Protein–RNA interactions for Protein: Q8BME9

Cbln4, Cerebellin-4, mousemouse

Predictions only

Length 198 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cbln4Q8BME9 Neil1-201ENSMUST00000034842 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Cbln4Q8BME9 Lgals1-201ENSMUST00000089377 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Cbln4Q8BME9 Gm5965-201ENSMUST00000009191 588 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Cbln4Q8BME9 Zc3hc1-203ENSMUST00000115184 1504 ntTSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Cbln4Q8BME9 Apol7c-201ENSMUST00000062562 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Cbln4Q8BME9 Prpf40b-208ENSMUST00000136980 3047 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Cbln4Q8BME9 Acvrl1-205ENSMUST00000120754 3506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Cbln4Q8BME9 Zfp248-205ENSMUST00000161519 2243 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Cbln4Q8BME9 Myo18a-205ENSMUST00000100794 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Cbln4Q8BME9 Zfp536-202ENSMUST00000175941 4423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Cbln4Q8BME9 Cdc42ep2-201ENSMUST00000055458 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Cbln4Q8BME9 Nrsn2-201ENSMUST00000079278 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Cbln4Q8BME9 Rims1-206ENSMUST00000115273 6107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Cbln4Q8BME9 Vps16-201ENSMUST00000028900 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Cbln4Q8BME9 Gm14123-201ENSMUST00000156345 2658 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Cbln4Q8BME9 Mob1a-201ENSMUST00000038658 4119 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Cbln4Q8BME9 Zbtb6-202ENSMUST00000112932 5077 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.15□□□□□ -0.79
Cbln4Q8BME9 Plpbp-201ENSMUST00000033875 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Cbln4Q8BME9 Neurod6-201ENSMUST00000044767 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Cbln4Q8BME9 Ccdc187-201ENSMUST00000057224 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Cbln4Q8BME9 Iqsec2-201ENSMUST00000096275 5252 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.15□□□□□ -0.79
Cbln4Q8BME9 Gipr-201ENSMUST00000094790 2856 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.79
Cbln4Q8BME9 2010315B03Rik-202ENSMUST00000177714 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Cbln4Q8BME9 Sufu-201ENSMUST00000039922 4522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Cbln4Q8BME9 Slc7a7-201ENSMUST00000000984 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Cbln4Q8BME9 Scn5a-202ENSMUST00000117911 8453 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Cbln4Q8BME9 Zfp783-204ENSMUST00000130490 4419 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Cbln4Q8BME9 Cdc20b-201ENSMUST00000109244 1620 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.79
Cbln4Q8BME9 Avpr2-202ENSMUST00000101470 2787 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Cbln4Q8BME9 Npnt-203ENSMUST00000093971 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Cbln4Q8BME9 Cers6-201ENSMUST00000028426 7038 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Cbln4Q8BME9 Lef1-204ENSMUST00000106341 3357 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Cbln4Q8BME9 Lef1-202ENSMUST00000066849 3398 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Cbln4Q8BME9 Slc10a7-201ENSMUST00000034111 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Cbln4Q8BME9 Ehbp1l1-202ENSMUST00000075606 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Cbln4Q8BME9 Dpep1-201ENSMUST00000019422 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Cbln4Q8BME9 Klhl14-202ENSMUST00000122333 4423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Cbln4Q8BME9 Gm10152-201ENSMUST00000193475 1344 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Cbln4Q8BME9 Susd3-201ENSMUST00000021816 1317 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Cbln4Q8BME9 Telo2-202ENSMUST00000115181 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Cbln4Q8BME9 4930588K23Rik-201ENSMUST00000156827 1963 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Cbln4Q8BME9 Tgfb2-206ENSMUST00000195201 3485 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Cbln4Q8BME9 Ebp-201ENSMUST00000033509 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Cbln4Q8BME9 Grk4-202ENSMUST00000074651 3234 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Cbln4Q8BME9 Pde6b-201ENSMUST00000031456 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Cbln4Q8BME9 Taf6l-202ENSMUST00000010249 848 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Cbln4Q8BME9 Rab15-203ENSMUST00000121716 739 ntTSL 3 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Cbln4Q8BME9 Gm14235-201ENSMUST00000142445 366 ntTSL 3 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Cbln4Q8BME9 Gm15722-201ENSMUST00000159271 661 ntTSL 3 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Cbln4Q8BME9 Cldn16-202ENSMUST00000161053 