Protein–RNA interactions for Protein: Q99J79

Ddb2, DNA damage-binding protein 2, mousemouse

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Length 432 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ddb2Q99J79 Bub1-201ENSMUST00000028858 3421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Ddb2Q99J79 Setx-201ENSMUST00000061578 10970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Ddb2Q99J79 Cdc20b-201ENSMUST00000109244 1620 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Ddb2Q99J79 Cyp2d34-201ENSMUST00000109515 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Ddb2Q99J79 Abi1-208ENSMUST00000139038 2899 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Ddb2Q99J79 Mthfd1l-201ENSMUST00000043735 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Ddb2Q99J79 Dcaf11-202ENSMUST00000117236 2538 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Ddb2Q99J79 Gdap2-202ENSMUST00000106997 2014 ntTSL 2 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Ddb2Q99J79 Cpa5-202ENSMUST00000115138 1778 ntTSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Ddb2Q99J79 Wdr33-201ENSMUST00000025264 6206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Ddb2Q99J79 Psap-201ENSMUST00000004316 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Ddb2Q99J79 H2-Q1-202ENSMUST00000105041 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Ddb2Q99J79 Prps1-201ENSMUST00000033809 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Ddb2Q99J79 Osgin1-201ENSMUST00000098365 1959 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Ddb2Q99J79 Tmem254b-202ENSMUST00000100806 1108 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Ddb2Q99J79 Tmem254a-201ENSMUST00000100811 1108 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Ddb2Q99J79 Pcgf2-203ENSMUST00000103149 817 ntTSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Ddb2Q99J79 Gm23596-201ENSMUST00000104304 132 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
Ddb2Q99J79 Map7-202ENSMUST00000116259 3831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Ddb2Q99J79 Mia-202ENSMUST00000121848 572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Ddb2Q99J79 Nbdy-201ENSMUST00000140575 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Ddb2Q99J79 Nbdy-202ENSMUST00000149514 775 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Ddb2Q99J79 Fam166b-206ENSMUST00000171134 1198 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Ddb2Q99J79 Trmt112-204ENSMUST00000174786 646 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Ddb2Q99J79 Gm8888-201ENSMUST00000177677 381 ntAPPRIS P1 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Ddb2Q99J79 Gm6114-201ENSMUST00000182472 968 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
Ddb2Q99J79 Zfp229-206ENSMUST00000183192 653 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Ddb2Q99J79 Gm9192-201ENSMUST00000183221 985 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
Ddb2Q99J79 Gm27530-201ENSMUST00000184096 98 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
Ddb2Q99J79 Emp3-203ENSMUST00000210297 601 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Ddb2Q99J79 1700112L15Rik-201ENSMUST00000212067 510 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
Ddb2Q99J79 Pcdhga4-201ENSMUST00000194418 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Ddb2Q99J79 Gfap-201ENSMUST00000067444 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Ddb2Q99J79 Grm5-201ENSMUST00000107263 3516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Ddb2Q99J79 Gm45902-202ENSMUST00000140494 2390 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Ddb2Q99J79 Klhl6-201ENSMUST00000058839 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Ddb2Q99J79 Nxph1-202ENSMUST00000160300 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Ddb2Q99J79 Tnfrsf13b-201ENSMUST00000010286 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Ddb2Q99J79 Gm4219-201ENSMUST00000168140 2143 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
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Ddb2Q99J79 Pcgf2-202ENSMUST00000103148 1438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.75
Ddb2Q99J79 Ptchd3-201ENSMUST00000036690 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.75
Ddb2Q99J79 Cttnbp2nl-201ENSMUST00000077548 4946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.75
Ddb2Q99J79 Mfsd14b-203ENSMUST00000155487 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.75
Ddb2Q99J79 Rab10os-203ENSMUST00000178074 4006 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.75
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Ddb2Q99J79 Mecom-202ENSMUST00000108270 5692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.75
Ddb2Q99J79 Sugp1-201ENSMUST00000011450 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.75
Ddb2Q99J79 Msh5-202ENSMUST00000097338 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.75
Ddb2Q99J79 Gfod2-201ENSMUST00000013294 4352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.75
Ddb2Q99J79 Plxdc1-201ENSMUST00000017561 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.75
Ddb2Q99J79 Tgfb2-206ENSMUST00000195201 3485 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
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Ddb2Q99J79 Ank3-205ENSMUST00000092433 5072 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
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Ddb2Q99J79 Mtap-201ENSMUST00000058030 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Ddb2Q99J79 Rtn3-202ENSMUST00000065304 5030 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
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Ddb2Q99J79 AC079680.2-201ENSMUST00000219181 1306 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Ddb2Q99J79 9030407P20Rik-201ENSMUST00000180933 2310 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
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Ddb2Q99J79 1700034G24Rik-202ENSMUST00000183186 1081 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
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Ddb2Q99J79 Mtus2-202ENSMUST00000085554 1009 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
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Ddb2Q99J79 Atp1b2-201ENSMUST00000047889 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Ddb2Q99J79 Pacsin1-201ENSMUST00000045896 4190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Ddb2Q99J79 Gm38194-201ENSMUST00000194529 2211 ntBASIC10.39□□□□□ -0.75
Ddb2Q99J79 Samd11-204ENSMUST00000218788 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Ddb2Q99J79 Syk-201ENSMUST00000055087 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Ddb2Q99J79 Scmh1-201ENSMUST00000000087 3353 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Ddb2Q99J79 Tfr2-208ENSMUST00000199054 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Ddb2Q99J79 Pag1-201ENSMUST00000108384 3729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Ddb2Q99J79 Nrde2-201ENSMUST00000021596 3718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
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Ddb2Q99J79 Gm9008-201ENSMUST00000097218 2353 ntAPPRIS P1 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Ddb2Q99J79 Gm18986-201ENSMUST00000216029 1986 ntBASIC10.39□□□□□ -0.75
Ddb2Q99J79 Becn1-205ENSMUST00000130916 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Ddb2Q99J79 Angpt4-201ENSMUST00000028955 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Ddb2Q99J79 Sppl2b-211ENSMUST00000220091 3629 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Ddb2Q99J79 Zfp689-201ENSMUST00000053392 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Ddb2Q99J79 Gipr-201ENSMUST00000094790 2856 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
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