Protein–RNA interactions for Protein: Q8VE97

Srsf4, Serine/arginine-rich splicing factor 4, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 489 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Srsf4Q8VE97 Gm28686-201ENSMUST00000187404 609 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Srsf4Q8VE97 Gm38228-201ENSMUST00000193169 1293 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Srsf4Q8VE97 Gm37466-201ENSMUST00000195692 652 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Srsf4Q8VE97 Gm38314-201ENSMUST00000195709 625 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Srsf4Q8VE97 Ccl1-201ENSMUST00000021043 611 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Srsf4Q8VE97 AC107638.1-201ENSMUST00000213690 1061 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Srsf4Q8VE97 CT485787.1-201ENSMUST00000225617 968 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Srsf4Q8VE97 2410015M20Rik-201ENSMUST00000052832 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Srsf4Q8VE97 S100a1-201ENSMUST00000060738 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Srsf4Q8VE97 Myoc-201ENSMUST00000028020 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Srsf4Q8VE97 Eif5-213ENSMUST00000222388 3543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Srsf4Q8VE97 Pacsin1-201ENSMUST00000045896 4190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Srsf4Q8VE97 Rasgef1b-203ENSMUST00000146396 3339 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Srsf4Q8VE97 Pdp1-202ENSMUST00000095144 2506 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Srsf4Q8VE97 Phka2-203ENSMUST00000112377 3947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Srsf4Q8VE97 Npy5r-202ENSMUST00000211920 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Srsf4Q8VE97 Lgals3bp-201ENSMUST00000043722 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Srsf4Q8VE97 1700030J22Rik-201ENSMUST00000070577 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Srsf4Q8VE97 Cdc20b-201ENSMUST00000109244 1620 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Srsf4Q8VE97 H2afv-202ENSMUST00000109737 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Srsf4Q8VE97 Matn2-201ENSMUST00000022947 3551 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Srsf4Q8VE97 Ercc2-201ENSMUST00000062831 3578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Srsf4Q8VE97 Spred2-201ENSMUST00000093298 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Srsf4Q8VE97 9530077C05Rik-201ENSMUST00000058868 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Srsf4Q8VE97 Susd5-201ENSMUST00000135338 4083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Srsf4Q8VE97 Arsg-202ENSMUST00000106696 1508 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Srsf4Q8VE97 Tmeff2-202ENSMUST00000114565 2718 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Srsf4Q8VE97 Tacc2-201ENSMUST00000033141 3940 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Srsf4Q8VE97 Neu4-201ENSMUST00000050890 4511 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Srsf4Q8VE97 Fam60a-201ENSMUST00000054080 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Srsf4Q8VE97 Gm26584-201ENSMUST00000180551 3216 ntTSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Srsf4Q8VE97 Pag1-201ENSMUST00000108384 3729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Srsf4Q8VE97 Nrde2-201ENSMUST00000021596 3718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Srsf4Q8VE97 Pou2f1-209ENSMUST00000160908 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Srsf4Q8VE97 Ttc29-202ENSMUST00000109902 1416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Srsf4Q8VE97 Abhd6-201ENSMUST00000026313 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Srsf4Q8VE97 Acacb-201ENSMUST00000031583 8482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Srsf4Q8VE97 Fnip1-201ENSMUST00000046835 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Srsf4Q8VE97 Zfp597-201ENSMUST00000090522 5668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Srsf4Q8VE97 Cast-211ENSMUST00000223206 5141 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Srsf4Q8VE97 Vezf1-201ENSMUST00000018521 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Srsf4Q8VE97 Scn5a-201ENSMUST00000065196 8287 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Srsf4Q8VE97 Rnf6-201ENSMUST00000067837 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Srsf4Q8VE97 Hk3-202ENSMUST00000123097 2896 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Srsf4Q8VE97 Gm15236-201ENSMUST00000117309 379 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Srsf4Q8VE97 Tnni2-206ENSMUST00000149529 768 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Srsf4Q8VE97 Gm13165-201ENSMUST00000152923 383 ntTSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Srsf4Q8VE97 Gm15954-201ENSMUST00000160746 466 ntTSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Srsf4Q8VE97 Tepp-204ENSMUST00000161029 968 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Srsf4Q8VE97 Trmt112-204ENSMUST00000174786 