Protein–RNA interactions for Protein: Q7TSS2

Ube2q1, Ubiquitin-conjugating enzyme E2 Q1, mousemouse

Predictions only

Length 422 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ube2q1Q7TSS2 Adcyap1r1-202ENSMUST00000070756 6107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Ube2q1Q7TSS2 Ckmt1-201ENSMUST00000000317 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Ube2q1Q7TSS2 4732471J01Rik-204ENSMUST00000206436 2430 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Ube2q1Q7TSS2 Dnmt3b-206ENSMUST00000103151 3956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Ube2q1Q7TSS2 Cep164-201ENSMUST00000117194 5541 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Ube2q1Q7TSS2 Gm8050-201ENSMUST00000171987 1595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Ube2q1Q7TSS2 Creb3l4-201ENSMUST00000029547 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Ube2q1Q7TSS2 Scarb2-201ENSMUST00000031377 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Ube2q1Q7TSS2 Fam45a-202ENSMUST00000119633 2267 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Ube2q1Q7TSS2 Trmt1-204ENSMUST00000109768 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Ube2q1Q7TSS2 Gm9415-201ENSMUST00000200462 1321 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
Ube2q1Q7TSS2 B3gat1-206ENSMUST00000161431 3858 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Ube2q1Q7TSS2 Tatdn3-203ENSMUST00000110891 1214 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Ube2q1Q7TSS2 Tatdn3-204ENSMUST00000110893 1242 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Ube2q1Q7TSS2 Cidec-203ENSMUST00000113091 785 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Ube2q1Q7TSS2 Adora3-202ENSMUST00000164730 1219 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Ube2q1Q7TSS2 Mir6973a-201ENSMUST00000183646 78 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
Ube2q1Q7TSS2 Nme6-214ENSMUST00000200468 865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Ube2q1Q7TSS2 Gm5996-201ENSMUST00000211110 718 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
Ube2q1Q7TSS2 Adipoq-201ENSMUST00000023593 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Ube2q1Q7TSS2 Mustn1-201ENSMUST00000040715 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Ube2q1Q7TSS2 Grm1-201ENSMUST00000044306 6930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Ube2q1Q7TSS2 Gm16090-201ENSMUST00000130296 1704 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Ube2q1Q7TSS2 Steap2-203ENSMUST00000115425 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Ube2q1Q7TSS2 Gm45012-201ENSMUST00000208323 1666 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Ube2q1Q7TSS2 Gga3-201ENSMUST00000019135 3816 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Ube2q1Q7TSS2 Srrm1-203ENSMUST00000105861 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Ube2q1Q7TSS2 Mta1-202ENSMUST00000069690 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Ube2q1Q7TSS2 Nanos2-201ENSMUST00000063563 1563 ntAPPRIS P1 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Ube2q1Q7TSS2 Pax6-203ENSMUST00000111082 3116 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Ube2q1Q7TSS2 Tktl2-201ENSMUST00000002025 2021 ntAPPRIS P1 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Ube2q1Q7TSS2 Smok4a-201ENSMUST00000074512 1455 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
Ube2q1Q7TSS2 Ankrd13c-201ENSMUST00000040787 3903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Ube2q1Q7TSS2 D230025D16Rik-201ENSMUST00000034361 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Ube2q1Q7TSS2 Atxn10-201ENSMUST00000163242 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Ube2q1Q7TSS2 2610037D02Rik-201ENSMUST00000180852 2449 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Ube2q1Q7TSS2 Bpi-203ENSMUST00000109500 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Ube2q1Q7TSS2 Eno1-201ENSMUST00000080149 1902 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Ube2q1Q7TSS2 Car10-206ENSMUST00000107863 3334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Ube2q1Q7TSS2 Npc1-201ENSMUST00000025279 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Ube2q1Q7TSS2 Enc1-201ENSMUST00000041623 4737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Ube2q1Q7TSS2 Mylk-201ENSMUST00000023538 7824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Ube2q1Q7TSS2 Tmem201-203ENSMUST00000105687 3697 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Ube2q1Q7TSS2 AC107453.4-201ENSMUST00000227068 1817 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
Ube2q1Q7TSS2 Tesmin-203ENSMUST00000142193 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Ube2q1Q7TSS2 Klhl38-201ENSMUST00000022985 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Ube2q1Q7TSS2 Slc9b1-201ENSMUST00000078568 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Ube2q1Q7TSS2 9430015G10Rik-202ENSMUST00000105576 1329 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Ube2q1Q7TSS2 Kcnk13-204ENSMUST00000177549 3075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Ube2q1Q7TSS2 Mpv17l-204ENSMUST00000141971 2155 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Ube2q1Q7TSS2 Trav10d-201ENSMUST00000103646 406 ntAPPRIS P1 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Ube2q1Q7TSS2 Gm25562-201ENSMUST00000104608 133 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
