Protein–RNA interactions for Protein: Q8CDR2

Rsph6a, Radial spoke head protein 6 homolog A, mousemouse

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Length 708 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rsph6aQ8CDR2 Ankrd34b-201ENSMUST00000061594 4013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rsph6aQ8CDR2 Sun3-202ENSMUST00000102909 1205 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rsph6aQ8CDR2 Krtap4-16-201ENSMUST00000107437 954 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rsph6aQ8CDR2 Gm7150-201ENSMUST00000122032 981 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Rsph6aQ8CDR2 Gm14665-201ENSMUST00000122294 557 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Rsph6aQ8CDR2 Gm15640-201ENSMUST00000152070 527 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rsph6aQ8CDR2 Hmgn3-201ENSMUST00000161796 862 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rsph6aQ8CDR2 Gm20442-201ENSMUST00000174630 492 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rsph6aQ8CDR2 Slc2a4rg-ps-202ENSMUST00000176590 1143 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Rsph6aQ8CDR2 Plac9a-202ENSMUST00000183431 536 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rsph6aQ8CDR2 Plac9b-204ENSMUST00000184675 536 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rsph6aQ8CDR2 Gm27910-201ENSMUST00000185004 107 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Rsph6aQ8CDR2 Mir8093-201ENSMUST00000185043 137 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Rsph6aQ8CDR2 1600019K03Rik-201ENSMUST00000187829 477 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rsph6aQ8CDR2 Gatad1-204ENSMUST00000196304 704 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rsph6aQ8CDR2 Nkg7-203ENSMUST00000206741 686 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rsph6aQ8CDR2 CT485607.1-201ENSMUST00000216100 85 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Rsph6aQ8CDR2 Vmn1r35-201ENSMUST00000071414 891 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rsph6aQ8CDR2 Tmem25-202ENSMUST00000114705 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rsph6aQ8CDR2 Gm36995-201ENSMUST00000126170 5727 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rsph6aQ8CDR2 Ephb6-201ENSMUST00000114732 3762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rsph6aQ8CDR2 Epha8-201ENSMUST00000030420 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rsph6aQ8CDR2 Dnajc5-201ENSMUST00000072334 6578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rsph6aQ8CDR2 Gm1840-201ENSMUST00000051687 1432 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Rsph6aQ8CDR2 Ivns1abp-202ENSMUST00000097543 3337 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rsph6aQ8CDR2 Epb41-208ENSMUST00000105981 5303 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rsph6aQ8CDR2 Tbx10-201ENSMUST00000041871 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rsph6aQ8CDR2 Llgl2-212ENSMUST00000177736 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rsph6aQ8CDR2 Prkar1b-202ENSMUST00000110889 2457 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rsph6aQ8CDR2 Pstpip2-201ENSMUST00000114741 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rsph6aQ8CDR2 Lef1-204ENSMUST00000106341 3357 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rsph6aQ8CDR2 Lef1-202ENSMUST00000066849 3398 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rsph6aQ8CDR2 Xrcc3-201ENSMUST00000021715 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rsph6aQ8CDR2 Gm12200-201ENSMUST00000144876 1858 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rsph6aQ8CDR2 Eya1-203ENSMUST00000168081 4366 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rsph6aQ8CDR2 Tmem206-201ENSMUST00000027940 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rsph6aQ8CDR2 Esrrb-203ENSMUST00000110204 4196 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rsph6aQ8CDR2 Ccdc85a-204ENSMUST00000109502 5220 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rsph6aQ8CDR2 Rims1-205ENSMUST00000097811 6446 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rsph6aQ8CDR2 Urgcp-203ENSMUST00000118076 4208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rsph6aQ8CDR2 Gm25076-201ENSMUST00000104098 132 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Rsph6aQ8CDR2 Ifna16-201ENSMUST00000105148 1010 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rsph6aQ8CDR2 Rtn2-202ENSMUST00000108468 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rsph6aQ8CDR2 Tprkb-203ENSMUST00000113751 692 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rsph6aQ8CDR2 Klrc1-203ENSMUST00000118447 684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rsph6aQ8CDR2 Mia-202ENSMUST00000121848 572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rsph6aQ8CDR2 Gm13091-201ENSMUST00000128800 469 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rsph6aQ8CDR2 Adap2os-201ENSMUST00000140556 984 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rsph6aQ8CDR2 Gm15764-201ENSMUST00000150389 672 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rsph6aQ8CDR2 