Protein–RNA interactions for Protein: Q8BFV3

Dusp4, Dual specificity protein phosphatase 4, mousemouse

Predictions only

Length 398 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dusp4Q8BFV3 2010109P13Rik-201ENSMUST00000204605 392 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Dusp4Q8BFV3 Gm34908-201ENSMUST00000207222 569 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Dusp4Q8BFV3 Fcer2a-206ENSMUST00000208438 930 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Dusp4Q8BFV3 Fcer2a-208ENSMUST00000208603 930 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Dusp4Q8BFV3 E330011O21Rik-205ENSMUST00000211317 1062 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Dusp4Q8BFV3 CT485606.1-201ENSMUST00000213187 878 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Dusp4Q8BFV3 Gm3318-201ENSMUST00000217604 1183 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Dusp4Q8BFV3 AC165260.2-203ENSMUST00000224237 336 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Dusp4Q8BFV3 CT030653.1-201ENSMUST00000224382 1279 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Dusp4Q8BFV3 Rasl11a-201ENSMUST00000031646 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Dusp4Q8BFV3 Urgcp-202ENSMUST00000093362 5089 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Dusp4Q8BFV3 Rtbdn-204ENSMUST00000152378 2322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Dusp4Q8BFV3 Sdf4-201ENSMUST00000050078 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Dusp4Q8BFV3 Agtrap-201ENSMUST00000030865 3996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Dusp4Q8BFV3 Gm43267-201ENSMUST00000199664 1796 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Dusp4Q8BFV3 AC129931.1-201ENSMUST00000228865 1861 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Dusp4Q8BFV3 Pcdh8-204ENSMUST00000195355 3704 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Dusp4Q8BFV3 Nhlh2-203ENSMUST00000198675 3943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Dusp4Q8BFV3 Nhlrc2-201ENSMUST00000071423 3934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Dusp4Q8BFV3 Arhgef2-203ENSMUST00000170653 4238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Dusp4Q8BFV3 5730409E04Rik-202ENSMUST00000164362 2855 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Dusp4Q8BFV3 G630016G05Rik-202ENSMUST00000156095 3398 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Dusp4Q8BFV3 Mxd3-201ENSMUST00000021941 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Dusp4Q8BFV3 Fbf1-202ENSMUST00000106435 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Dusp4Q8BFV3 Hist2h4-201ENSMUST00000171473 1630 ntAPPRIS P1 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Dusp4Q8BFV3 A730071L15Rik-201ENSMUST00000181545 1615 ntAPPRIS P1 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Dusp4Q8BFV3 Zfp809-206ENSMUST00000215902 1800 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Dusp4Q8BFV3 Padi6-201ENSMUST00000038749 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Dusp4Q8BFV3 AC156031.2-201ENSMUST00000213107 3310 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Dusp4Q8BFV3 Slc25a24-201ENSMUST00000029477 3431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Dusp4Q8BFV3 Psd2-205ENSMUST00000176873 4375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Dusp4Q8BFV3 Tfcp2-201ENSMUST00000009877 3250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Dusp4Q8BFV3 Sdr9c7-201ENSMUST00000047134 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Dusp4Q8BFV3 Fam45a-202ENSMUST00000119633 2267 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Dusp4Q8BFV3 Ube2q2-203ENSMUST00000122441 2081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Dusp4Q8BFV3 Rad51ap1-202ENSMUST00000112221 1871 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Dusp4Q8BFV3 Snhg17-203ENSMUST00000141809 1553 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Dusp4Q8BFV3 Phkg2-201ENSMUST00000033086 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Dusp4Q8BFV3 Pex1-201ENSMUST00000006061 4433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Dusp4Q8BFV3 Gtf2h5-202ENSMUST00000100955 879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Dusp4Q8BFV3 Gm22920-201ENSMUST00000102175 109 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Dusp4Q8BFV3 Gm11836-201ENSMUST00000121022 441 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Dusp4Q8BFV3 9030204H09Rik-201ENSMUST00000139455 653 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Dusp4Q8BFV3 Gm24398-201ENSMUST00000157870 109 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Dusp4Q8BFV3 Mrpl23-ps1-201ENSMUST00000173086 580 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Dusp4Q8BFV3 9930004E17Rik-201ENSMUST00000180031 498 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Dusp4Q8BFV3 Gm28975-201ENSMUST00000186412 686 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Dusp4Q8BFV3 Gm9116-201ENSMUST00000192400 1018 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Dusp4Q8BFV3 Gm9136-201ENSMUST00000193368 454 