Ube2q1Q7TSS2 Fam3a-204ENSMUST00000114141 1243 ntTSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Ube2q1Q7TSS2 D3Ertd751e-204ENSMUST00000119572 1011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Ube2q1Q7TSS2 Syngr4-202ENSMUST00000120299 722 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Ube2q1Q7TSS2 Mrpl20-202ENSMUST00000130188 442 ntTSL 3 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Ube2q1Q7TSS2 Gm11944-201ENSMUST00000152576 873 ntTSL 3 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Ube2q1Q7TSS2 Gm26272-201ENSMUST00000179241 132 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
Ube2q1Q7TSS2 AU020206-201ENSMUST00000181224 656 ntTSL 2 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Ube2q1Q7TSS2 Gm37452-201ENSMUST00000194416 1160 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
Ube2q1Q7TSS2 Gm45682-201ENSMUST00000209434 1256 ntTSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Ube2q1Q7TSS2 Gm5907-202ENSMUST00000210969 661 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Ube2q1Q7TSS2 Gm2594-201ENSMUST00000214774 742 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
Ube2q1Q7TSS2 CT030652.1-201ENSMUST00000227377 1235 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
Ube2q1Q7TSS2 1600002K03Rik-201ENSMUST00000041882 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Ube2q1Q7TSS2 Gm44241-201ENSMUST00000203230 1662 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
Ube2q1Q7TSS2 Sgms1-212ENSMUST00000151289 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Ube2q1Q7TSS2 Accs-201ENSMUST00000041593 2036 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Ube2q1Q7TSS2 Stk31-201ENSMUST00000024171 3237 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Ube2q1Q7TSS2 Dars2-201ENSMUST00000035430 3619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Ube2q1Q7TSS2 Igf2-204ENSMUST00000105936 3970 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Ube2q1Q7TSS2 Slc8b1-204ENSMUST00000111890 2775 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Ube2q1Q7TSS2 Cfap61-201ENSMUST00000116398 1561 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Ube2q1Q7TSS2 Rab19-201ENSMUST00000031986 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Ube2q1Q7TSS2 Brd3-202ENSMUST00000077737 5272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Ube2q1Q7TSS2 Spred3-201ENSMUST00000048923 4056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Ube2q1Q7TSS2 Slc38a7-204ENSMUST00000212270 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Ube2q1Q7TSS2 Gm5780-201ENSMUST00000217774 1834 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
Ube2q1Q7TSS2 Gm9530-201ENSMUST00000181160 3281 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Ube2q1Q7TSS2 Rab10os-202ENSMUST00000177896 2872 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Ube2q1Q7TSS2 Tmem178b-201ENSMUST00000061740 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Ube2q1Q7TSS2 Rnf40-202ENSMUST00000205694 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Ube2q1Q7TSS2 Kdm5b-201ENSMUST00000047714 8714 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Ube2q1Q7TSS2 Aco1-201ENSMUST00000102973 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Ube2q1Q7TSS2 Gm26551-201ENSMUST00000181262 2432 ntTSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.37
Ube2q1Q7TSS2 Snap29-201ENSMUST00000023449 3429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Ube2q1Q7TSS2 Nek1-201ENSMUST00000034065 5401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Ube2q1Q7TSS2 Osbp2-202ENSMUST00000101632 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.37
Ube2q1Q7TSS2 Ibtk-201ENSMUST00000039213 5650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Ube2q1Q7TSS2 Gm15609-201ENSMUST00000155610 2960 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Ube2q1Q7TSS2 Lrrc8e-201ENSMUST00000053035 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Ube2q1Q7TSS2 Sstr5-202ENSMUST00000165183 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Ube2q1Q7TSS2 Unc119-202ENSMUST00000100755 933 ntTSL 2 BASIC12.71□□□□□ -0.37
Ube2q1Q7TSS2 Mir453-201ENSMUST00000104732 82 ntBASIC12.71□□□□□ -0.37
Ube2q1Q7TSS2 Gm6158-201ENSMUST00000109467 904 ntBASIC12.71□□□□□ -0.37
Ube2q1Q7TSS2 Gm12461-201ENSMUST00000120231 1239 ntBASIC12.71□□□□□ -0.37
Ube2q1Q7TSS2 Gm15329-201ENSMUST00000121408 155 ntBASIC12.71□□□□□ -0.37
Ube2q1Q7TSS2 Gm14165-201ENSMUST00000121456 952 ntBASIC12.71□□□□□ -0.37
Ube2q1Q7TSS2 Tnfrsf14-201ENSMUST00000123514 1018 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Ube2q1Q7TSS2 Gm11981-201ENSMUST00000139769 664 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39 ms