99NE5 Btrc-209ENSMUST00000224478 2194 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Rims1Q99NE5 Yars-201ENSMUST00000106054 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rims1Q99NE5 Gpr85-201ENSMUST00000060442 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rims1Q99NE5 Lamc1-201ENSMUST00000027752 7622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rims1Q99NE5 Gm44106-201ENSMUST00000203153 1599 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Rims1Q99NE5 Cdip1-203ENSMUST00000118703 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rims1Q99NE5 Cyp2a22-201ENSMUST00000170227 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rims1Q99NE5 Med25-211ENSMUST00000208551 2678 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rims1Q99NE5 4930534D22Rik-201ENSMUST00000181438 2715 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rims1Q99NE5 Fgfr3-211ENSMUST00000171509 4020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rims1Q99NE5 Mroh1-202ENSMUST00000096385 5268 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rims1Q99NE5 Gatad2a-206ENSMUST00000212478 3622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rims1Q99NE5 Ppig-201ENSMUST00000040915 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rims1Q99NE5 Gm11578-201ENSMUST00000118530 459 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Rims1Q99NE5 Hyal1-203ENSMUST00000123005 843 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rims1Q99NE5 4930507D10Rik-201ENSMUST00000137411 1152 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rims1Q99NE5 Asgr1-205ENSMUST00000146411 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rims1Q99NE5 Fcer2a-206ENSMUST00000208438 930 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rims1Q99NE5 Fcer2a-208ENSMUST00000208603 930 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rims1Q99NE5 Akr1c18-201ENSMUST00000021635 1200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rims1Q99NE5 Tle1-201ENSMUST00000030095 2569 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rims1Q99NE5 Tacc1-202ENSMUST00000084512 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rims1Q99NE5 Smok4a-201ENSMUST00000074512 1455 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Rims1Q99NE5 Ccndbp1-202ENSMUST00000099488 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rims1Q99NE5 Jup-201ENSMUST00000001592 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rims1Q99NE5 Olfr223-202ENSMUST00000215626 1695 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rims1Q99NE5 Hectd2-208ENSMUST00000169036 3842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rims1Q99NE5 Dhx9-202ENSMUST00000186380 4561 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rims1Q99NE5 Plscr1-201ENSMUST00000093801 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rims1Q99NE5 Ttc30a2-201ENSMUST00000099995 2431 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rims1Q99NE5 E430018J23Rik-203ENSMUST00000165495 3324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rims1Q99NE5 Srsf10-205ENSMUST00000126641 3754 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rims1Q99NE5 Ski-202ENSMUST00000084103 5309 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rims1Q99NE5 Gm23612-201ENSMUST00000103823 110 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Rims1Q99NE5 Camk2d-206ENSMUST00000106402 4180 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rims1Q99NE5 Hint1-202ENSMUST00000117710 580 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.3 ms