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Dusp4Q8BFV3 D5Ertd615e-203ENSMUST00000198493 1032 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Dusp4Q8BFV3 Gm42599-201ENSMUST00000201308 469 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Dusp4Q8BFV3 Lsm3-205ENSMUST00000206947 618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Dusp4Q8BFV3 Gm45856-201ENSMUST00000212752 416 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Dusp4Q8BFV3 Gm33979-201ENSMUST00000219486 691 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Dusp4Q8BFV3 AC160028.1-201ENSMUST00000219645 1095 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Dusp4Q8BFV3 Gm7959-201ENSMUST00000221823 1078 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Dusp4Q8BFV3 Gm4604-201ENSMUST00000025040 390 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Dusp4Q8BFV3 Mgp-201ENSMUST00000032342 617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Dusp4Q8BFV3 Tnfsf13b-201ENSMUST00000033892 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Dusp4Q8BFV3 Sod2-201ENSMUST00000007012 3824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Dusp4Q8BFV3 Tmtc3-201ENSMUST00000058154 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Dusp4Q8BFV3 Pde1c-209ENSMUST00000203372 3147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Dusp4Q8BFV3 Gsdma-201ENSMUST00000017348 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Dusp4Q8BFV3 Klf11-201ENSMUST00000020982 4086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Dusp4Q8BFV3 Trpv6-203ENSMUST00000201471 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Dusp4Q8BFV3 Hspa8-202ENSMUST00000117557 2019 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Dusp4Q8BFV3 D230017M19Rik-201ENSMUST00000180722 3096 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Dusp4Q8BFV3 5530401A14Rik-201ENSMUST00000021044 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Dusp4Q8BFV3 Mrgprg-201ENSMUST00000058092 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Dusp4Q8BFV3 Aldoc-202ENSMUST00000102478 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Dusp4Q8BFV3 Tapbp-201ENSMUST00000025161 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Dusp4Q8BFV3 Wisp1-201ENSMUST00000005255 5097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Dusp4Q8BFV3 Rabgef1-203ENSMUST00000119797 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Dusp4Q8BFV3 Hdac11-201ENSMUST00000041736 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Dusp4Q8BFV3 Kcnt1-212ENSMUST00000197917 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Dusp4Q8BFV3 Capn8-202ENSMUST00000168514 2483 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Dusp4Q8BFV3 Eya1-202ENSMUST00000080664 3426 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Dusp4Q8BFV3 Rnf133-202ENSMUST00000115354 1333 ntAPPRIS P1 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Dusp4Q8BFV3 Tcf12-201ENSMUST00000034755 4621 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Dusp4Q8BFV3 Tgfbr2-201ENSMUST00000035014 3476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Dusp4Q8BFV3 Ank3-201ENSMUST00000047061 2517 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Dusp4Q8BFV3 Gm26841-201ENSMUST00000180725 1787 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Dusp4Q8BFV3 Fancc-217ENSMUST00000163091 2995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Dusp4Q8BFV3 Ptdss2-201ENSMUST00000026568 3624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Dusp4Q8BFV3 A830082K12Rik-201ENSMUST00000123998 2203 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Dusp4Q8BFV3 Map6-201ENSMUST00000068973 3430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Dusp4Q8BFV3 Dlgap4-203ENSMUST00000099145 3402 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Dusp4Q8BFV3 Ky-201ENSMUST00000039390 5837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Dusp4Q8BFV3 Spg20-202ENSMUST00000107971 3567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Dusp4Q8BFV3 Capzb-201ENSMUST00000030518 1390 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Dusp4Q8BFV3 Cacna1g-203ENSMUST00000103166 8104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Dusp4Q8BFV3 Syvn1-207ENSMUST00000156550 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Dusp4Q8BFV3 Apbb2-215ENSMUST00000162349 3362 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Dusp4Q8BFV3 Apbb2-201ENSMUST00000087256 3362 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Dusp4Q8BFV3 Gtf2i-203ENSMUST00000111261 4381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Dusp4Q8BFV3 Gm14193-201ENSMUST00000105067 153 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Dusp4Q8BFV3 Rhox3c-202ENSMUST00000115189 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Dusp4Q8BFV3 2900011O08Rik-202ENSMUST00000118412 954 ntTSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Dusp4Q8BFV3 Gm15004-201ENSMUST00000119192 630 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Dusp4Q8BFV3 Mfsd11-212ENSMUST00000153084 1194 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 90.8 ms