646 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Srsf4Q8VE97 Gm4310-201ENSMUST00000177847 889 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Srsf4Q8VE97 Gm26782-202ENSMUST00000181697 971 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Srsf4Q8VE97 Gm3332-201ENSMUST00000189337 928 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Srsf4Q8VE97 Gm6450-201ENSMUST00000200896 574 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Srsf4Q8VE97 Fxyd1-217ENSMUST00000206860 594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Srsf4Q8VE97 Caly-203ENSMUST00000211044 1029 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Srsf4Q8VE97 Gm18212-201ENSMUST00000211678 889 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Srsf4Q8VE97 Rpl17-ps3-201ENSMUST00000221295 556 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Srsf4Q8VE97 Gm807-202ENSMUST00000224929 408 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Srsf4Q8VE97 Rpl9-ps6-201ENSMUST00000078034 691 ntAPPRIS P1 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Srsf4Q8VE97 Aurkc-201ENSMUST00000086248 1154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Srsf4Q8VE97 Slc22a4-201ENSMUST00000020586 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Srsf4Q8VE97 Nek5-202ENSMUST00000209656 2253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Srsf4Q8VE97 Zfp263-201ENSMUST00000023176 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Srsf4Q8VE97 Gm45833-201ENSMUST00000211931 2730 ntTSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Srsf4Q8VE97 AC124397.2-201ENSMUST00000225575 2215 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Srsf4Q8VE97 Ednrb-203ENSMUST00000227824 2669 ntAPPRIS P1 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Srsf4Q8VE97 Zmynd8-220ENSMUST00000170272 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Srsf4Q8VE97 Zfp689-201ENSMUST00000053392 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Srsf4Q8VE97 Parp9-203ENSMUST00000114878 3548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Srsf4Q8VE97 Gnb1l-204ENSMUST00000115601 3507 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Srsf4Q8VE97 Gnb1l-202ENSMUST00000090086 3549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Srsf4Q8VE97 Rbm10-202ENSMUST00000082089 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Srsf4Q8VE97 Grm1-203ENSMUST00000105561 4435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Srsf4Q8VE97 Plrg1-202ENSMUST00000122128 1608 ntTSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Srsf4Q8VE97 Rad9b-201ENSMUST00000049009 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Srsf4Q8VE97 Gabre-201ENSMUST00000064780 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Srsf4Q8VE97 Epm2aip1-202ENSMUST00000135807 4245 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Srsf4Q8VE97 Tex45-203ENSMUST00000161680 1526 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Srsf4Q8VE97 Trpm1-221ENSMUST00000206706 2350 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Srsf4Q8VE97 Gaa-203ENSMUST00000106259 3633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Srsf4Q8VE97 4933424N20Rik-201ENSMUST00000200749 1463 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
Srsf4Q8VE97 Gm13990-201ENSMUST00000151391 2701 ntTSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Srsf4Q8VE97 Becn1-205ENSMUST00000130916 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Srsf4Q8VE97 Pcgf2-202ENSMUST00000103148 1438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Srsf4Q8VE97 Zfp280d-205ENSMUST00000183468 1834 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Srsf4Q8VE97 Rps6ka6-202ENSMUST00000082034 4170 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Srsf4Q8VE97 Dock6-201ENSMUST00000034728 6467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Srsf4Q8VE97 Tfdp1-201ENSMUST00000170909 1700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Srsf4Q8VE97 Olfr1349-204ENSMUST00000207820 1325 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Srsf4Q8VE97 Dync1i2-202ENSMUST00000100028 2097 ntTSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Srsf4Q8VE97 Spats2l-203ENSMUST00000164302 2088 ntTSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Srsf4Q8VE97 Gm26714-201ENSMUST00000181338 1655 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Srsf4Q8VE97 Ube2v1-202ENSMUST00000109207 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Srsf4Q8VE97 Rpl11-201ENSMUST00000102536 833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Srsf4Q8VE97 Gm23596-201ENSMUST00000104304 132 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
Srsf4Q8VE97 Camk1d-202ENSMUST00000114987 1295 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Srsf4Q8VE97 Gm14208-201ENSMUST00000119645 678 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
Srsf4Q8VE97 Got2-ps1-201ENSMUST00000121655 1293 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
Srsf4Q8VE97 Gm14017-201ENSMUST00000121934 386 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.5 ms