Protein–RNA interactions for Protein: Q8VE99

Ccdc115, Coiled-coil domain-containing protein 115, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 180 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc115Q8VE99 Gm44756-201ENSMUST00000206172 1069 ntTSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Ccdc115Q8VE99 Tm2d3-207ENSMUST00000206517 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Ccdc115Q8VE99 4933436H12Rik-201ENSMUST00000207304 658 ntTSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Ccdc115Q8VE99 Stambp-ps1-201ENSMUST00000209280 1208 ntBASIC10.31□□□□□ -0.76
Ccdc115Q8VE99 AC158605.1-202ENSMUST00000217860 540 ntTSL 2 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Ccdc115Q8VE99 1700123K08Rik-201ENSMUST00000031501 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Ccdc115Q8VE99 Trem3-201ENSMUST00000048065 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Ccdc115Q8VE99 Lce3a-201ENSMUST00000067318 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Ccdc115Q8VE99 Gm37737-201ENSMUST00000195013 1638 ntBASIC10.31□□□□□ -0.76
Ccdc115Q8VE99 C730027H18Rik-201ENSMUST00000218381 2300 ntTSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Ccdc115Q8VE99 Sox8-201ENSMUST00000025003 3000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Ccdc115Q8VE99 Brd1-202ENSMUST00000109380 3259 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Ccdc115Q8VE99 Ptbp1-202ENSMUST00000095457 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Ccdc115Q8VE99 Acrbp-202ENSMUST00000088294 1883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Ccdc115Q8VE99 Wfdc8-201ENSMUST00000094351 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Ccdc115Q8VE99 Larp7-201ENSMUST00000029588 2121 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Ccdc115Q8VE99 Nfasc-203ENSMUST00000163770 3903 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Ccdc115Q8VE99 Fut4-201ENSMUST00000061498 4074 ntAPPRIS P1 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Ccdc115Q8VE99 Cacna1c-205ENSMUST00000112825 7577 ntTSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Ccdc115Q8VE99 Cyb5r3-202ENSMUST00000162178 2547 ntTSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Ccdc115Q8VE99 Cyp1a2-201ENSMUST00000034860 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Ccdc115Q8VE99 Tob2-201ENSMUST00000050467 3994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Ccdc115Q8VE99 Rbm10-201ENSMUST00000064911 2793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Ccdc115Q8VE99 Ccndbp1-201ENSMUST00000060455 1569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Ccdc115Q8VE99 Gm38115-201ENSMUST00000194317 2413 ntTSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Ccdc115Q8VE99 Mybpc3-202ENSMUST00000137942 4134 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Ccdc115Q8VE99 Gm19221-201ENSMUST00000221827 1477 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
Ccdc115Q8VE99 Slc5a8-201ENSMUST00000020255 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Ccdc115Q8VE99 5330417C22Rik-202ENSMUST00000106625 5836 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Ccdc115Q8VE99 Prkcd-205ENSMUST00000112207 2139 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Ccdc115Q8VE99 Synj2-203ENSMUST00000115784 2634 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Ccdc115Q8VE99 Gm2673-201ENSMUST00000120958 1608 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
Ccdc115Q8VE99 Rnls-202ENSMUST00000163093 1378 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Ccdc115Q8VE99 Gm44755-201ENSMUST00000207830 2102 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
Ccdc115Q8VE99 Olfr464-204ENSMUST00000216461 2112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Ccdc115Q8VE99 Cyp2d26-201ENSMUST00000006094 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Ccdc115Q8VE99 Prdm16-203ENSMUST00000097759 8544 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Ccdc115Q8VE99 Rgs12-203ENSMUST00000114280 2777 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Ccdc115Q8VE99 Mcam-202ENSMUST00000098852 2772 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Ccdc115Q8VE99 9230105E05Rik-201ENSMUST00000161291 2250 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Ccdc115Q8VE99 Gm38100-202ENSMUST00000201297 1789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Ccdc115Q8VE99 Abi1-209ENSMUST00000140164 3403 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Ccdc115Q8VE99 Toe1-202ENSMUST00000106455 1209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Ccdc115Q8VE99 Glrx2-202ENSMUST00000111957 580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Ccdc115Q8VE99 Gm12329-201ENSMUST00000120829 1007 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
Ccdc115Q8VE99 Ggnbp1-202ENSMUST00000122106 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Ccdc115Q8VE99 Sncb-202ENSMUST00000134110 722 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Ccdc115Q8VE99 Mir1982-201ENSMUST00000157368 74 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
Ccdc115Q8VE99 Gm2546-201ENSMUST00000182630 991 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
