Protein–RNA interactions for Protein: Q925N4

Cldn16, Claudin-16, mousemouse

Predictions only

Length 235 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn16Q925N4 Thy1-201ENSMUST00000114840 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.31□□□□□ -0.92
Cldn16Q925N4 Gm6203-201ENSMUST00000209575 1342 ntBASIC9.31□□□□□ -0.92
Cldn16Q925N4 Ociad1-202ENSMUST00000071081 1311 ntTSL 3 BASIC9.31□□□□□ -0.92
Cldn16Q925N4 Piezo2-202ENSMUST00000047480 10724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
Cldn16Q925N4 Sdc1-201ENSMUST00000020911 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
Cldn16Q925N4 Srgap3-202ENSMUST00000088373 8887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
Cldn16Q925N4 Zmym3-209ENSMUST00000121520 5564 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.3□□□□□ -0.92
Cldn16Q925N4 Atg9b-201ENSMUST00000059401 3902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
Cldn16Q925N4 Lrrn4-201ENSMUST00000049787 3715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
Cldn16Q925N4 4930488L21Rik-201ENSMUST00000181864 3244 ntTSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
Cldn16Q925N4 Dnmt3a-203ENSMUST00000111186 5424 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.3□□□□□ -0.92
Cldn16Q925N4 Gm11696-203ENSMUST00000188296 1793 ntTSL 3 BASIC9.3□□□□□ -0.92
Cldn16Q925N4 Gm43242-201ENSMUST00000199507 1776 ntBASIC9.3□□□□□ -0.92
Cldn16Q925N4 Nmbr-201ENSMUST00000020015 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
Cldn16Q925N4 Zfp112-204ENSMUST00000215113 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.3□□□□□ -0.92
Cldn16Q925N4 H2-T10-201ENSMUST00000166442 1481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.3□□□□□ -0.92
Cldn16Q925N4 Anks1b-224ENSMUST00000182960 3397 ntTSL 5 BASIC9.3□□□□□ -0.92
Cldn16Q925N4 Slc7a4-207ENSMUST00000172164 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
Cldn16Q925N4 Slc3a2-207ENSMUST00000206598 1393 ntTSL 2 BASIC9.3□□□□□ -0.92
Cldn16Q925N4 Poc1a-211ENSMUST00000217213 1398 ntTSL 5 BASIC9.3□□□□□ -0.92
Cldn16Q925N4 Odf2l-201ENSMUST00000029920 2239 ntTSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
Cldn16Q925N4 Myo1b-201ENSMUST00000018561 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
Cldn16Q925N4 Gm23931-201ENSMUST00000103842 109 ntBASIC9.3□□□□□ -0.92
Cldn16Q925N4 Tpd52l2-203ENSMUST00000108799 985 ntTSL 5 BASIC9.3□□□□□ -0.92
Cldn16Q925N4 Gm5187-201ENSMUST00000117317 991 ntBASIC9.3□□□□□ -0.92
Cldn16Q925N4 Cspp1-202ENSMUST00000117415 1272 ntTSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
Cldn16Q925N4 Gm11531-201ENSMUST00000117614 555 ntBASIC9.3□□□□□ -0.92
Cldn16Q925N4 Gm11425-201ENSMUST00000119608 498 ntBASIC9.3□□□□□ -0.92
Cldn16Q925N4 Gm4986-201ENSMUST00000119731 549 ntBASIC9.3□□□□□ -0.92
Cldn16Q925N4 Gm15906-201ENSMUST00000124746 323 ntTSL 5 BASIC9.3□□□□□ -0.92
Cldn16Q925N4 Rpl12-203ENSMUST00000126610 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
Cldn16Q925N4 Gm16194-204ENSMUST00000141797 475 ntTSL 3 BASIC9.3□□□□□ -0.92
Cldn16Q925N4 1700066O22Rik-203ENSMUST00000150994 961 ntTSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
Cldn16Q925N4 2210408F21Rik-210ENSMUST00000151076 539 ntTSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
Cldn16Q925N4 Pdxk-ps-202ENSMUST00000160550 876 ntBASIC9.3□□□□□ -0.92
Cldn16Q925N4 1700031P21Rik-203ENSMUST00000191400 466 ntTSL 3 BASIC9.3□□□□□ -0.92
Cldn16Q925N4 Gm38002-201ENSMUST00000193255 180 ntBASIC9.3□□□□□ -0.92
Cldn16Q925N4 Gm45892-201ENSMUST00000212627 273 ntTSL 5 BASIC9.3□□□□□ -0.92
Cldn16Q925N4 Gm7046-201ENSMUST00000221351 977 ntBASIC9.3□□□□□ -0.92
Cldn16Q925N4 AC130829.1-201ENSMUST00000221548 494 ntBASIC9.3□□□□□ -0.92
Cldn16Q925N4 CT009486.1-201ENSMUST00000222047 661 ntTSL 3 BASIC9.3□□□□□ -0.92
Cldn16Q925N4 AC154222.2-201ENSMUST00000225848 607 ntBASIC9.3□□□□□ -0.92
Cldn16Q925N4 Morn2-202ENSMUST00000227729 656 ntBASIC9.3□□□□□ -0.92
Cldn16Q925N4 4933434E20Rik-202ENSMUST00000029552 1080 ntTSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
Cldn16Q925N4 Sh3bgrl3-201ENSMUST00000030651 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
Cldn16Q925N4 Pglyrp1-201ENSMUST00000032573 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
Cldn16Q925N4 Egr2-201ENSMUST00000048289 2965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
Cldn16Q925N4 Acyp1-202ENSMUST00000065913 448 ntTSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
Cldn16Q925N4 Gm9396-201ENSMUST00000076703 567 ntBASIC9.3□□□□□ -0.92
Cldn16Q925N4 Timeless-201ENSMUST00000055539 4457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
Cldn16Q925N4 Hectd4-201ENSMUST00000042614 15482 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.3□□□□□ -0.92
Cldn16Q925N4 Fggy-201ENSMUST00000043335 1910 ntTSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
