Protein–RNA interactions for Protein: Q8CIX8

Lgsn, Lengsin, mousemouse

Predictions only

Length 563 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LgsnQ8CIX8 Abca7-203ENSMUST00000171637 6638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
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LgsnQ8CIX8 A830018L16Rik-202ENSMUST00000135014 6451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
LgsnQ8CIX8 Nsd3-208ENSMUST00000146919 3652 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
LgsnQ8CIX8 Lyzl6-202ENSMUST00000107014 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
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LgsnQ8CIX8 Gm43622-201ENSMUST00000200140 2019 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
LgsnQ8CIX8 Gtf2ird1-203ENSMUST00000100650 3487 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
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LgsnQ8CIX8 B430119L08Rik-201ENSMUST00000130054 1994 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
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LgsnQ8CIX8 Carmil1-201ENSMUST00000072889 4988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
LgsnQ8CIX8 Slc4a3-202ENSMUST00000124341 7182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
LgsnQ8CIX8 Bad-201ENSMUST00000025910 1451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
LgsnQ8CIX8 Cd8b1-201ENSMUST00000065248 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
LgsnQ8CIX8 Ptprh-201ENSMUST00000049113 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
LgsnQ8CIX8 Camsap3-205ENSMUST00000207432 3865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
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LgsnQ8CIX8 Grik3-201ENSMUST00000030676 8973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
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LgsnQ8CIX8 Ntrk2-202ENSMUST00000109838 6846 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
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LgsnQ8CIX8 Tut1-201ENSMUST00000096239 2747 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.91□□□□□ -0.34
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LgsnQ8CIX8 Pex1-201ENSMUST00000006061 4433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
LgsnQ8CIX8 Tnc-202ENSMUST00000107371 2928 ntTSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
LgsnQ8CIX8 Spata48-201ENSMUST00000020410 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
LgsnQ8CIX8 Gm14058-201ENSMUST00000116082 735 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
LgsnQ8CIX8 Gm13035-201ENSMUST00000117496 342 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
LgsnQ8CIX8 Gm9062-201ENSMUST00000117712 727 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
LgsnQ8CIX8 Gm11511-201ENSMUST00000118146 540 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36 ms