Protein–RNA interactions for Protein: Q8CFE2

Hpf1, Histone PARylation factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 346 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hpf1Q8CFE2 Sypl2-201ENSMUST00000141387 4090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Hpf1Q8CFE2 Zfp423-201ENSMUST00000052250 4510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Hpf1Q8CFE2 Gm23200-201ENSMUST00000104379 132 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
Hpf1Q8CFE2 Lsp1-205ENSMUST00000105968 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Hpf1Q8CFE2 Gngt2-207ENSMUST00000107714 558 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Hpf1Q8CFE2 Mageb17-ps-201ENSMUST00000117902 919 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
Hpf1Q8CFE2 Got2-ps1-201ENSMUST00000121655 1293 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
Hpf1Q8CFE2 Gm44793-201ENSMUST00000136923 582 ntTSL 2 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Hpf1Q8CFE2 Mir3102-201ENSMUST00000175555 104 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
Hpf1Q8CFE2 Gm28287-201ENSMUST00000186612 546 ntTSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Hpf1Q8CFE2 A430027H14Rik-202ENSMUST00000192797 618 ntTSL 2 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Hpf1Q8CFE2 Gm43184-201ENSMUST00000197247 542 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
Hpf1Q8CFE2 C530044C16Rik-202ENSMUST00000205217 1239 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Hpf1Q8CFE2 Dcaf4-201ENSMUST00000021645 2008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Hpf1Q8CFE2 Spata24-201ENSMUST00000025209 701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Hpf1Q8CFE2 Accs-201ENSMUST00000041593 2036 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Hpf1Q8CFE2 Spata24-202ENSMUST00000096573 709 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Hpf1Q8CFE2 Dopey2-207ENSMUST00000227156 7340 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
Hpf1Q8CFE2 Trpv3-201ENSMUST00000049676 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Hpf1Q8CFE2 Adgrl3-214ENSMUST00000120445 5230 ntTSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Hpf1Q8CFE2 Ninl-201ENSMUST00000109896 5093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Hpf1Q8CFE2 Rab3d-203ENSMUST00000122211 3886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Hpf1Q8CFE2 Stat3-202ENSMUST00000103114 6042 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Hpf1Q8CFE2 Adgre5-208ENSMUST00000166939 2980 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Hpf1Q8CFE2 Tubgcp2-201ENSMUST00000026547 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Hpf1Q8CFE2 Adgre5-201ENSMUST00000002964 2986 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Hpf1Q8CFE2 Anxa11-201ENSMUST00000022416 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Hpf1Q8CFE2 Thrap3-201ENSMUST00000080919 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Hpf1Q8CFE2 Aldh1a7-201ENSMUST00000025656 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Hpf1Q8CFE2 Cmklr1-201ENSMUST00000047936 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Hpf1Q8CFE2 Mab21l3-202ENSMUST00000118411 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Hpf1Q8CFE2 Gm43860-201ENSMUST00000201742 2705 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
Hpf1Q8CFE2 Gm5525-201ENSMUST00000190438 1312 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
Hpf1Q8CFE2 AC079680.2-201ENSMUST00000219181 1306 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Hpf1Q8CFE2 Gpr179-201ENSMUST00000093942 9219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Hpf1Q8CFE2 1110051M20Rik-203ENSMUST00000102594 1977 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Hpf1Q8CFE2 Vmn1r193-202ENSMUST00000227457 6429 ntAPPRIS P1 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Hpf1Q8CFE2 Chtop-201ENSMUST00000001043 3257 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Hpf1Q8CFE2 Gm5859-201ENSMUST00000165401 2324 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
Hpf1Q8CFE2 Lyar-202ENSMUST00000114106 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Hpf1Q8CFE2 Lrrc18-204ENSMUST00000120951 1511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Hpf1Q8CFE2 Dync1i1-202ENSMUST00000115555 2669 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Hpf1Q8CFE2 Maml2-202ENSMUST00000159294 6404 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Hpf1Q8CFE2 Vsig10l-201ENSMUST00000107977 3836 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Hpf1Q8CFE2 F830115B05Rik-201ENSMUST00000197638 1894 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
Hpf1Q8CFE2 Tcn2-201ENSMUST00000020710 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Hpf1Q8CFE2 Mfsd13b-201ENSMUST00000033166 1883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Hpf1Q8CFE2 Syvn1-207ENSMUST00000156550 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Hpf1Q8CFE2 A830082K12Rik-201ENSMUST00000123998 2203 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Hpf1Q8CFE2 Trappc8-202ENSMUST00000097658 2703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Hpf1Q8CFE2 Gm10110-202ENSMUST00000228705 3220 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
