Protein–RNA interactions for Protein: Q8CEQ0

Cdkl1, Cyclin-dependent kinase-like 1, mousemouse

Predictions only

Length 352 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdkl1Q8CEQ0 Ephb2-203ENSMUST00000105846 3653 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Cdkl1Q8CEQ0 C130050O18Rik-202ENSMUST00000163940 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Cdkl1Q8CEQ0 Adgrl3-214ENSMUST00000120445 5230 ntTSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Cdkl1Q8CEQ0 6030458C11Rik-204ENSMUST00000228177 3156 ntBASIC11.16□□□□□ -0.62
Cdkl1Q8CEQ0 Grm4-202ENSMUST00000118489 2976 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Cdkl1Q8CEQ0 Gm26510-201ENSMUST00000180468 1796 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Cdkl1Q8CEQ0 Unc5c-202ENSMUST00000106236 9646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Cdkl1Q8CEQ0 Txndc12-201ENSMUST00000030296 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Cdkl1Q8CEQ0 Myo7a-203ENSMUST00000107127 6806 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Cdkl1Q8CEQ0 Nfia-202ENSMUST00000075448 9526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Cdkl1Q8CEQ0 Pde4c-207ENSMUST00000224874 3099 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Cdkl1Q8CEQ0 Gm37931-201ENSMUST00000194686 2866 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
Cdkl1Q8CEQ0 Sash3-201ENSMUST00000033427 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Cdkl1Q8CEQ0 Spert-203ENSMUST00000165569 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Cdkl1Q8CEQ0 Kdm5c-201ENSMUST00000082177 5520 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Cdkl1Q8CEQ0 Gdpd2-201ENSMUST00000019503 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Cdkl1Q8CEQ0 Gm37014-201ENSMUST00000194723 2253 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
Cdkl1Q8CEQ0 Cacna1c-212ENSMUST00000187940 7507 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Cdkl1Q8CEQ0 Fn1-201ENSMUST00000055226 8315 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Cdkl1Q8CEQ0 Gm26857-201ENSMUST00000181580 3347 ntTSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Cdkl1Q8CEQ0 Akap10-202ENSMUST00000102650 3874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Cdkl1Q8CEQ0 Fbxo25-204ENSMUST00000209913 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Cdkl1Q8CEQ0 Gtf2ird1-203ENSMUST00000100650 3487 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Cdkl1Q8CEQ0 Timm10b-204ENSMUST00000106784 494 ntTSL 3 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Cdkl1Q8CEQ0 Hexim2-202ENSMUST00000107037 1221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Cdkl1Q8CEQ0 Pafah1b3-202ENSMUST00000108410 689 ntTSL 3 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Cdkl1Q8CEQ0 Gm14130-201ENSMUST00000118417 987 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
Cdkl1Q8CEQ0 Gm15207-201ENSMUST00000119259 442 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
Cdkl1Q8CEQ0 Nfu1-203ENSMUST00000120240 1195 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Cdkl1Q8CEQ0 Gm13350-201ENSMUST00000120519 479 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
Cdkl1Q8CEQ0 Rpl13-ps1-201ENSMUST00000121801 668 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
Cdkl1Q8CEQ0 Gm45692-201ENSMUST00000131138 557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Cdkl1Q8CEQ0 Gm12690-201ENSMUST00000132108 354 ntTSL 3 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Cdkl1Q8CEQ0 Rpl41-206ENSMUST00000177163 544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Cdkl1Q8CEQ0 Gm21859-201ENSMUST00000178424 1045 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Cdkl1Q8CEQ0 Gm28071-201ENSMUST00000190355 478 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
Cdkl1Q8CEQ0 Gm5869-201ENSMUST00000200248 1257 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
Cdkl1Q8CEQ0 Cplx3-203ENSMUST00000217015 540 ntTSL 2 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Cdkl1Q8CEQ0 AC113082.1-201ENSMUST00000217324 327 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
Cdkl1Q8CEQ0 Pebp4-201ENSMUST00000022678 1079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Cdkl1Q8CEQ0 Gm11555-201ENSMUST00000073126 492 ntTSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Cdkl1Q8CEQ0 Olfr156-202ENSMUST00000079465 1099 ntAPPRIS P1 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Cdkl1Q8CEQ0 Olfr605-201ENSMUST00000080660 1011 ntAPPRIS P1 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Cdkl1Q8CEQ0 Plekhm1-201ENSMUST00000041272 5968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Cdkl1Q8CEQ0 Cchcr1-205ENSMUST00000173903 3054 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Cdkl1Q8CEQ0 Aire-202ENSMUST00000105395 1630 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Cdkl1Q8CEQ0 Zfp263-201ENSMUST00000023176 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Cdkl1Q8CEQ0 Hnrnph2-205ENSMUST00000113203 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Cdkl1Q8CEQ0 Lipo2-201ENSMUST00000147153 3562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Cdkl1Q8CEQ0 