Protein–RNA interactions for Protein: Q8CD92

Ttc27, Tetratricopeptide repeat protein 27, mousemouse

Predictions only

Length 847 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttc27Q8CD92 Myh2-203ENSMUST00000170159 6083 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Ttc27Q8CD92 Tex2-201ENSMUST00000042780 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Ttc27Q8CD92 Capza1-201ENSMUST00000094028 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Ttc27Q8CD92 Gm44579-201ENSMUST00000142443 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Ttc27Q8CD92 Gm2237-202ENSMUST00000170694 2090 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Ttc27Q8CD92 Anxa7-202ENSMUST00000100844 2904 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Ttc27Q8CD92 Gja8-201ENSMUST00000062944 6940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Ttc27Q8CD92 Ppp4r1-201ENSMUST00000073104 3850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ttc27Q8CD92 Pip4k2b-201ENSMUST00000018691 5053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ttc27Q8CD92 Chrng-201ENSMUST00000027470 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ttc27Q8CD92 Cpt1c-201ENSMUST00000063761 2793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ttc27Q8CD92 Gm9195-201ENSMUST00000208955 8870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ttc27Q8CD92 Cyp26b1-202ENSMUST00000168003 4170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ttc27Q8CD92 Cyp26b1-201ENSMUST00000077705 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ttc27Q8CD92 Gm39168-201ENSMUST00000210181 1423 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ttc27Q8CD92 Thbs4-201ENSMUST00000022213 3198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ttc27Q8CD92 G6pdx-201ENSMUST00000004327 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ttc27Q8CD92 6030468B19Rik-201ENSMUST00000106331 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ttc27Q8CD92 Pigp-205ENSMUST00000113917 805 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ttc27Q8CD92 1700066O22Rik-203ENSMUST00000150994 961 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ttc27Q8CD92 1700069L16Rik-203ENSMUST00000162388 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ttc27Q8CD92 Uba52-ps-201ENSMUST00000183770 379 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Ttc27Q8CD92 1500004A13Rik-208ENSMUST00000184958 823 ntTSL 3 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ttc27Q8CD92 Gm18062-201ENSMUST00000208020 547 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Ttc27Q8CD92 Gm18055-201ENSMUST00000208254 547 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Ttc27Q8CD92 Gm19309-201ENSMUST00000218295 205 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Ttc27Q8CD92 AC166349.1-201ENSMUST00000220866 695 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Ttc27Q8CD92 Asb8-201ENSMUST00000059112 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ttc27Q8CD92 Ifi27-201ENSMUST00000066701 889 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ttc27Q8CD92 Msantd1-201ENSMUST00000050535 2793 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ttc27Q8CD92 Zfp866-202ENSMUST00000137573 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ttc27Q8CD92 Arhgef15-203ENSMUST00000108671 4372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ttc27Q8CD92 Vtn-201ENSMUST00000017488 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ttc27Q8CD92 Gm3756-201ENSMUST00000169182 1355 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Ttc27Q8CD92 Fnip1-201ENSMUST00000046835 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ttc27Q8CD92 Gm5833-202ENSMUST00000190707 1932 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ttc27Q8CD92 Smim1-213ENSMUST00000182151 5091 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ttc27Q8CD92 Tagln2-202ENSMUST00000111230 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ttc27Q8CD92 Chit1-203ENSMUST00000160060 1580 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ttc27Q8CD92 Camsap3-209ENSMUST00000207970 3817 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ttc27Q8CD92 Lynx1-201ENSMUST00000023259 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ttc27Q8CD92 Acot9-201ENSMUST00000026324 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