Cldn16Q925N4 Vcp-201ENSMUST00000030164 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
Cldn16Q925N4 Zfp280d-205ENSMUST00000183468 1834 ntTSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
Cldn16Q925N4 Clip1-204ENSMUST00000111564 5609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
Cldn16Q925N4 Col5a2-201ENSMUST00000086430 6625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
Cldn16Q925N4 Cxcr5-202ENSMUST00000179828 2824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.3□□□□□ -0.92
Cldn16Q925N4 Adgrg5-201ENSMUST00000074570 2802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
Cldn16Q925N4 Stim1-209ENSMUST00000211457 2183 ntTSL 5 BASIC9.3□□□□□ -0.92
Cldn16Q925N4 1500009C09Rik-201ENSMUST00000136948 1526 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC9.3□□□□□ -0.92
Cldn16Q925N4 Ppp1r18-202ENSMUST00000122899 2743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
Cldn16Q925N4 Mical1-202ENSMUST00000099934 3292 ntTSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
Cldn16Q925N4 Gm21319-201ENSMUST00000164517 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
Cldn16Q925N4 Tcn2-201ENSMUST00000020710 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.3□□□□□ -0.92
Cldn16Q925N4 Tnfaip8l3-201ENSMUST00000098760 4403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
Cldn16Q925N4 Stxbp5l-201ENSMUST00000023526 3344 ntTSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
Cldn16Q925N4 Dscaml1-201ENSMUST00000034592 6886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
Cldn16Q925N4 Arfgap2-201ENSMUST00000028691 2791 ntTSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
Cldn16Q925N4 Bdkrb2-201ENSMUST00000001652 3792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
Cldn16Q925N4 Slit2-202ENSMUST00000170109 7758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.29□□□□□ -0.92
Cldn16Q925N4 Slit2-217ENSMUST00000174421 7785 ntTSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
Cldn16Q925N4 Npr2-201ENSMUST00000030191 3660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
Cldn16Q925N4 4931406C07Rik-202ENSMUST00000178977 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
Cldn16Q925N4 Adra2b-202ENSMUST00000104934 4014 ntAPPRIS ALT2 BASIC9.29□□□□□ -0.92
Cldn16Q925N4 Myh13-201ENSMUST00000081911 5817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.29□□□□□ -0.92
Cldn16Q925N4 Adamts13-201ENSMUST00000014996 3474 ntTSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
Cldn16Q925N4 Dctn1-205ENSMUST00000113919 4292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
Cldn16Q925N4 Katnal2-207ENSMUST00000137354 1482 ntTSL 5 BASIC9.29□□□□□ -0.92
Cldn16Q925N4 Zfp41-204ENSMUST00000161785 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
Cldn16Q925N4 Fam45a-202ENSMUST00000119633 2267 ntTSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
Cldn16Q925N4 Gm34425-201ENSMUST00000216269 3079 ntTSL 5 BASIC9.29□□□□□ -0.92
Cldn16Q925N4 Gm8146-201ENSMUST00000192106 1847 ntBASIC9.29□□□□□ -0.92
Cldn16Q925N4 Pkn1-208ENSMUST00000144258 2995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
Cldn16Q925N4 Gm5441-201ENSMUST00000186454 5181 ntTSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
Cldn16Q925N4 Srrm4-201ENSMUST00000076124 7472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
Cldn16Q925N4 E030013I19Rik-201ENSMUST00000148089 2754 ntTSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
Cldn16Q925N4 Gm13124-201ENSMUST00000105748 1221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.29□□□□□ -0.92
Cldn16Q925N4 Zmynd11-203ENSMUST00000110634 3824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.29□□□□□ -0.92
Cldn16Q925N4 Il15ra-204ENSMUST00000114832 468 ntTSL 5 BASIC9.29□□□□□ -0.92
Cldn16Q925N4 Gm12164-201ENSMUST00000121695 551 ntBASIC9.29□□□□□ -0.92
Cldn16Q925N4 Bcas1os1-201ENSMUST00000133586 1239 ntTSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
Cldn16Q925N4 Gm15853-201ENSMUST00000160268 556 ntTSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
Cldn16Q925N4 Erdr1-201ENSMUST00000177591 774 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC9.29□□□□□ -0.92
Cldn16Q925N4 Gm2310-201ENSMUST00000179217 1131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.29□□□□□ -0.92
Cldn16Q925N4 Gm26956-201ENSMUST00000182176 986 ntBASIC9.29□□□□□ -0.92
Cldn16Q925N4 Hmgcll1-207ENSMUST00000183979 1136 ntTSL 5 BASIC9.29□□□□□ -0.92
Cldn16Q925N4 Gm11523-203ENSMUST00000184482 802 ntTSL 3 BASIC9.29□□□□□ -0.92
Cldn16Q925N4 Gm9230-201ENSMUST00000188228 532 ntBASIC9.29□□□□□ -0.92
Cldn16Q925N4 Gm8176-201ENSMUST00000191297 1099 ntBASIC9.29□□□□□ -0.92
Cldn16Q925N4 Gm37489-201ENSMUST00000191883 159 ntBASIC9.29□□□□□ -0.92
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.7 ms