Ccdc115Q8VE99 Gm4691-202ENSMUST00000182989 885 ntTSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Ccdc115Q8VE99 Tex9-206ENSMUST00000183574 1264 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Ccdc115Q8VE99 Gm27514-201ENSMUST00000183692 110 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
Ccdc115Q8VE99 Ggt5-203ENSMUST00000189972 648 ntTSL 3 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Ccdc115Q8VE99 AC099934.4-201ENSMUST00000220745 523 ntTSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Ccdc115Q8VE99 4930447K03Rik-201ENSMUST00000222745 1033 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Ccdc115Q8VE99 AC140451.2-201ENSMUST00000228030 664 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
Ccdc115Q8VE99 Riiad1-201ENSMUST00000029785 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Ccdc115Q8VE99 Coro6-203ENSMUST00000079770 1298 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Ccdc115Q8VE99 Lhfpl5-201ENSMUST00000080780 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Ccdc115Q8VE99 Tmem256-201ENSMUST00000094065 492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Ccdc115Q8VE99 Prx-201ENSMUST00000065487 4497 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Ccdc115Q8VE99 Pip5k1b-201ENSMUST00000025800 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Ccdc115Q8VE99 Tle3-202ENSMUST00000159050 2304 ntTSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Ccdc115Q8VE99 Pcgf2-206ENSMUST00000169807 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Ccdc115Q8VE99 Olfr1420-201ENSMUST00000072784 1444 ntAPPRIS P1 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Ccdc115Q8VE99 Gid8-202ENSMUST00000078687 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Ccdc115Q8VE99 Epha5-205ENSMUST00000113403 4675 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Ccdc115Q8VE99 Hsd3b6-201ENSMUST00000029463 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Ccdc115Q8VE99 St14-201ENSMUST00000034478 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Ccdc115Q8VE99 Mad1l1-201ENSMUST00000031534 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Ccdc115Q8VE99 Ccdc162-212ENSMUST00000219054 3182 ntTSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Ccdc115Q8VE99 Cdadc1-208ENSMUST00000225839 3189 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Ccdc115Q8VE99 Adh6a-202ENSMUST00000106247 1341 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Ccdc115Q8VE99 Tshr-201ENSMUST00000021343 1339 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Ccdc115Q8VE99 Pip4k2c-201ENSMUST00000013970 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Ccdc115Q8VE99 Zfp384-205ENSMUST00000112424 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Ccdc115Q8VE99 Gm43064-201ENSMUST00000199710 3144 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Ccdc115Q8VE99 Nr5a2-205ENSMUST00000192929 1756 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Ccdc115Q8VE99 Acat1-201ENSMUST00000034547 3405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Ccdc115Q8VE99 Synpo2l-202ENSMUST00000117386 3979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Ccdc115Q8VE99 Bin2-205ENSMUST00000182814 1901 ntTSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Ccdc115Q8VE99 Myh1-201ENSMUST00000018637 5938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Ccdc115Q8VE99 Tmem134-216ENSMUST00000171743 3701 ntTSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Ccdc115Q8VE99 Lepr-203ENSMUST00000106921 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Ccdc115Q8VE99 Ppp4r1-201ENSMUST00000073104 3850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Ccdc115Q8VE99 Ackr3-201ENSMUST00000065587 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Ccdc115Q8VE99 Abhd18-203ENSMUST00000159774 4455 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Ccdc115Q8VE99 Tcp11l1-202ENSMUST00000111118 5474 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Ccdc115Q8VE99 Wars-204ENSMUST00000161154 1824 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Ccdc115Q8VE99 Gm8146-201ENSMUST00000192106 1847 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
Ccdc115Q8VE99 Tyk2-203ENSMUST00000214454 4770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Ccdc115Q8VE99 Tie1-201ENSMUST00000047421 4091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Ccdc115Q8VE99 Elavl2-204ENSMUST00000107110 3671 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Ccdc115Q8VE99 Olfr239-202ENSMUST00000213731 3690 ntTSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Ccdc115Q8VE99 Gm22018-201ENSMUST00000104357 131 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
Ccdc115Q8VE99 6030468B19Rik-201ENSMUST00000106331 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Ccdc115Q8VE99 Tpd52l2-203ENSMUST00000108799 985 ntTSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Ccdc115Q8VE99 Upk3bl-202ENSMUST00000111137 1119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Ccdc115Q8VE99 Pin4-201ENSMUST00000113627 489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Ccdc115Q8VE99 A430060F13Rik-201ENSMUST00000124176 378 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
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