Protein–RNA interactions for Protein: Q8R281

Vmn1r200, Vomeronasal type-1 receptor, mousemouse

Predictions only

Length 312 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn1r200Q8R281 Gm9962-202ENSMUST00000186595 1417 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Vmn1r200Q8R281 Gm7537-201ENSMUST00000221660 1414 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
Vmn1r200Q8R281 Lexm-204ENSMUST00000189032 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Vmn1r200Q8R281 Aire-202ENSMUST00000105395 1630 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Vmn1r200Q8R281 D130043K22Rik-201ENSMUST00000006893 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Vmn1r200Q8R281 Chil1-201ENSMUST00000082060 1687 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Vmn1r200Q8R281 Ly6e-210ENSMUST00000188866 2068 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Vmn1r200Q8R281 Acsf3-201ENSMUST00000015160 2206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Vmn1r200Q8R281 Astl-201ENSMUST00000059839 2377 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Vmn1r200Q8R281 Cryz-208ENSMUST00000192462 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Vmn1r200Q8R281 Med1-202ENSMUST00000092735 2627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Vmn1r200Q8R281 Wdr89-201ENSMUST00000062370 2979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Vmn1r200Q8R281 Sertm1-201ENSMUST00000070342 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Vmn1r200Q8R281 Gm15411-201ENSMUST00000133243 3488 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Vmn1r200Q8R281 Limk2-201ENSMUST00000101638 3514 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Vmn1r200Q8R281 Hdac7-201ENSMUST00000079838 3985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Vmn1r200Q8R281 Sspn-201ENSMUST00000032383 4431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Vmn1r200Q8R281 Pcdhgb7-201ENSMUST00000194928 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Vmn1r200Q8R281 Znrf3-203ENSMUST00000172492 4926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Vmn1r200Q8R281 Klhl3-202ENSMUST00000160860 7149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Vmn1r200Q8R281 Setd5-201ENSMUST00000042889 6755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Vmn1r200Q8R281 Fgd5-202ENSMUST00000113466 5621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Vmn1r200Q8R281 Tollip-201ENSMUST00000001950 3788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Vmn1r200Q8R281 Helq-201ENSMUST00000044684 3689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Vmn1r200Q8R281 Stat5a-203ENSMUST00000107357 3605 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Vmn1r200Q8R281 Bhlha15-201ENSMUST00000060747 3494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Vmn1r200Q8R281 Kctd10-202ENSMUST00000102581 3103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Vmn1r200Q8R281 Bcar1-203ENSMUST00000212349 3116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Vmn1r200Q8R281 Steap3-202ENSMUST00000112640 2752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Vmn1r200Q8R281 Tmeff2-202ENSMUST00000114565 2718 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Vmn1r200Q8R281 Pcdh12-203ENSMUST00000194012 2702 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Vmn1r200Q8R281 Vps33b-201ENSMUST00000032749 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Vmn1r200Q8R281 Gm13093-201ENSMUST00000126212 2485 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Vmn1r200Q8R281 Tirap-203ENSMUST00000176531 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Vmn1r200Q8R281 Add2-208ENSMUST00000203786 2289 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Vmn1r200Q8R281 Gm9796-201ENSMUST00000062249 2250 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
Vmn1r200Q8R281 H3f3b-201ENSMUST00000016703 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Vmn1r200Q8R281 Prex1-202ENSMUST00000099080 5818 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Vmn1r200Q8R281 Smarcb1-202ENSMUST00000121304 1622 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Vmn1r200Q8R281 Neil1-202ENSMUST00000186410 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Vmn1r200Q8R281 Kcnk2-206ENSMUST00000193319 1548 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Vmn1r200Q8R281 Myo16-203ENSMUST00000207477 7169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Vmn1r200Q8R281 CU062626.3-201ENSMUST00000225522 1411 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
Vmn1r200Q8R281 Sik2-205ENSMUST00000176663 4107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Vmn1r200Q8R281 Herc4-208ENSMUST00000219577 3914 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Vmn1r200Q8R281 Gm14190-201ENSMUST00000105073 153 ntAPPRIS P1 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Vmn1r200Q8R281 Prr15l-203ENSMUST00000107633 930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Vmn1r200Q8R281 Gm7857-201ENSMUST00000117957 358 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
Vmn1r200Q8R281 Gm16481-201ENSMUST00000119074 1227 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
