Protein–RNA interactions for Protein: Q80VM3

Ttc29, Tetratricopeptide repeat protein 29, mousemouse

Predictions only

Length 471 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttc29Q80VM3 Mff-209ENSMUST00000160972 1358 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
Ttc29Q80VM3 Agrn-202ENSMUST00000105574 7193 ntTSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.59
Ttc29Q80VM3 Celf2-225ENSMUST00000183091 2177 ntTSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.59
Ttc29Q80VM3 Gm29480-201ENSMUST00000188589 1655 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
Ttc29Q80VM3 Brat1-202ENSMUST00000100505 3431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
Ttc29Q80VM3 Apol7a-203ENSMUST00000175919 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Ttc29Q80VM3 Plcd4-205ENSMUST00000113749 4648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Ttc29Q80VM3 Camsap3-203ENSMUST00000207077 3832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Ttc29Q80VM3 Gm16364-201ENSMUST00000153722 1313 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Ttc29Q80VM3 Ephb6-201ENSMUST00000114732 3762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Ttc29Q80VM3 Cad-204ENSMUST00000201182 6529 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Ttc29Q80VM3 Cntnap1-201ENSMUST00000103109 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Ttc29Q80VM3 Tnnt3-206ENSMUST00000105944 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Ttc29Q80VM3 Tnnt3-210ENSMUST00000105948 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Ttc29Q80VM3 Tnnt3-212ENSMUST00000105950 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Ttc29Q80VM3 Arntl2-203ENSMUST00000111638 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Ttc29Q80VM3 Tpm1-210ENSMUST00000113693 1054 ntTSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Ttc29Q80VM3 Tcf4-205ENSMUST00000114980 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Ttc29Q80VM3 Gm13611-201ENSMUST00000118269 318 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
Ttc29Q80VM3 Rab15-202ENSMUST00000118604 778 ntTSL 3 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Ttc29Q80VM3 Zfp629-204ENSMUST00000128731 823 ntTSL 3 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Ttc29Q80VM3 Gm15722-201ENSMUST00000159271 661 ntTSL 3 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Ttc29Q80VM3 Fbxw4-203ENSMUST00000160003 387 ntTSL 3 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Ttc29Q80VM3 Klhl22-208ENSMUST00000165790 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Ttc29Q80VM3 Tnnt3-224ENSMUST00000169299 1013 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Ttc29Q80VM3 Tnnt3-226ENSMUST00000180152 1067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Ttc29Q80VM3 Gm28375-201ENSMUST00000185304 430 ntTSL 3 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Ttc29Q80VM3 Gm29087-201ENSMUST00000186462 645 ntTSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Ttc29Q80VM3 Gm34767-201ENSMUST00000191813 1062 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
Ttc29Q80VM3 Gm37986-201ENSMUST00000193285 383 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
Ttc29Q80VM3 Gm35986-201ENSMUST00000197370 655 ntTSL 2 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Ttc29Q80VM3 Gm3786-201ENSMUST00000202659 378 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
Ttc29Q80VM3 Gm45484-201ENSMUST00000210310 1141 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
Ttc29Q80VM3 Gm32352-201ENSMUST00000212465 688 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Ttc29Q80VM3 1700027J07Rik-202ENSMUST00000215747 1060 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Ttc29Q80VM3 Gm9797-202ENSMUST00000218003 294 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
Ttc29Q80VM3 Arl8b-201ENSMUST00000032196 4443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Ttc29Q80VM3 Arntl2-201ENSMUST00000080530 1740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Ttc29Q80VM3 Nol4-204ENSMUST00000097651 4549 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Ttc29Q80VM3 Kalrn-201ENSMUST00000076810 8940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Ttc29Q80VM3 A930038B10Rik-202ENSMUST00000181044 3415 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Ttc29Q80VM3 Gm43051-201ENSMUST00000201096 2678 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
