Protein–RNA interactions for Protein: Q8BH01

Tmco3, Transmembrane and coiled-coil domain-containing protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 678 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmco3Q8BH01 Far2-201ENSMUST00000032443 3480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Tmco3Q8BH01 Trim50-202ENSMUST00000111180 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Tmco3Q8BH01 Thoc6-203ENSMUST00000115489 1083 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Tmco3Q8BH01 Rbm3-ps-201ENSMUST00000121422 465 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Tmco3Q8BH01 C030047K22Rik-201ENSMUST00000150382 1164 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Tmco3Q8BH01 Hspb9-201ENSMUST00000017976 652 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Tmco3Q8BH01 Gm7895-201ENSMUST00000187459 1173 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Tmco3Q8BH01 Gm29233-201ENSMUST00000190311 281 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Tmco3Q8BH01 Gm5565-201ENSMUST00000199463 1162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Tmco3Q8BH01 Ube2a-202ENSMUST00000200835 911 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Tmco3Q8BH01 Ube2a-209ENSMUST00000202991 715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Tmco3Q8BH01 Gm33115-201ENSMUST00000220913 743 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Tmco3Q8BH01 Ccs-201ENSMUST00000037246 1057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Tmco3Q8BH01 Olfr171-201ENSMUST00000079891 945 ntAPPRIS P2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Tmco3Q8BH01 Coq7-202ENSMUST00000098090 1215 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Tmco3Q8BH01 Trub2-201ENSMUST00000048044 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Tmco3Q8BH01 Atg9b-201ENSMUST00000059401 3902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Tmco3Q8BH01 Nmbr-201ENSMUST00000020015 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Tmco3Q8BH01 Astl-201ENSMUST00000059839 2377 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Tmco3Q8BH01 Ephb2-203ENSMUST00000105846 3653 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Tmco3Q8BH01 Mmel1-203ENSMUST00000105634 2669 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Tmco3Q8BH01 Chd3-202ENSMUST00000108661 7261 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Tmco3Q8BH01 Mrps17-206ENSMUST00000121339 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Tmco3Q8BH01 Gm45272-203ENSMUST00000211111 1693 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Tmco3Q8BH01 4933431M02Rik-201ENSMUST00000203905 1432 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Tmco3Q8BH01 Camk1d-201ENSMUST00000044009 6962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Tmco3Q8BH01 Enam-201ENSMUST00000031222 5483 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Tmco3Q8BH01 Aldoa-203ENSMUST00000106348 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Tmco3Q8BH01 Cyp2j13-203ENSMUST00000107078 1493 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Tmco3Q8BH01 Ascc1-202ENSMUST00000164083 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Tmco3Q8BH01 Ghsr-201ENSMUST00000057186 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Tmco3Q8BH01 Itsn2-211ENSMUST00000219007 4977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Tmco3Q8BH01 Mmp25-201ENSMUST00000024696 3373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Tmco3Q8BH01 Grin2b-202ENSMUST00000111905 7484 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Tmco3Q8BH01 Txlna-201ENSMUST00000046425 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Tmco3Q8BH01 AC153506.1-201ENSMUST00000218768 2915 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Tmco3Q8BH01 Pip5k1b-202ENSMUST00000112673 2387 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Tmco3Q8BH01 Eif3a-201ENSMUST00000025955 5176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Tmco3Q8BH01 Armcx4-201ENSMUST00000124226 7996 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Tmco3Q8BH01 Cars-201ENSMUST00000010899 3222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Tmco3Q8BH01 A230072I06Rik-201ENSMUST00000098935 1839 ntAPPRIS P1 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Tmco3Q8BH01 Rbm3-204ENSMUST00000115617 1152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Tmco3Q8BH01 Tex22-201ENSMUST00000012355 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Tmco3Q8BH01 Gm23119-201ENSMUST00000158610 140 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Tmco3Q8BH01 Armc2-208ENSMUST00000162405 1135 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Tmco3Q8BH01 Gm28882-201ENSMUST00000185504 314 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Tmco3Q8BH01 Gm38341-201ENSMUST00000195357 515 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Tmco3Q8BH01 Hax1-206ENSMUST00000197786 857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Tmco3Q8BH01 Gm43758-201ENSMUST00000199500 367 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Tmco3Q8BH01 