Gm10807-201ENSMUST00000177134 795 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Rsph6aQ8CDR2 Wdr53-204ENSMUST00000178573 1153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rsph6aQ8CDR2 Mir7076-201ENSMUST00000183519 74 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Rsph6aQ8CDR2 Gm28180-201ENSMUST00000189608 722 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Rsph6aQ8CDR2 Gm35549-201ENSMUST00000203176 735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rsph6aQ8CDR2 Gm20177-201ENSMUST00000203705 334 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Rsph6aQ8CDR2 3300002P13Rik-201ENSMUST00000204020 1092 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rsph6aQ8CDR2 Gm18871-201ENSMUST00000218655 745 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Rsph6aQ8CDR2 Gm36287-201ENSMUST00000223481 796 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rsph6aQ8CDR2 2310057N15Rik-201ENSMUST00000054223 1028 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rsph6aQ8CDR2 Tas2r121-201ENSMUST00000095395 918 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rsph6aQ8CDR2 Olfr584-201ENSMUST00000098210 964 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Rsph6aQ8CDR2 Nelfcd-202ENSMUST00000109075 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rsph6aQ8CDR2 Nelfcd-201ENSMUST00000016397 2280 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rsph6aQ8CDR2 Bcl11a-202ENSMUST00000109514 5989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rsph6aQ8CDR2 Arcn1-201ENSMUST00000034607 4072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rsph6aQ8CDR2 Elf1-201ENSMUST00000040131 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rsph6aQ8CDR2 Zc3h4-202ENSMUST00000209289 5853 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rsph6aQ8CDR2 Armcx2-203ENSMUST00000119010 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rsph6aQ8CDR2 Phactr3-202ENSMUST00000103066 2680 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rsph6aQ8CDR2 Gjd4-201ENSMUST00000041007 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rsph6aQ8CDR2 Prss47-202ENSMUST00000203968 1353 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rsph6aQ8CDR2 Tbc1d24-209ENSMUST00000201301 4261 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rsph6aQ8CDR2 Zfp467-206ENSMUST00000114561 3619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rsph6aQ8CDR2 Arfgap1-202ENSMUST00000108859 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rsph6aQ8CDR2 Rit2-203ENSMUST00000153060 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rsph6aQ8CDR2 Gypa-201ENSMUST00000063359 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rsph6aQ8CDR2 Rnf223-201ENSMUST00000209248 2908 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rsph6aQ8CDR2 Cbfa2t2-202ENSMUST00000099178 3247 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rsph6aQ8CDR2 Per1-206ENSMUST00000166748 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rsph6aQ8CDR2 Fastkd3-201ENSMUST00000051784 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rsph6aQ8CDR2 Rbm39-201ENSMUST00000029149 2711 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rsph6aQ8CDR2 Oit3-201ENSMUST00000009798 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rsph6aQ8CDR2 Ntrk2-204ENSMUST00000224259 3049 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Rsph6aQ8CDR2 AC166836.1-201ENSMUST00000219933 1795 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Rsph6aQ8CDR2 Hspa14-201ENSMUST00000027961 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rsph6aQ8CDR2 Xkr8-201ENSMUST00000045550 4245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rsph6aQ8CDR2 Lcp2-202ENSMUST00000109329 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rsph6aQ8CDR2 Opcml-201ENSMUST00000073822 2378 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rsph6aQ8CDR2 Dnmt3bos-201ENSMUST00000124988 718 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rsph6aQ8CDR2 Gm15985-201ENSMUST00000137731 343 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rsph6aQ8CDR2 Gm22138-201ENSMUST00000158748 128 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Rsph6aQ8CDR2 Gm16112-201ENSMUST00000159075 382 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Rsph6aQ8CDR2 4930599A14Rik-201ENSMUST00000186724 387 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rsph6aQ8CDR2 Olfr431-ps1-201ENSMUST00000192435 544 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Rsph6aQ8CDR2 Gm38384-201ENSMUST00000195413 1122 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Rsph6aQ8CDR2 4930413E15Rik-201ENSMUST00000202500 1290 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rsph6aQ8CDR2 Nrg1-206ENSMUST00000208205 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rsph6aQ8CDR2 Klk7-201ENSMUST00000032955 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rsph6aQ8CDR2 Olfr1350-201ENSMUST00000070985 927 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rsph6aQ8CDR2 Lst1-201ENSMUST00000097336 415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
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