Protein–RNA interactions for Protein: Q8K285

Fcho1, F-BAR domain only protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 873 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fcho1Q8K285 Lrmda-201ENSMUST00000075639 908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Fcho1Q8K285 Camkv-204ENSMUST00000194206 2827 ntTSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Fcho1Q8K285 Hk2-201ENSMUST00000000642 5513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Fcho1Q8K285 Thsd4-202ENSMUST00000098660 8796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Fcho1Q8K285 Gm12200-201ENSMUST00000144876 1858 ntTSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Fcho1Q8K285 Tcf4-252ENSMUST00000202477 1873 ntTSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Fcho1Q8K285 Daxx-207ENSMUST00000174146 2424 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Fcho1Q8K285 Pkn1-208ENSMUST00000144258 2995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Fcho1Q8K285 H2-Q1-202ENSMUST00000105041 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Fcho1Q8K285 Wdcp-202ENSMUST00000085793 1992 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Fcho1Q8K285 6030407O03Rik-201ENSMUST00000189514 2094 ntTSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Fcho1Q8K285 Gcc1-202ENSMUST00000090511 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Fcho1Q8K285 Nek1-208ENSMUST00000211256 4810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Fcho1Q8K285 Hsd3b1-201ENSMUST00000029465 1663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12□□□□□ -0.49
Fcho1Q8K285 Ctdspl2-201ENSMUST00000036647 5053 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Fcho1Q8K285 Rsc1a1-201ENSMUST00000105782 1749 ntAPPRIS P1 BASIC12□□□□□ -0.49
Fcho1Q8K285 Vrk1-201ENSMUST00000021539 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Fcho1Q8K285 Pmaip1-201ENSMUST00000025399 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Fcho1Q8K285 Trappc11-201ENSMUST00000039061 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Fcho1Q8K285 Fam210b-201ENSMUST00000028995 3617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Fcho1Q8K285 Npbwr1-201ENSMUST00000044180 3692 ntAPPRIS P1 BASIC12□□□□□ -0.49
Fcho1Q8K285 Sp2-202ENSMUST00000107623 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Fcho1Q8K285 Clic3-202ENSMUST00000114265 808 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Fcho1Q8K285 Gm12012-201ENSMUST00000118857 1066 ntBASIC12□□□□□ -0.49
Fcho1Q8K285 Gm7722-201ENSMUST00000120646 741 ntBASIC12□□□□□ -0.49
Fcho1Q8K285 Gm14809-201ENSMUST00000152025 695 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Fcho1Q8K285 Spata3-211ENSMUST00000159876 760 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Fcho1Q8K285 Gm20537-202ENSMUST00000173131 889 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Fcho1Q8K285 Stard10-207ENSMUST00000173270 670 ntTSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Fcho1Q8K285 Mir5120-201ENSMUST00000175020 78 ntBASIC12□□□□□ -0.49
Fcho1Q8K285 Tmem267-202ENSMUST00000176171 880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12□□□□□ -0.49
Fcho1Q8K285 Mir6979-201ENSMUST00000183927 56 ntBASIC12□□□□□ -0.49
Fcho1Q8K285 Gm31256-201ENSMUST00000194705 506 ntBASIC12□□□□□ -0.49
Fcho1Q8K285 Gm42838-201ENSMUST00000196503 439 ntTSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Fcho1Q8K285 Gm19605-202ENSMUST00000221514 1084 ntTSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Fcho1Q8K285 Abhd11os-203ENSMUST00000222613 363 ntBASIC12□□□□□ -0.49
Fcho1Q8K285 Fam241b-201ENSMUST00000027719 771 ntTSL 3 BASIC12□□□□□ -0.49
Fcho1Q8K285 Cryga-201ENSMUST00000061497 625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Fcho1Q8K285 Foxk1-201ENSMUST00000072837 7439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Fcho1Q8K285 Immt-202ENSMUST00000101301 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Fcho1Q8K285 Smtn-202ENSMUST00000020721 3335 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Fcho1Q8K285 Gm43154-214ENSMUST00000211225 1420 ntTSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Fcho1Q8K285 Fbp1-201ENSMUST00000092888 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Fcho1Q8K285 Gm43963-201ENSMUST00000203466 2488 ntBASIC12□□□□□ -0.49
Fcho1Q8K285 Zfp46-201ENSMUST00000069195 4639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Fcho1Q8K285 Mthfd1l-202ENSMUST00000117291 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Fcho1Q8K285 Slc26a11-201ENSMUST00000050880 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Fcho1Q8K285 Spem2-201ENSMUST00000056941 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Fcho1Q8K285 Cttnbp2nl-201ENSMUST00000077548 4946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
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Fcho1Q8K285 Pacsin1-201ENSMUST00000045896 4190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Fcho1Q8K285 Psmc3-201ENSMUST00000002171 1819 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Fcho1Q8K285 Kif2a-202ENSMUST00000117423 2023 ntTSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Fcho1Q8K285 Stk32b-201ENSMUST00000094836 3458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Fcho1Q8K285 Tiam1-214ENSMUST00000164263 3569 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Fcho1Q8K285 Pcgf2-207ENSMUST00000179765 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Fcho1Q8K285 Sec22b-201ENSMUST00000029476 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Fcho1Q8K285 BC024139-202ENSMUST00000089654 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Fcho1Q8K285 Miga2-201ENSMUST00000077977 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Fcho1Q8K285 Bub3-203ENSMUST00000207442 3414 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC11.99□□□□□ -0.49
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Fcho1Q8K285 Pex11b-201ENSMUST00000048766 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
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Fcho1Q8K285 Rprd1b-203ENSMUST00000109518 4399 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Fcho1Q8K285 Usp22-201ENSMUST00000041683 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
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Fcho1Q8K285 Kif1a-203ENSMUST00000171556 5391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Fcho1Q8K285 AC129931.1-201ENSMUST00000228865 1861 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
Fcho1Q8K285 Cln3-201ENSMUST00000032962 2386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Fcho1Q8K285 Mob3a-201ENSMUST00000003438 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Fcho1Q8K285 Il2rb-201ENSMUST00000089398 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Fcho1Q8K285 Nuak2-202ENSMUST00000082125 3107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Fcho1Q8K285 Aars2-201ENSMUST00000024733 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Fcho1Q8K285 Smc3-201ENSMUST00000025930 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Fcho1Q8K285 Map4-214ENSMUST00000199498 4055 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Fcho1Q8K285 Yars-201ENSMUST00000106054 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Fcho1Q8K285 Irak4-201ENSMUST00000074936 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Fcho1Q8K285 Gjd4-201ENSMUST00000041007 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Fcho1Q8K285 Kifc5b-201ENSMUST00000078961 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Fcho1Q8K285 Gm21136-201ENSMUST00000186812 2575 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
Fcho1Q8K285 Gm6605-201ENSMUST00000031488 2574 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
Fcho1Q8K285 Traf7-202ENSMUST00000088464 2504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Fcho1Q8K285 Spats2l-211ENSMUST00000169772 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Fcho1Q8K285 Gabrr1-201ENSMUST00000029947 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
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