Mmel1-203ENSMUST00000105634 2669 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Cdkl1Q8CEQ0 Serpine1-202ENSMUST00000077523 2697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Cdkl1Q8CEQ0 Rai1-207ENSMUST00000171108 7125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Cdkl1Q8CEQ0 Arhgap33-201ENSMUST00000044338 4280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Cdkl1Q8CEQ0 Tef-202ENSMUST00000109553 4401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Cdkl1Q8CEQ0 Grin2b-205ENSMUST00000152012 2461 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Cdkl1Q8CEQ0 Sept8-204ENSMUST00000121334 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Cdkl1Q8CEQ0 Ubap2l-201ENSMUST00000029553 3509 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Cdkl1Q8CEQ0 Samd5-201ENSMUST00000100070 6818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Cdkl1Q8CEQ0 Mapk8ip3-204ENSMUST00000117509 5418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Cdkl1Q8CEQ0 Pcdhga4-201ENSMUST00000194418 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Cdkl1Q8CEQ0 Trim35-201ENSMUST00000022623 3678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Cdkl1Q8CEQ0 Onecut1-201ENSMUST00000056006 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.63
Cdkl1Q8CEQ0 Cpsf7-201ENSMUST00000038379 3604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.63
Cdkl1Q8CEQ0 Pygo2-202ENSMUST00000107413 2911 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.63
Cdkl1Q8CEQ0 Tgm2-201ENSMUST00000103122 3596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.63
Cdkl1Q8CEQ0 Fdxacb1-201ENSMUST00000042391 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Cdkl1Q8CEQ0 Rab27b-201ENSMUST00000069749 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Cdkl1Q8CEQ0 Spatc1l-201ENSMUST00000009259 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Cdkl1Q8CEQ0 Hexim1-201ENSMUST00000053063 3495 ntAPPRIS P1 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Cdkl1Q8CEQ0 Wdr17-211ENSMUST00000175915 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Cdkl1Q8CEQ0 Cacna1g-205ENSMUST00000107786 7984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Cdkl1Q8CEQ0 Slc37a1-202ENSMUST00000171233 2929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Cdkl1Q8CEQ0 Gtf2e1-201ENSMUST00000023525 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Cdkl1Q8CEQ0 Jhy-201ENSMUST00000034521 3074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Cdkl1Q8CEQ0 Pygo1-201ENSMUST00000038489 7916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Cdkl1Q8CEQ0 Frmd8-201ENSMUST00000025728 4504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Cdkl1Q8CEQ0 Rps6ka6-202ENSMUST00000082034 4170 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Cdkl1Q8CEQ0 Fyn-206ENSMUST00000136659 1910 ntTSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Cdkl1Q8CEQ0 Taf6-203ENSMUST00000110937 2093 ntTSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Cdkl1Q8CEQ0 Spats2l-203ENSMUST00000164302 2088 ntTSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Cdkl1Q8CEQ0 Flnc-202ENSMUST00000101617 8939 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Cdkl1Q8CEQ0 Ccl27a-206ENSMUST00000108037 590 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Cdkl1Q8CEQ0 Gm5150-201ENSMUST00000108347 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Cdkl1Q8CEQ0 Colca2-201ENSMUST00000114427 1263 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Cdkl1Q8CEQ0 Clps-202ENSMUST00000114785 369 ntTSL 2 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Cdkl1Q8CEQ0 1700080O16Rik-202ENSMUST00000114866 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Cdkl1Q8CEQ0 Pcbd2-202ENSMUST00000124968 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Cdkl1Q8CEQ0 Gm15979-201ENSMUST00000149741 590 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Cdkl1Q8CEQ0 Cd63-ps-202ENSMUST00000154992 717 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Cdkl1Q8CEQ0 Gm17376-201ENSMUST00000166016 84 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Cdkl1Q8CEQ0 Ddt-201ENSMUST00000001716 649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Cdkl1Q8CEQ0 Gm9866-204ENSMUST00000183238 351 ntTSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Cdkl1Q8CEQ0 A630035G10Rik-202ENSMUST00000194468 1065 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Cdkl1Q8CEQ0 Prss52-201ENSMUST00000022537 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Cdkl1Q8CEQ0 Crip3-201ENSMUST00000024764 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Cdkl1Q8CEQ0 Defb22-201ENSMUST00000028966 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Cdkl1Q8CEQ0 Ndufaf5-201ENSMUST00000044825 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Cdkl1Q8CEQ0 Gm9843-201ENSMUST00000052867 504 ntAPPRIS P1 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Cdkl1Q8CEQ0 Vmn1r222-201ENSMUST00000077116 1054 ntAPPRIS P1 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Cdkl1Q8CEQ0 Dnajc12-201ENSMUST00000043317 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 81.8 ms