Vmn1r200Q8R281 Dmrtc1a-202ENSMUST00000119624 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Vmn1r200Q8R281 Ankrd29-202ENSMUST00000122408 850 ntTSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Vmn1r200Q8R281 Sumo3-203ENSMUST00000124024 776 ntTSL 2 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Vmn1r200Q8R281 Gm10714-201ENSMUST00000131346 874 ntTSL 2 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Vmn1r200Q8R281 Gm15852-201ENSMUST00000159701 915 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Vmn1r200Q8R281 Gm29233-201ENSMUST00000190311 281 ntTSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Vmn1r200Q8R281 Gm37312-201ENSMUST00000195753 685 ntTSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Vmn1r200Q8R281 8030455M16Rik-201ENSMUST00000213014 902 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Vmn1r200Q8R281 Mpzl2-205ENSMUST00000217097 1175 ntTSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Vmn1r200Q8R281 Gm21027-201ENSMUST00000219300 1236 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
Vmn1r200Q8R281 Tmem258-201ENSMUST00000040372 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Vmn1r200Q8R281 Agrp-201ENSMUST00000005849 661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Vmn1r200Q8R281 Prr15l-202ENSMUST00000062172 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Vmn1r200Q8R281 Olfr887-201ENSMUST00000074681 930 ntAPPRIS P1 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Vmn1r200Q8R281 5031434O11Rik-201ENSMUST00000180404 3731 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Vmn1r200Q8R281 Per1-202ENSMUST00000101004 3507 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Vmn1r200Q8R281 Anks1b-224ENSMUST00000182960 3397 ntTSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.66
Vmn1r200Q8R281 Banp-204ENSMUST00000170857 5444 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Vmn1r200Q8R281 Rab14-201ENSMUST00000028238 3081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Vmn1r200Q8R281 Dlk1-201ENSMUST00000056110 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Vmn1r200Q8R281 Arfgap2-201ENSMUST00000028691 2791 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Vmn1r200Q8R281 Plekhg2-201ENSMUST00000094644 4623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Vmn1r200Q8R281 Gm20649-201ENSMUST00000160950 2740 ntTSL 2 BASIC10.96□□□□□ -0.66
Vmn1r200Q8R281 Gm6211-201ENSMUST00000147973 4275 ntBASIC10.96□□□□□ -0.66
Vmn1r200Q8R281 Ash2l-210ENSMUST00000166078 2234 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.66
Vmn1r200Q8R281 Abcd3-201ENSMUST00000029770 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Vmn1r200Q8R281 Gpr139-201ENSMUST00000084650 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Vmn1r200Q8R281 Gm29609-201ENSMUST00000101411 3223 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.96□□□□□ -0.66
Vmn1r200Q8R281 Zfp810-201ENSMUST00000086278 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Vmn1r200Q8R281 Kcnh7-203ENSMUST00000112454 3073 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Vmn1r200Q8R281 Aldh3a2-202ENSMUST00000074127 3091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Vmn1r200Q8R281 Polm-201ENSMUST00000020767 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Vmn1r200Q8R281 Lsp1-205ENSMUST00000105968 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Vmn1r200Q8R281 Gm29480-201ENSMUST00000188589 1655 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Vmn1r200Q8R281 Gm44152-201ENSMUST00000205007 1691 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
Vmn1r200Q8R281 Pla2g15-201ENSMUST00000034377 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Vmn1r200Q8R281 L3mbtl2-208ENSMUST00000174229 2578 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Vmn1r200Q8R281 9430038I01Rik-203ENSMUST00000120340 4643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Vmn1r200Q8R281 Mapk4-202ENSMUST00000159162 3514 ntTSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Vmn1r200Q8R281 Neu4-201ENSMUST00000050890 4511 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Vmn1r200Q8R281 Dnajb12-203ENSMUST00000142819 1495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Vmn1r200Q8R281 5330413P13Rik-204ENSMUST00000210606 1464 ntTSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Vmn1r200Q8R281 Wnt5a-201ENSMUST00000063465 7010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Vmn1r200Q8R281 Hdac7-205ENSMUST00000118294 4069 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Vmn1r200Q8R281 Cops7a-202ENSMUST00000112439 1328 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Vmn1r200Q8R281 Alms1-ps1-201ENSMUST00000159498 2166 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
Vmn1r200Q8R281 Ighv5-2-201ENSMUST00000103442 350 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Vmn1r200Q8R281 Ucp3-202ENSMUST00000107059 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Vmn1r200Q8R281 Gm12589-201ENSMUST00000153767 638 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Vmn1r200Q8R281 Gm43868-201ENSMUST00000205187 2114 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
Vmn1r200Q8R281 Lysmd4-208ENSMUST00000208698 551 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 71.4 ms