Protein–RNA interactions for Protein: Q8CJ78

Znf628, Zinc finger protein 628, mousemouse

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Length 1,038 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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Znf628Q8CJ78 Synpo-211ENSMUST00000155195 4442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
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Znf628Q8CJ78 Nicn1-201ENSMUST00000035227 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Znf628Q8CJ78 Prom2-201ENSMUST00000028855 4796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
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Znf628Q8CJ78 Uhrf1bp1-201ENSMUST00000114849 8584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Znf628Q8CJ78 Myo3b-202ENSMUST00000112241 1319 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Znf628Q8CJ78 Tbc1d22bos-202ENSMUST00000163069 1349 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Znf628Q8CJ78 F10-201ENSMUST00000033821 1903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Znf628Q8CJ78 Bpi-201ENSMUST00000065039 1926 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Znf628Q8CJ78 Trpv4-205ENSMUST00000112225 3226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Znf628Q8CJ78 Mfap3l-202ENSMUST00000160719 6335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Znf628Q8CJ78 Dmtn-208ENSMUST00000228009 2643 ntAPPRIS P2 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Znf628Q8CJ78 Gabpb1-206ENSMUST00000110425 4153 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Znf628Q8CJ78 Mcf2l-203ENSMUST00000110866 5108 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Znf628Q8CJ78 Tubgcp2-201ENSMUST00000026547 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Znf628Q8CJ78 Rnf183-203ENSMUST00000107455 1432 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.62□□□□□ -0.55
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Znf628Q8CJ78 Oscar-203ENSMUST00000148012 1796 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Znf628Q8CJ78 Hspa14-201ENSMUST00000027961 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Znf628Q8CJ78 Srsf5-201ENSMUST00000094693 1527 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Znf628Q8CJ78 Acrbp-202ENSMUST00000088294 1883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Znf628Q8CJ78 Slc16a12-201ENSMUST00000009522 4051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
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