Ttc29Q80VM3 Gpr139-201ENSMUST00000084650 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Ttc29Q80VM3 Prkcd-204ENSMUST00000112206 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Ttc29Q80VM3 Clasp1-216ENSMUST00000189738 5373 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Ttc29Q80VM3 Spata13-207ENSMUST00000160973 7467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Ttc29Q80VM3 Wdr17-211ENSMUST00000175915 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Ttc29Q80VM3 4930563D23Rik-201ENSMUST00000062638 2646 ntAPPRIS P1 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Ttc29Q80VM3 Ralgps2-211ENSMUST00000190648 2498 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Ttc29Q80VM3 Nlrp6-203ENSMUST00000183845 4436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Ttc29Q80VM3 Bad-201ENSMUST00000025910 1451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Ttc29Q80VM3 Eif1a-201ENSMUST00000078079 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Ttc29Q80VM3 AC174678.2-201ENSMUST00000156420 3275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Ttc29Q80VM3 Zmynd8-220ENSMUST00000170272 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Ttc29Q80VM3 Pik3cd-203ENSMUST00000105689 3132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Ttc29Q80VM3 Gm14132-201ENSMUST00000117188 1719 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
Ttc29Q80VM3 Cep41-203ENSMUST00000115131 2256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Ttc29Q80VM3 Rara-201ENSMUST00000068133 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Ttc29Q80VM3 Zbtb45-205ENSMUST00000210282 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Ttc29Q80VM3 Ptpn4-201ENSMUST00000064091 10874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Ttc29Q80VM3 Cyb5rl-203ENSMUST00000106758 2516 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Ttc29Q80VM3 Myo18a-205ENSMUST00000100794 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Ttc29Q80VM3 Dgkb-205ENSMUST00000221176 1439 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Ttc29Q80VM3 Avpr2-202ENSMUST00000101470 2787 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Ttc29Q80VM3 Dph6-201ENSMUST00000028640 2632 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Ttc29Q80VM3 Cdk2ap1-202ENSMUST00000111472 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Ttc29Q80VM3 Rpl28-ps3-201ENSMUST00000116058 393 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
Ttc29Q80VM3 Gm7851-201ENSMUST00000117574 323 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
Ttc29Q80VM3 Mrps17-207ENSMUST00000121813 868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Ttc29Q80VM3 Cd63-ps-202ENSMUST00000154992 717 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
Ttc29Q80VM3 Omt2a-203ENSMUST00000166056 1167 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Ttc29Q80VM3 4930562C15Rik-202ENSMUST00000171105 1299 ntTSL 2 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Ttc29Q80VM3 Gm20426-201ENSMUST00000173657 440 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
Ttc29Q80VM3 Ccl4-201ENSMUST00000019074 660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Ttc29Q80VM3 Gm38228-201ENSMUST00000193169 1293 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
Ttc29Q80VM3 Gm21057-202ENSMUST00000206111 512 ntTSL 2 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Ttc29Q80VM3 Gm8959-201ENSMUST00000213150 571 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
Ttc29Q80VM3 Cdk19os-201ENSMUST00000044774 534 ntTSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Ttc29Q80VM3 1700001J03Rik-201ENSMUST00000073721 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Ttc29Q80VM3 Ccdc114-201ENSMUST00000038720 2460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Ttc29Q80VM3 Cdc7-203ENSMUST00000117196 2864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Ttc29Q80VM3 Gpr179-201ENSMUST00000093942 9219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Ttc29Q80VM3 Cd207-201ENSMUST00000037882 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Ttc29Q80VM3 Hdac5-202ENSMUST00000107150 3759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Ttc29Q80VM3 Cisd2-201ENSMUST00000029815 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Ttc29Q80VM3 Zmym1-202ENSMUST00000106099 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Ttc29Q80VM3 Ghsr-201ENSMUST00000057186 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Ttc29Q80VM3 Borcs7-201ENSMUST00000074912 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Ttc29Q80VM3 Igtp-202ENSMUST00000094169 1767 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Ttc29Q80VM3 Dram1-201ENSMUST00000020249 2807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Ttc29Q80VM3 Crym-201ENSMUST00000033198 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Ttc29Q80VM3 Arrb1-201ENSMUST00000032995 3715 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Ttc29Q80VM3 Sypl-201ENSMUST00000020885 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Ttc29Q80VM3 Zfp335-201ENSMUST00000041361 4587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Ttc29Q80VM3 Oasl1-201ENSMUST00000031540 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Ttc29Q80VM3 Traf7-201ENSMUST00000070777 2384 ntTSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Ttc29Q80VM3 Tmem159-201ENSMUST00000033210 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Ttc29Q80VM3 Tmcc3-204ENSMUST00000121471 2614 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Ttc29Q80VM3 Stau1-203ENSMUST00000109236 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Ttc29Q80VM3 Sdr9c7-201ENSMUST00000047134 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.7 ms