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Cbln4Q8BME9 Gm19459-201ENSMUST00000176240 835 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Cbln4Q8BME9 Ssty2-201ENSMUST00000179136 684 ntAPPRIS P1 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Cbln4Q8BME9 Cyb561-206ENSMUST00000184086 1130 ntTSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Cbln4Q8BME9 Gm28913-201ENSMUST00000186240 364 ntTSL 3 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Cbln4Q8BME9 Ssty2-202ENSMUST00000190565 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Cbln4Q8BME9 Gm38228-201ENSMUST00000193169 1293 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Cbln4Q8BME9 Tagln3-201ENSMUST00000096057 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Cbln4Q8BME9 Gm26684-202ENSMUST00000228229 8257 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Cbln4Q8BME9 Trpm1-219ENSMUST00000206314 2323 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Cbln4Q8BME9 Poll-201ENSMUST00000026239 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Cbln4Q8BME9 Armcx2-201ENSMUST00000035559 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Cbln4Q8BME9 Exosc1-202ENSMUST00000112123 1499 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Cbln4Q8BME9 Cldn12-201ENSMUST00000060947 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Cbln4Q8BME9 Dip2c-201ENSMUST00000166299 4822 ntTSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Cbln4Q8BME9 Cyp2a12-201ENSMUST00000075552 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Cbln4Q8BME9 Ralgps2-209ENSMUST00000189316 2924 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Cbln4Q8BME9 Rassf4-201ENSMUST00000035842 6460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Cbln4Q8BME9 Gm34785-201ENSMUST00000222571 4582 ntTSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Cbln4Q8BME9 Gm44942-201ENSMUST00000096093 2072 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Cbln4Q8BME9 Grip1-205ENSMUST00000105262 4996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Cbln4Q8BME9 Gm9530-201ENSMUST00000181160 3281 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Cbln4Q8BME9 Nsd3-208ENSMUST00000146919 3652 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Cbln4Q8BME9 Slc39a6-201ENSMUST00000070726 3882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Cbln4Q8BME9 Dgkb-205ENSMUST00000221176 1439 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Cbln4Q8BME9 Tmc4-202ENSMUST00000121743 2204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Cbln4Q8BME9 Mrpl45-201ENSMUST00000019026 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Cbln4Q8BME9 BC017643-201ENSMUST00000038709 2417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Cbln4Q8BME9 Fuk-201ENSMUST00000041382 3838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Cbln4Q8BME9 Grik3-201ENSMUST00000030676 8973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Cbln4Q8BME9 Adgre5-208ENSMUST00000166939 2980 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Cbln4Q8BME9 Adgre5-201ENSMUST00000002964 2986 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Cbln4Q8BME9 Lsamp-208ENSMUST00000189358 2766 ntTSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Cbln4Q8BME9 Mrps17-206ENSMUST00000121339 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Cbln4Q8BME9 AC122291.1-201ENSMUST00000228937 5748 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Cbln4Q8BME9 Ift140-201ENSMUST00000024983 5489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Cbln4Q8BME9 Gm2420-201ENSMUST00000119864 2149 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Cbln4Q8BME9 Ggt1-208ENSMUST00000134503 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Cbln4Q8BME9 Mapkapk5-204ENSMUST00000111783 1513 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Cbln4Q8BME9 AC126257.1-201ENSMUST00000213195 1536 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Cbln4Q8BME9 Zscan29-201ENSMUST00000079024 2465 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Cbln4Q8BME9 Epb41l1-206ENSMUST00000109577 6251 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Cbln4Q8BME9 Folr1-203ENSMUST00000106983 1307 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Cbln4Q8BME9 Ptgdr-201ENSMUST00000095959 3187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Cbln4Q8BME9 Stat5b-202ENSMUST00000107358 5213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Cbln4Q8BME9 Kcnj5-203ENSMUST00000216033 2440 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Cbln4Q8BME9 Bpnt1-201ENSMUST00000027916 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Cbln4Q8BME9 Slc7a3-201ENSMUST00000073927 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Cbln4Q8BME9 Pigm-201ENSMUST00000052455 7554 ntAPPRIS P1 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Cbln4Q8BME9 Trappc5-202ENSMUST00000207787 4411 ntAPPRIS P1 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Cbln4Q8BME9 Ntpcr-202ENSMUST00000065135 1497 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.1 ms