Hpf1Q8CFE2 Cacng5-201ENSMUST00000039071 3705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Hpf1Q8CFE2 Rcor3-201ENSMUST00000073279 3748 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Hpf1Q8CFE2 Nono-201ENSMUST00000033673 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Hpf1Q8CFE2 Fut1-201ENSMUST00000008605 2580 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Hpf1Q8CFE2 Ttc7-202ENSMUST00000125875 3917 ntTSL 2 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Hpf1Q8CFE2 Sstr3-201ENSMUST00000053239 3928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Hpf1Q8CFE2 5430419D17Rik-201ENSMUST00000050586 2928 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Hpf1Q8CFE2 Chd3-202ENSMUST00000108661 7261 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Hpf1Q8CFE2 Serpina11-201ENSMUST00000074693 1447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Hpf1Q8CFE2 Ascc2-202ENSMUST00000109930 4844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Hpf1Q8CFE2 Lamr1-ps1-201ENSMUST00000119759 874 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
Hpf1Q8CFE2 Cep97-206ENSMUST00000122280 1057 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Hpf1Q8CFE2 Gm12589-201ENSMUST00000153767 638 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Hpf1Q8CFE2 Acat3-202ENSMUST00000160378 987 ntTSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Hpf1Q8CFE2 Lmo3-202ENSMUST00000161450 1048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Hpf1Q8CFE2 Prox2os-201ENSMUST00000177043 1133 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Hpf1Q8CFE2 1110008E08Rik-202ENSMUST00000183621 723 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
Hpf1Q8CFE2 Gm29707-202ENSMUST00000198744 659 ntTSL 3 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Hpf1Q8CFE2 Ppie-201ENSMUST00000030404 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Hpf1Q8CFE2 Abhd14a-201ENSMUST00000048685 1256 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Hpf1Q8CFE2 Dlk1-201ENSMUST00000056110 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Hpf1Q8CFE2 Mettl5-201ENSMUST00000060447 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Hpf1Q8CFE2 Gm11555-201ENSMUST00000073126 492 ntTSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Hpf1Q8CFE2 Nsl1-202ENSMUST00000078259 4879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Hpf1Q8CFE2 Med12l-203ENSMUST00000040846 3747 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Hpf1Q8CFE2 Pbrm1-207ENSMUST00000112095 7907 ntTSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Hpf1Q8CFE2 Cacna1s-202ENSMUST00000112068 6018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Hpf1Q8CFE2 Zdhhc20-201ENSMUST00000089473 5186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Hpf1Q8CFE2 Dnmt3c-201ENSMUST00000119996 2223 ntAPPRIS P1 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Hpf1Q8CFE2 Gm6157-201ENSMUST00000199935 1897 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
Hpf1Q8CFE2 Ndc1-204ENSMUST00000139560 4584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Hpf1Q8CFE2 F730043M19Rik-204ENSMUST00000148740 3312 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Hpf1Q8CFE2 Usp22-201ENSMUST00000041683 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Hpf1Q8CFE2 Rasgrp4-205ENSMUST00000159975 2296 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Hpf1Q8CFE2 Tfr2-204ENSMUST00000196471 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Hpf1Q8CFE2 Gm16168-201ENSMUST00000161091 1359 ntTSL 3 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Hpf1Q8CFE2 6030443J06Rik-202ENSMUST00000181374 1353 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Hpf1Q8CFE2 Bean1-206ENSMUST00000213077 1373 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Hpf1Q8CFE2 Nsf-202ENSMUST00000103075 3766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Hpf1Q8CFE2 Cpsf7-201ENSMUST00000038379 3604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Hpf1Q8CFE2 Gm8110-202ENSMUST00000211297 1782 ntTSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Hpf1Q8CFE2 Mfsd4a-207ENSMUST00000159038 1957 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Hpf1Q8CFE2 Prrt3-204ENSMUST00000205075 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Hpf1Q8CFE2 Camsap3-205ENSMUST00000207432 3865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Hpf1Q8CFE2 Cep128-210ENSMUST00000141429 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Hpf1Q8CFE2 Kcnj11-205ENSMUST00000211674 3142 ntAPPRIS P1 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Hpf1Q8CFE2 Ltbp2-201ENSMUST00000002073 6769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Hpf1Q8CFE2 Efna1-202ENSMUST00000118587 1632 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Hpf1Q8CFE2 Slamf7-204ENSMUST00000194531 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56 ms