Gm44958-201ENSMUST00000203734 736 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Tmco3Q8BH01 Rps3a1-201ENSMUST00000029722 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Tmco3Q8BH01 Gm3402-201ENSMUST00000036715 981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Tmco3Q8BH01 Syngr4-201ENSMUST00000039049 967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Tmco3Q8BH01 U2af1l4-201ENSMUST00000043273 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Tmco3Q8BH01 Pjvk-201ENSMUST00000099986 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Tmco3Q8BH01 Trim9-202ENSMUST00000110522 4405 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Tmco3Q8BH01 Stom-201ENSMUST00000028241 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Tmco3Q8BH01 Serinc4-202ENSMUST00000110613 2240 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Tmco3Q8BH01 Ngfr-201ENSMUST00000000122 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Tmco3Q8BH01 Kifc5b-201ENSMUST00000078961 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Tmco3Q8BH01 Spats2l-201ENSMUST00000163239 2313 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Tmco3Q8BH01 Tirap-203ENSMUST00000176531 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Tmco3Q8BH01 Pdzd7-203ENSMUST00000169459 3903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Tmco3Q8BH01 Zscan10-201ENSMUST00000095595 2698 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Tmco3Q8BH01 Ces4a-201ENSMUST00000161289 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Tmco3Q8BH01 Oas1f-201ENSMUST00000057814 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Tmco3Q8BH01 AC138329.2-201ENSMUST00000225579 1842 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Tmco3Q8BH01 Trim23-203ENSMUST00000069187 3546 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Tmco3Q8BH01 Kalrn-209ENSMUST00000114963 3207 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Tmco3Q8BH01 Esam-201ENSMUST00000002011 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Tmco3Q8BH01 Tfr2-201ENSMUST00000031729 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Tmco3Q8BH01 Slc38a8-201ENSMUST00000036748 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Tmco3Q8BH01 Tnfaip8l3-201ENSMUST00000098760 4403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Tmco3Q8BH01 Sp4-203ENSMUST00000222314 2677 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Tmco3Q8BH01 Sgsm1-203ENSMUST00000112324 1102 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Tmco3Q8BH01 Rhox2c-201ENSMUST00000115190 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Tmco3Q8BH01 0610037L13Rik-205ENSMUST00000119394 741 ntTSL 3 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Tmco3Q8BH01 Gm14726-201ENSMUST00000120623 896 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Tmco3Q8BH01 Gm15395-201ENSMUST00000153724 702 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Tmco3Q8BH01 Gm26542-201ENSMUST00000180443 1235 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Tmco3Q8BH01 1700120C18Rik-201ENSMUST00000182952 985 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Tmco3Q8BH01 Gm31256-201ENSMUST00000194705 506 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Tmco3Q8BH01 Sox2ot-207ENSMUST00000196987 727 ntTSL 3 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Tmco3Q8BH01 Phgdh-ps1-201ENSMUST00000207540 754 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Tmco3Q8BH01 AC113031.8-201ENSMUST00000227856 631 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Tmco3Q8BH01 Sprr2a2-202ENSMUST00000090871 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Tmco3Q8BH01 Cd37-202ENSMUST00000098461 1227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Tmco3Q8BH01 AL732309.1-201ENSMUST00000228627 2045 ntAPPRIS P1 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Tmco3Q8BH01 Topors-201ENSMUST00000042575 3856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Tmco3Q8BH01 1700110I01Rik-201ENSMUST00000112775 1671 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Tmco3Q8BH01 Lman1l-202ENSMUST00000093832 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Tmco3Q8BH01 1700019D03Rik-202ENSMUST00000114492 3565 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Tmco3Q8BH01 Trpv4-205ENSMUST00000112225 3226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Tmco3Q8BH01 Gm43963-201ENSMUST00000203466 2488 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Tmco3Q8BH01 Sfrp4-203ENSMUST00000222464 4049 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Tmco3Q8BH01 Sptan1-204ENSMUST00000113717 7958 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Tmco3Q8BH01 Klk1b16-201ENSMUST00000005933 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Tmco3Q8BH01 H2-T22-203ENSMUST00000080015 1761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Tmco3Q8BH01 Olfr5-202ENSMUST00000209866 2980 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Tmco3Q8BH01 Tmem140-201ENSMUST00000074949 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.1 ms