Ttc27Q8CD92 C1qtnf3-201ENSMUST00000022853 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ttc27Q8CD92 Pabpc4-203ENSMUST00000106241 3050 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ttc27Q8CD92 Fyb2-202ENSMUST00000106804 3068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ttc27Q8CD92 Cd55-201ENSMUST00000027650 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ttc27Q8CD92 Zfp420-202ENSMUST00000074876 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ttc27Q8CD92 BC004004-203ENSMUST00000149405 1402 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ttc27Q8CD92 Axl-201ENSMUST00000002677 4265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ttc27Q8CD92 Spats2l-203ENSMUST00000164302 2088 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ttc27Q8CD92 Dixdc1-202ENSMUST00000117093 1613 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ttc27Q8CD92 Gm17281-201ENSMUST00000180732 3589 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ttc27Q8CD92 Gm35040-201ENSMUST00000206829 5094 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ttc27Q8CD92 Rai1-207ENSMUST00000171108 7125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ttc27Q8CD92 Gm26823-201ENSMUST00000181425 2361 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ttc27Q8CD92 Gm43127-201ENSMUST00000195890 2789 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Ttc27Q8CD92 Arpc3-202ENSMUST00000102525 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ttc27Q8CD92 Ndufa3-202ENSMUST00000108644 351 ntTSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ttc27Q8CD92 Cspp1-202ENSMUST00000117415 1272 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ttc27Q8CD92 Gm11793-201ENSMUST00000120433 981 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Ttc27Q8CD92 Rps19-ps11-201ENSMUST00000160308 433 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Ttc27Q8CD92 Aif1-203ENSMUST00000172693 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ttc27Q8CD92 Mospd4-201ENSMUST00000180618 576 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Ttc27Q8CD92 Mocs2-215ENSMUST00000184335 646 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ttc27Q8CD92 Gm43966-201ENSMUST00000203301 612 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Ttc27Q8CD92 Gm36355-201ENSMUST00000203752 639 ntTSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ttc27Q8CD92 Gm45880-201ENSMUST00000213041 853 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Ttc27Q8CD92 CU024892.2-201ENSMUST00000224608 832 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Ttc27Q8CD92 4930578I06Rik-201ENSMUST00000022532 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ttc27Q8CD92 Fam241b-201ENSMUST00000027719 771 ntTSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ttc27Q8CD92 Saa3-201ENSMUST00000006956 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ttc27Q8CD92 Rnase2b-201ENSMUST00000075648 759 ntAPPRIS P1 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ttc27Q8CD92 Pcgf1-201ENSMUST00000092614 866 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ttc27Q8CD92 Gm14150-201ENSMUST00000122404 1354 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Ttc27Q8CD92 Fut10-202ENSMUST00000110527 2327 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ttc27Q8CD92 AC131068.2-201ENSMUST00000226175 1453 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Ttc27Q8CD92 Cd79a-201ENSMUST00000003469 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ttc27Q8CD92 Isl1-201ENSMUST00000036060 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ttc27Q8CD92 St6galnac5-201ENSMUST00000044278 5667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ttc27Q8CD92 Pcif1-201ENSMUST00000041643 5772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ttc27Q8CD92 Nhlh2-201ENSMUST00000066187 3761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ttc27Q8CD92 Kdm2a-201ENSMUST00000047898 8578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ttc27Q8CD92 Serpina1b-202ENSMUST00000164454 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ttc27Q8CD92 Gm8110-202ENSMUST00000211297 1782 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ttc27Q8CD92 Sox8-201ENSMUST00000025003 3000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ttc27Q8CD92 Zfp593-201ENSMUST00000030644 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ttc27Q8CD92 Stx7-205ENSMUST00000220041 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ttc27Q8CD92 Best1-201ENSMUST00000117346 2080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ttc27Q8CD92 Slc2a10-201ENSMUST00000029196 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ttc27Q8CD92 Zfp536-202ENSMUST00000175941 4423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ttc27Q8CD92 Camk2g-203ENSMUST00000100837 3564 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ttc27Q8CD92 Kalrn-211ENSMUST00000114966 3857 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ttc27Q8CD92 Slc1a4-201ENSMUST00000004634 3872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ttc27Q8CD92 4930453L07Rik-201ENSMUST00000209053 1439 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ttc27Q8CD92 Satb2-205ENSMUST00000177424 4694 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ttc27Q8CD92 Chrne-201ENSMUST00000014753 1616 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ttc27Q8CD92 Tcn2-203ENSMUST00000109989 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ttc27Q8CD92 Eno1-201ENSMUST00000080149 1902 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ttc27Q8CD92 Riox2-206ENSMUST00000160571 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ttc27Q8CD92 Rps6ka1-209ENSMUST00000174481 2228 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.2 ms