Protein–RNA interactions for Protein: Q99LY2

Gdpd3, Lysophospholipase D GDPD3, mousemouse

Predictions only

Length 330 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gdpd3Q99LY2 Txn2-201ENSMUST00000005487 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Gdpd3Q99LY2 Olfr981-201ENSMUST00000059859 997 ntAPPRIS P1 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Gdpd3Q99LY2 Adm2-201ENSMUST00000066991 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Gdpd3Q99LY2 4930564D02Rik-201ENSMUST00000070584 737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Gdpd3Q99LY2 Ppp1r16b-202ENSMUST00000052927 6685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Gdpd3Q99LY2 6030458C11Rik-204ENSMUST00000228177 3156 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Gdpd3Q99LY2 Wdr31-201ENSMUST00000030087 1440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Gdpd3Q99LY2 Fam206a-201ENSMUST00000045368 4275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Gdpd3Q99LY2 9330199G10Rik-202ENSMUST00000221607 1728 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Gdpd3Q99LY2 AU022754-201ENSMUST00000180441 2976 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Gdpd3Q99LY2 Nlrx1-202ENSMUST00000168499 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Gdpd3Q99LY2 Agxt2-204ENSMUST00000110542 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Gdpd3Q99LY2 Cfap52-201ENSMUST00000021287 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Gdpd3Q99LY2 Ift22-205ENSMUST00000200157 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Gdpd3Q99LY2 C130071C03Rik-203ENSMUST00000182788 1368 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Gdpd3Q99LY2 Gm43172-201ENSMUST00000202139 2137 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Gdpd3Q99LY2 Celf4-201ENSMUST00000025117 2899 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Gdpd3Q99LY2 Grip2-201ENSMUST00000159684 3006 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Gdpd3Q99LY2 Lmna-201ENSMUST00000029699 3156 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Gdpd3Q99LY2 E2f3-201ENSMUST00000102948 5097 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Gdpd3Q99LY2 Spg20-202ENSMUST00000107971 3567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Gdpd3Q99LY2 Rabgef1-203ENSMUST00000119797 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Gdpd3Q99LY2 Slc35a4-202ENSMUST00000050476 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Gdpd3Q99LY2 Traf7-201ENSMUST00000070777 2384 ntTSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Gdpd3Q99LY2 Slc6a13-201ENSMUST00000064580 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Gdpd3Q99LY2 Snrpn-201ENSMUST00000059305 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Gdpd3Q99LY2 Bpi-201ENSMUST00000065039 1926 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Gdpd3Q99LY2 Cpa5-202ENSMUST00000115138 1778 ntTSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Gdpd3Q99LY2 Rgs6-211ENSMUST00000191107 1621 ntTSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Gdpd3Q99LY2 Add2-203ENSMUST00000203279 1454 ntTSL 2 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Gdpd3Q99LY2 8430408G22Rik-201ENSMUST00000067354 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Gdpd3Q99LY2 Kif28-202ENSMUST00000211943 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Gdpd3Q99LY2 Serpinf2-202ENSMUST00000108437 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Gdpd3Q99LY2 Kars-201ENSMUST00000034426 2008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Gdpd3Q99LY2 Pgbd5-203ENSMUST00000136892 1739 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Gdpd3Q99LY2 Gm37422-201ENSMUST00000193794 4718 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Gdpd3Q99LY2 Ablim1-211ENSMUST00000111555 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Gdpd3Q99LY2 Ywhaz-203ENSMUST00000110361 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Gdpd3Q99LY2 Arvcf-202ENSMUST00000115610 3829 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Gdpd3Q99LY2 Zar1l-201ENSMUST00000118769 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Gdpd3Q99LY2 Dctn6-203ENSMUST00000118811 934 ntTSL 3 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Gdpd3Q99LY2 Mrpl40-202ENSMUST00000119273 778 ntTSL 3 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Gdpd3Q99LY2 Gm13205-201ENSMUST00000123548 562 ntTSL 3 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Gdpd3Q99LY2 Uxt-202ENSMUST00000123836 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Gdpd3Q99LY2 Gm24749-201ENSMUST00000157838 343 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Gdpd3Q99LY2 Cmtm1-201ENSMUST00000159039 1130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Gdpd3Q99LY2 Ccdc188-201ENSMUST00000167061 747 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Gdpd3Q99LY2 Fam166b-206ENSMUST00000171134 1198 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Gdpd3Q99LY2 Adtrp-204ENSMUST00000179758 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Gdpd3Q99LY2 