Protein–RNA interactions for Protein: Q80U35

Arhgef17, Rho guanine nucleotide exchange factor 17, mousemouse

Predictions only

Length 2,057 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Arhgef17Q80U35 Nrsn2-201ENSMUST00000079278 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Arhgef17Q80U35 Slc27a2-201ENSMUST00000061491 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Arhgef17Q80U35 Stk32b-201ENSMUST00000094836 3458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Arhgef17Q80U35 Gm17213-201ENSMUST00000165161 1360 ntBASIC10.01□□□□□ -0.81
Arhgef17Q80U35 Mylk-201ENSMUST00000023538 7824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Arhgef17Q80U35 Folr1-203ENSMUST00000106983 1307 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
Arhgef17Q80U35 Aurkc-203ENSMUST00000207711 1320 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Arhgef17Q80U35 2610001J05Rik-203ENSMUST00000185219 1606 ntAPPRIS P1 BASIC10□□□□□ -0.81
Arhgef17Q80U35 Edrf1-201ENSMUST00000051169 5424 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
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Arhgef17Q80U35 Rps10-202ENSMUST00000114881 604 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10□□□□□ -0.81
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Arhgef17Q80U35 Gm12856-201ENSMUST00000119471 1293 ntBASIC10□□□□□ -0.81
Arhgef17Q80U35 Gm1848-201ENSMUST00000120711 789 ntBASIC10□□□□□ -0.81
Arhgef17Q80U35 Gm21972-201ENSMUST00000135197 776 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10□□□□□ -0.81
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Arhgef17Q80U35 Ccl4-201ENSMUST00000019074 660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
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Arhgef17Q80U35 Tff2-201ENSMUST00000024826 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
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Arhgef17Q80U35 Rab7-201ENSMUST00000095048 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Arhgef17Q80U35 Dcaf11-202ENSMUST00000117236 2538 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Arhgef17Q80U35 Mcph1-201ENSMUST00000039412 4662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
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Arhgef17Q80U35 Zbtb49-201ENSMUST00000094833 2978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Arhgef17Q80U35 2900041M22Rik-201ENSMUST00000155384 1784 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
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Arhgef17Q80U35 Gdap2-201ENSMUST00000029459 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
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Arhgef17Q80U35 4930557F10Rik-201ENSMUST00000155432 630 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
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Arhgef17Q80U35 Slc16a12-201ENSMUST00000009522 4051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
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Arhgef17Q80U35 Gm45641-201ENSMUST00000209775 452 ntTSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
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Arhgef17Q80U35 Wdr89-201ENSMUST00000062370 2979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
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Arhgef17Q80U35 Clrn1-203ENSMUST00000072551 1662 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Arhgef17Q80U35 Herpud1-201ENSMUST00000034220 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Arhgef17Q80U35 Samd4-201ENSMUST00000022386 4564 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Arhgef17Q80U35 Apol7c-201ENSMUST00000062562 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Arhgef17Q80U35 Prkag2-202ENSMUST00000076306 2838 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Arhgef17Q80U35 Cttnbp2nl-202ENSMUST00000098763 4834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
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Arhgef17Q80U35 Ptch2-201ENSMUST00000030443 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
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