Protein–RNA interactions for Protein: Q8CDD9

Lrif1, Ligand-dependent nuclear receptor-interacting factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 755 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrif1Q8CDD9 Fgl1-201ENSMUST00000034003 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Lrif1Q8CDD9 Ctrb1-201ENSMUST00000034435 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Lrif1Q8CDD9 Mrap-201ENSMUST00000038197 1001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Lrif1Q8CDD9 Gm21103-202ENSMUST00000170923 1761 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Lrif1Q8CDD9 Dcaf4-201ENSMUST00000021645 2008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Lrif1Q8CDD9 Nek3-201ENSMUST00000033865 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Lrif1Q8CDD9 Creb3l2-201ENSMUST00000041093 7082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Lrif1Q8CDD9 Tmc7-201ENSMUST00000044195 4546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Lrif1Q8CDD9 Flad1-204ENSMUST00000129308 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Lrif1Q8CDD9 Nxpe5-204ENSMUST00000161047 2379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Lrif1Q8CDD9 Tcn2-201ENSMUST00000020710 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Lrif1Q8CDD9 Clic4-201ENSMUST00000037099 4119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Lrif1Q8CDD9 Lins1-202ENSMUST00000077967 2647 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Lrif1Q8CDD9 Zfp384-202ENSMUST00000054553 2451 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Lrif1Q8CDD9 Mab21l1-201ENSMUST00000075422 2492 ntAPPRIS P1 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Lrif1Q8CDD9 Slc30a8-201ENSMUST00000037240 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Lrif1Q8CDD9 Ttll10-206ENSMUST00000184348 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Lrif1Q8CDD9 Dnajc5-203ENSMUST00000108797 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Lrif1Q8CDD9 Ccdc57-201ENSMUST00000056781 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Lrif1Q8CDD9 Chl1-204ENSMUST00000203912 4628 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Lrif1Q8CDD9 Smim1-214ENSMUST00000182191 3535 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Lrif1Q8CDD9 AI854703-201ENSMUST00000095938 3517 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Lrif1Q8CDD9 Fads6-201ENSMUST00000056153 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Lrif1Q8CDD9 Dhx58os-201ENSMUST00000137154 1594 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Lrif1Q8CDD9 Gm37131-201ENSMUST00000192502 1561 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Lrif1Q8CDD9 F10-201ENSMUST00000033821 1903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Lrif1Q8CDD9 Gpihbp1-203ENSMUST00000189874 1652 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Lrif1Q8CDD9 Mum1l1-204ENSMUST00000113045 4523 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Lrif1Q8CDD9 Rasal2-204ENSMUST00000132699 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Lrif1Q8CDD9 Sgk1-201ENSMUST00000020145 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Lrif1Q8CDD9 Cstf3-201ENSMUST00000028599 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Lrif1Q8CDD9 Cd276-201ENSMUST00000039788 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Lrif1Q8CDD9 1500009C09Rik-201ENSMUST00000136948 1526 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Lrif1Q8CDD9 Ica1-204ENSMUST00000115520 1876 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Lrif1Q8CDD9 Flad1-202ENSMUST00000107426 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Lrif1Q8CDD9 Mccc1os-202ENSMUST00000137198 2686 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Lrif1Q8CDD9 4933440M02Rik-202ENSMUST00000205794 1601 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Lrif1Q8CDD9 6030468B19Rik-201ENSMUST00000106331 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Lrif1Q8CDD9 Aamdc-210ENSMUST00000146605 642 ntTSL 3 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Lrif1Q8CDD9 Gm25668-201ENSMUST00000157700 129 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Lrif1Q8CDD9 Gm30459-201ENSMUST00000206203 1193 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Lrif1Q8CDD9 Gm45720-201ENSMUST00000211881 484 ntTSL 3 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Lrif1Q8CDD9 Gm10254-201ENSMUST00000052888 867 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Lrif1Q8CDD9 Odf2l-204ENSMUST00000106192 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Lrif1Q8CDD9 Mageb4-202ENSMUST00000113969 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Lrif1Q8CDD9 Ccdc96-201ENSMUST00000060100 3585 ntAPPRIS P1 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Lrif1Q8CDD9 Ric3-201ENSMUST00000055993 5281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Lrif1Q8CDD9 Synj2-203ENSMUST00000115784 2634 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Lrif1Q8CDD9 Ccndbp1-201ENSMUST00000060455 1569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Lrif1Q8CDD9 