1110008E08Rik-202ENSMUST00000183621 723 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Gdpd3Q99LY2 Gm27239-201ENSMUST00000184638 642 ntTSL 3 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Gdpd3Q99LY2 Gm28071-201ENSMUST00000190355 478 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Gdpd3Q99LY2 Gm9723-201ENSMUST00000192100 457 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Gdpd3Q99LY2 Gm42629-201ENSMUST00000199063 1102 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Gdpd3Q99LY2 Gm2553-201ENSMUST00000215986 605 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Gdpd3Q99LY2 Tmem14a-202ENSMUST00000027065 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Gdpd3Q99LY2 Ndufaf5-201ENSMUST00000044825 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Gdpd3Q99LY2 Mrpl41-201ENSMUST00000045604 776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Gdpd3Q99LY2 Gm8385-201ENSMUST00000058999 643 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Gdpd3Q99LY2 Gm5705-201ENSMUST00000066241 711 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Gdpd3Q99LY2 Fam120b-201ENSMUST00000055352 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Gdpd3Q99LY2 Tpx2-201ENSMUST00000028969 3654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Gdpd3Q99LY2 Nrap-204ENSMUST00000166203 5079 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Gdpd3Q99LY2 Npepps-201ENSMUST00000001480 4215 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Gdpd3Q99LY2 Amotl2-211ENSMUST00000153965 4222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Gdpd3Q99LY2 Psap-201ENSMUST00000004316 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Gdpd3Q99LY2 CAAA01216754.1-201ENSMUST00000215882 1836 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Gdpd3Q99LY2 Hmgcs2-202ENSMUST00000120541 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Gdpd3Q99LY2 P4ha1-203ENSMUST00000105466 2918 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Gdpd3Q99LY2 Tiparp-201ENSMUST00000047906 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Gdpd3Q99LY2 Rbm10-207ENSMUST00000177738 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Gdpd3Q99LY2 Rbm10-201ENSMUST00000064911 2793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Gdpd3Q99LY2 Strada-202ENSMUST00000103072 1517 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Gdpd3Q99LY2 Mff-209ENSMUST00000160972 1358 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Gdpd3Q99LY2 Myo18a-224ENSMUST00000172303 6339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Gdpd3Q99LY2 Clic4-201ENSMUST00000037099 4119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Gdpd3Q99LY2 Col6a6-202ENSMUST00000098441 8781 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Gdpd3Q99LY2 Trim23-201ENSMUST00000022225 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Gdpd3Q99LY2 Arhgap1-204ENSMUST00000111331 2883 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Gdpd3Q99LY2 Tut1-201ENSMUST00000096239 2747 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Gdpd3Q99LY2 4933431E20Rik-201ENSMUST00000131345 5407 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Gdpd3Q99LY2 Mob3b-201ENSMUST00000102975 6030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Gdpd3Q99LY2 Slc7a7-201ENSMUST00000000984 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Gdpd3Q99LY2 Gm5525-201ENSMUST00000190438 1312 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Gdpd3Q99LY2 Nr1i3-202ENSMUST00000075469 1305 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Gdpd3Q99LY2 Pi16-202ENSMUST00000114701 2756 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Gdpd3Q99LY2 B430119L08Rik-201ENSMUST00000130054 1994 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Gdpd3Q99LY2 Art3-201ENSMUST00000113083 1561 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Gdpd3Q99LY2 Gm13848-202ENSMUST00000211663 1560 ntTSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Gdpd3Q99LY2 Als2-204ENSMUST00000163058 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Gdpd3Q99LY2 Slit2-216ENSMUST00000174313 7734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Gdpd3Q99LY2 Odf2l-201ENSMUST00000029920 2239 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Gdpd3Q99LY2 Alg13-202ENSMUST00000070801 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Gdpd3Q99LY2 Prkcg-201ENSMUST00000100301 3127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Gdpd3Q99LY2 Ngef-202ENSMUST00000068681 3109 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Gdpd3Q99LY2 Psd-210ENSMUST00000225323 3398 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Gdpd3Q99LY2 Tinf2-201ENSMUST00000007733 2956 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Gdpd3Q99LY2 Lck-201ENSMUST00000067240 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Gdpd3Q99LY2 Grip1-205ENSMUST00000105262 4996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Gdpd3Q99LY2 Ighv2-6-8-201ENSMUST00000103455 342 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.5 ms