Protein–RNA interactions for Protein: Q8BVL3

Snx17, Sorting nexin-17, mousemouse

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Length 470 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx17Q8BVL3 Uggt2-212ENSMUST00000156203 6456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Snx17Q8BVL3 Cap2-201ENSMUST00000021802 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Snx17Q8BVL3 Intu-202ENSMUST00000091186 6387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Snx17Q8BVL3 Foxh1-201ENSMUST00000037824 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Snx17Q8BVL3 Gzf1-201ENSMUST00000028928 4232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Snx17Q8BVL3 Gm21759-201ENSMUST00000178345 1828 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Snx17Q8BVL3 Gm10728-201ENSMUST00000194292 1829 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Snx17Q8BVL3 Vps4b-202ENSMUST00000112736 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Snx17Q8BVL3 Pyroxd1-201ENSMUST00000041852 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Snx17Q8BVL3 Gtf2ird1-224ENSMUST00000202280 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Snx17Q8BVL3 Arfgap1-202ENSMUST00000108859 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Snx17Q8BVL3 Olfm4-201ENSMUST00000088735 1640 ntTSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Snx17Q8BVL3 Armcx1-205ENSMUST00000113199 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Snx17Q8BVL3 4732471J01Rik-204ENSMUST00000206436 2430 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Snx17Q8BVL3 N4bp2l1-201ENSMUST00000016279 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Snx17Q8BVL3 Olfr1411-203ENSMUST00000216444 1901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Snx17Q8BVL3 Klhl26-205ENSMUST00000210250 2974 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Snx17Q8BVL3 Rapgef6-202ENSMUST00000101206 5864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Snx17Q8BVL3 Otx1-201ENSMUST00000006071 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Snx17Q8BVL3 Bcar3-201ENSMUST00000029766 3311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Snx17Q8BVL3 Fam13b-201ENSMUST00000040506 3343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Snx17Q8BVL3 Prickle1-202ENSMUST00000109255 4144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Snx17Q8BVL3 Accs-201ENSMUST00000041593 2036 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Snx17Q8BVL3 Fn1-201ENSMUST00000055226 8315 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Snx17Q8BVL3 Gm13288-201ENSMUST00000094977 2850 ntAPPRIS P1 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Snx17Q8BVL3 Ccdc89-201ENSMUST00000061391 2093 ntAPPRIS P1 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Snx17Q8BVL3 Lrrc18-204ENSMUST00000120951 1511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Snx17Q8BVL3 Gm43447-201ENSMUST00000198471 1535 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Snx17Q8BVL3 Taf1c-201ENSMUST00000093099 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Snx17Q8BVL3 BC055324-202ENSMUST00000097493 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Snx17Q8BVL3 Rpl7a-201ENSMUST00000102898 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Snx17Q8BVL3 Oprl1-204ENSMUST00000108767 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Snx17Q8BVL3 Rbfox1-202ENSMUST00000115841 1191 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Snx17Q8BVL3 Gm14993-201ENSMUST00000121180 164 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Snx17Q8BVL3 Gm14397-201ENSMUST00000124728 576 ntTSL 3 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Snx17Q8BVL3 Gm14222-201ENSMUST00000128681 575 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Snx17Q8BVL3 Gm14198-201ENSMUST00000153208 948 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Snx17Q8BVL3 Dydc1-202ENSMUST00000161837 829 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Snx17Q8BVL3 Gm28913-201ENSMUST00000186240 364 ntTSL 3 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Snx17Q8BVL3 Gm37638-201ENSMUST00000194337 1123 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Snx17Q8BVL3 Gm43695-201ENSMUST00000196545 196 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Snx17Q8BVL3 Gm43163-201ENSMUST00000196571 442 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Snx17Q8BVL3 Gm5340-201ENSMUST00000203733 880 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Snx17Q8BVL3 Nutf2-202ENSMUST00000212042 645 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Snx17Q8BVL3 Cplx3-203ENSMUST00000217015 540 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Snx17Q8BVL3 AC153152.3-201ENSMUST00000222188 1135 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Snx17Q8BVL3 CT010506.1-201ENSMUST00000223673 349 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Snx17Q8BVL3 Fth1-201ENSMUST00000025563 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Snx17Q8BVL3 Kif16b-201ENSMUST00000043589 6383 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Snx17Q8BVL3 