Nfasc-203ENSMUST00000163770 3903 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Lrif1Q8CDD9 Gm26660-202ENSMUST00000223620 4112 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Lrif1Q8CDD9 4930520O04Rik-202ENSMUST00000131898 2660 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Lrif1Q8CDD9 Chd5-201ENSMUST00000005175 9122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Lrif1Q8CDD9 Gm43242-201ENSMUST00000199507 1776 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Lrif1Q8CDD9 Gm7538-201ENSMUST00000200918 1348 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Lrif1Q8CDD9 Arc-202ENSMUST00000110009 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Lrif1Q8CDD9 Arc-201ENSMUST00000023268 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Lrif1Q8CDD9 Lmbr1-202ENSMUST00000179191 4836 ntTSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Lrif1Q8CDD9 Cyp2s1-202ENSMUST00000108395 3161 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Lrif1Q8CDD9 Trpc6-203ENSMUST00000217462 3168 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Lrif1Q8CDD9 Gm44579-201ENSMUST00000142443 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Lrif1Q8CDD9 Mab21l2-201ENSMUST00000077524 2703 ntAPPRIS P1 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Lrif1Q8CDD9 Gm33831-201ENSMUST00000211696 1542 ntTSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Lrif1Q8CDD9 Rims3-202ENSMUST00000106283 6437 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Lrif1Q8CDD9 Gm42141-201ENSMUST00000196534 2172 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
Lrif1Q8CDD9 Myo5b-203ENSMUST00000121875 6065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Lrif1Q8CDD9 Immt-202ENSMUST00000101301 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Lrif1Q8CDD9 Gm9796-201ENSMUST00000062249 2250 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
Lrif1Q8CDD9 Gtf2a1-202ENSMUST00000063314 2265 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Lrif1Q8CDD9 Unc5c-202ENSMUST00000106236 9646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Lrif1Q8CDD9 Sema4c-202ENSMUST00000191642 3892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Lrif1Q8CDD9 Reps2-201ENSMUST00000101102 7630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Lrif1Q8CDD9 Dpep2-206ENSMUST00000227363 1844 ntAPPRIS P1 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Lrif1Q8CDD9 March1-207ENSMUST00000110258 2581 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Lrif1Q8CDD9 C2cd5-203ENSMUST00000171349 4292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Lrif1Q8CDD9 Sdccag8-201ENSMUST00000027785 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Lrif1Q8CDD9 Kars-201ENSMUST00000034426 2008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Lrif1Q8CDD9 Fank1-201ENSMUST00000065359 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Lrif1Q8CDD9 Tnfrsf18-202ENSMUST00000103173 1189 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Lrif1Q8CDD9 Gm24255-201ENSMUST00000104481 128 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
Lrif1Q8CDD9 Gm15501-201ENSMUST00000133910 849 ntTSL 3 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Lrif1Q8CDD9 Zdhhc4-208ENSMUST00000161915 1216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Lrif1Q8CDD9 Mymx-203ENSMUST00000178858 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Lrif1Q8CDD9 Lsm10-203ENSMUST00000179323 808 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Lrif1Q8CDD9 Gm26973-201ENSMUST00000182105 696 ntTSL 3 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Lrif1Q8CDD9 Gm7895-201ENSMUST00000187459 1173 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
Lrif1Q8CDD9 Rpl7a-ps2-201ENSMUST00000200554 774 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
Lrif1Q8CDD9 Tmem205-203ENSMUST00000213698 705 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Lrif1Q8CDD9 Hspb2-202ENSMUST00000217159 552 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Lrif1Q8CDD9 Zdhhc12-201ENSMUST00000081838 1187 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Lrif1Q8CDD9 Cd37-202ENSMUST00000098461 1227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Lrif1Q8CDD9 Slc19a1-209ENSMUST00000144234 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Lrif1Q8CDD9 Arhgef2-207ENSMUST00000175903 3356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Lrif1Q8CDD9 Oas1f-201ENSMUST00000057814 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Lrif1Q8CDD9 Kcnk10-201ENSMUST00000110113 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Lrif1Q8CDD9 Slc2a4-203ENSMUST00000141837 1776 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Lrif1Q8CDD9 Man2b2-201ENSMUST00000031002 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Lrif1Q8CDD9 Elovl7-201ENSMUST00000022207 4013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Lrif1Q8CDD9 Arhgef16-207ENSMUST00000169623 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Lrif1Q8CDD9 Prf1-202ENSMUST00000219375 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.2 ms