Protein–RNA interactions for Protein: Q8C006

Trim35, Tripartite motif-containing protein 35, mousemouse

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Length 501 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim35Q8C006 Alx1-201ENSMUST00000040859 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Trim35Q8C006 Igfals-201ENSMUST00000050714 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Trim35Q8C006 Gm26788-201ENSMUST00000181692 1750 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Trim35Q8C006 Sema3f-204ENSMUST00000192727 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Trim35Q8C006 Lrrc8a-202ENSMUST00000113654 4194 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Trim35Q8C006 Atg7-207ENSMUST00000182428 2264 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Trim35Q8C006 Hnrnpa1-201ENSMUST00000036004 1918 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Trim35Q8C006 Hp-201ENSMUST00000074898 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Trim35Q8C006 Nfkb1-206ENSMUST00000164430 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Trim35Q8C006 Olfr1080-201ENSMUST00000213185 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Trim35Q8C006 Crhr2-201ENSMUST00000003568 2695 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Trim35Q8C006 Uggt2-212ENSMUST00000156203 6456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Trim35Q8C006 Sp3-202ENSMUST00000102689 4181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Trim35Q8C006 Cyp2ab1-205ENSMUST00000182741 1497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Trim35Q8C006 Bcl7a-201ENSMUST00000031391 4718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Trim35Q8C006 Hspa4l-208ENSMUST00000204702 9479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Trim35Q8C006 Mff-209ENSMUST00000160972 1358 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Trim35Q8C006 Rbm4-206ENSMUST00000180248 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Trim35Q8C006 Gm35722-201ENSMUST00000218270 1625 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Trim35Q8C006 Nudt18-202ENSMUST00000228554 3619 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
Trim35Q8C006 Nr3c1-203ENSMUST00000115567 6436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Trim35Q8C006 Pex12-207ENSMUST00000176518 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Trim35Q8C006 Fn1-211ENSMUST00000187938 7965 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Trim35Q8C006 Rbm42-201ENSMUST00000042726 1784 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Trim35Q8C006 Zbtb44-205ENSMUST00000216649 3157 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Trim35Q8C006 Mir698-201ENSMUST00000102164 109 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
Trim35Q8C006 1700037H04Rik-202ENSMUST00000103188 1241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Trim35Q8C006 Nedd8-201ENSMUST00000010520 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Trim35Q8C006 Fam53b-205ENSMUST00000106166 1270 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Trim35Q8C006 Pop7-202ENSMUST00000111035 988 ntAPPRIS P1 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Trim35Q8C006 4933417A18Rik-201ENSMUST00000160279 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Trim35Q8C006 Atp5j2-202ENSMUST00000161741 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Trim35Q8C006 Gm10535-201ENSMUST00000182275 915 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Trim35Q8C006 Gm28113-201ENSMUST00000188280 229 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
Trim35Q8C006 Gm29389-201ENSMUST00000191562 352 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
Trim35Q8C006 Gm43350-201ENSMUST00000196382 711 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
Trim35Q8C006 Gm44253-201ENSMUST00000203387 628 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
Trim35Q8C006 Gm6064-201ENSMUST00000203999 454 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
Trim35Q8C006 Gm19078-201ENSMUST00000206311 727 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
Trim35Q8C006 Olfr856-ps1-201ENSMUST00000212177 948 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
Trim35Q8C006 Gm32926-202ENSMUST00000215162 1176 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Trim35Q8C006 Olfr1010-201ENSMUST00000216831 1270 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Trim35Q8C006 Gm18041-201ENSMUST00000218210 618 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
Trim35Q8C006 AC155644.1-201ENSMUST00000218527 890 ntTSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
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Trim35Q8C006 Vmn1r86-201ENSMUST00000094828 951 ntAPPRIS P2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Trim35Q8C006 Ubqln1-202ENSMUST00000076454 3561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Trim35Q8C006 Uimc1-202ENSMUST00000099496 1678 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Trim35Q8C006 Fam171a1-201ENSMUST00000062934 4129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Trim35Q8C006 Sgsm3-208ENSMUST00000139517 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Trim35Q8C006 4930543E12Rik-202ENSMUST00000210408 1429 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Trim35Q8C006 Ttc1-201ENSMUST00000048578 1438 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Trim35Q8C006 Vcpip1-201ENSMUST00000057438 9749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Trim35Q8C006 Kyat1-204ENSMUST00000113661 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Trim35Q8C006 Cad-201ENSMUST00000013773 7137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Trim35Q8C006 Ppt2-209ENSMUST00000171121 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Trim35Q8C006 Gm29358-201ENSMUST00000186510 1734 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Trim35Q8C006 Gm28175-202ENSMUST00000209336 1477 ntTSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Trim35Q8C006 Plch2-206ENSMUST00000135665 4349 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Trim35Q8C006 Tmem181b-ps-203ENSMUST00000188746 1626 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Trim35Q8C006 Gm27196-201ENSMUST00000184787 2582 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Trim35Q8C006 Muc6-202ENSMUST00000189314 5087 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Trim35Q8C006 Zscan22-203ENSMUST00000119989 2087 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
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Trim35Q8C006 Wdr81-204ENSMUST00000173320 6908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
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Trim35Q8C006 Tmtc3-202ENSMUST00000099318 2794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
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Trim35Q8C006 Pitpnm3-201ENSMUST00000075258 6555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Trim35Q8C006 Zfp809-206ENSMUST00000215902 1800 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
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Trim35Q8C006 Gm11555-202ENSMUST00000104929 638 ntAPPRIS P1 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Trim35Q8C006 Apex2-202ENSMUST00000112719 969 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Trim35Q8C006 Gm12924-201ENSMUST00000121747 318 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Trim35Q8C006 Gm22158-201ENSMUST00000158411 126 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Trim35Q8C006 Fbxw4-209ENSMUST00000162433 789 ntTSL 3 BASIC13.35□□□□□ -0.27
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Trim35Q8C006 Astx1c-201ENSMUST00000177724 1150 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Trim35Q8C006 Wdr53-204ENSMUST00000178573 1153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Trim35Q8C006 Astx1b-201ENSMUST00000178608 1150 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Trim35Q8C006 Astx2-201ENSMUST00000179135 1150 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Trim35Q8C006 Astx1a-201ENSMUST00000179529 1150 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Trim35Q8C006 Astx5-201ENSMUST00000179723 1150 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Trim35Q8C006 Polr2k-202ENSMUST00000180159 489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Trim35Q8C006 Astx6-201ENSMUST00000180281 1150 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Trim35Q8C006 Gm27701-201ENSMUST00000184498 110 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Trim35Q8C006 Gm28889-201ENSMUST00000185350 959 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Trim35Q8C006 Mrgprb13-201ENSMUST00000188191 985 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Trim35Q8C006 Olfr1025-ps1-201ENSMUST00000188749 921 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Trim35Q8C006 Gm28893-201ENSMUST00000190951 1108 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Trim35Q8C006 4930432H08Rik-201ENSMUST00000198220 1284 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Trim35Q8C006 Amd-ps5-201ENSMUST00000198406 989 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Trim35Q8C006 D5Ertd615e-203ENSMUST00000198493 1032 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Trim35Q8C006 A930014E10Rik-201ENSMUST00000205115 546 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Trim35Q8C006 Gm4921-201ENSMUST00000219804 992 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Trim35Q8C006 AC154595.3-201ENSMUST00000224579 384 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Trim35Q8C006 Ifitm3-201ENSMUST00000026565 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
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