Olfr981-201ENSMUST00000059859 997 ntAPPRIS P1 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Snx17Q8BVL3 Tpm3-rs7-201ENSMUST00000072359 2147 ntAPPRIS P1 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Snx17Q8BVL3 Oxsm-202ENSMUST00000112624 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Snx17Q8BVL3 Gbf1-201ENSMUST00000026254 6450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Snx17Q8BVL3 Bbip1-201ENSMUST00000135402 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Snx17Q8BVL3 Cd34-201ENSMUST00000016638 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Snx17Q8BVL3 Stat3-203ENSMUST00000127638 4516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Snx17Q8BVL3 Fam83h-201ENSMUST00000060807 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Snx17Q8BVL3 Tmcc2-206ENSMUST00000142609 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Snx17Q8BVL3 Irf8-201ENSMUST00000047737 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Snx17Q8BVL3 Ccng2-202ENSMUST00000121127 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Snx17Q8BVL3 Spg20-202ENSMUST00000107971 3567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Snx17Q8BVL3 Parp3-202ENSMUST00000112479 2030 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Snx17Q8BVL3 Slc14a1-203ENSMUST00000160639 2047 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Snx17Q8BVL3 Rpl9-204ENSMUST00000127874 2690 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Snx17Q8BVL3 Arhgef2-229ENSMUST00000177303 3000 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Snx17Q8BVL3 Gm6189-201ENSMUST00000164487 2082 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Snx17Q8BVL3 Tmem186-201ENSMUST00000052505 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Snx17Q8BVL3 Gm37348-201ENSMUST00000193104 1789 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Snx17Q8BVL3 Gm3755-201ENSMUST00000169555 1462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Snx17Q8BVL3 Slitrk3-201ENSMUST00000059407 3587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Snx17Q8BVL3 Satb2-202ENSMUST00000114415 5805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Snx17Q8BVL3 Gm26531-201ENSMUST00000181727 1967 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Snx17Q8BVL3 Brd3-202ENSMUST00000077737 5272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Snx17Q8BVL3 Art5-202ENSMUST00000106934 843 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Snx17Q8BVL3 Gm12036-201ENSMUST00000120008 530 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Snx17Q8BVL3 Gm14395-201ENSMUST00000120494 563 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Snx17Q8BVL3 Snrnp25-202ENSMUST00000121182 659 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Snx17Q8BVL3 Acat3-202ENSMUST00000160378 987 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Snx17Q8BVL3 Gas5-224ENSMUST00000162558 502 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Snx17Q8BVL3 Gm16938-201ENSMUST00000180517 464 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Snx17Q8BVL3 Gm9081-201ENSMUST00000182346 991 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Snx17Q8BVL3 Gm19015-201ENSMUST00000184002 1189 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Snx17Q8BVL3 Mrpl20-206ENSMUST00000185148 494 ntTSL 3 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Snx17Q8BVL3 Gm28937-201ENSMUST00000185413 695 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Snx17Q8BVL3 Gm29400-201ENSMUST00000187208 695 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Snx17Q8BVL3 Gm28662-201ENSMUST00000188446 695 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Snx17Q8BVL3 Gm28251-201ENSMUST00000188835 695 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Snx17Q8BVL3 Gm37318-201ENSMUST00000194325 695 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Snx17Q8BVL3 Gm38017-201ENSMUST00000194768 695 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Snx17Q8BVL3 Ighv1-2-201ENSMUST00000195325 378 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Snx17Q8BVL3 Mrpl30-207ENSMUST00000195373 587 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Snx17Q8BVL3 Gm37287-201ENSMUST00000195449 695 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Snx17Q8BVL3 Gm37793-201ENSMUST00000195548 695 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Snx17Q8BVL3 Gm29208-205ENSMUST00000214517 1056 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Snx17Q8BVL3 AC147241.1-201ENSMUST00000222173 785 ntTSL 3 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Snx17Q8BVL3 CT573047.1-201ENSMUST00000223652 851 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Snx17Q8BVL3 Gm14005-208ENSMUST00000223654 681 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Snx17Q8BVL3 Tex30-201ENSMUST00000027215 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Snx17Q8BVL3 H3f3a-201ENSMUST00000081026 888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Snx17Q8BVL3 Crhr2-208ENSMUST00000212633 2041 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.6 ms