Protein–RNA interactions for Protein: Q7TSL0

Ifnk, Interferon kappa, mousemouse

Predictions only

Length 199 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IfnkQ7TSL0 Gps2-201ENSMUST00000057884 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
IfnkQ7TSL0 Ifi27-201ENSMUST00000066701 889 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
IfnkQ7TSL0 Prss2-201ENSMUST00000070380 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
IfnkQ7TSL0 H2afv-202ENSMUST00000109737 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
IfnkQ7TSL0 C130050O18Rik-202ENSMUST00000163940 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
IfnkQ7TSL0 Slc38a5-202ENSMUST00000115590 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.42□□□□□ -0.74
IfnkQ7TSL0 Ndufa11-201ENSMUST00000002452 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
IfnkQ7TSL0 Fdxacb1-201ENSMUST00000042391 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
IfnkQ7TSL0 Tnfaip3-201ENSMUST00000019997 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
IfnkQ7TSL0 Pip5kl1-201ENSMUST00000055304 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
IfnkQ7TSL0 Pde3a-201ENSMUST00000043259 12302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
IfnkQ7TSL0 Ehbp1-202ENSMUST00000109563 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
IfnkQ7TSL0 Adgre5-203ENSMUST00000109802 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
IfnkQ7TSL0 Gm26846-201ENSMUST00000181865 4869 ntTSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
IfnkQ7TSL0 Atic-201ENSMUST00000027384 2845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
IfnkQ7TSL0 Srfbp1-201ENSMUST00000025406 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
IfnkQ7TSL0 Tmem159-201ENSMUST00000033210 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
IfnkQ7TSL0 Tenm3-206ENSMUST00000190840 8663 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
IfnkQ7TSL0 Plg-201ENSMUST00000014578 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
IfnkQ7TSL0 Acot9-201ENSMUST00000026324 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
IfnkQ7TSL0 Epha5-205ENSMUST00000113403 4675 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
IfnkQ7TSL0 Spata2-201ENSMUST00000057627 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
IfnkQ7TSL0 Lrba-202ENSMUST00000192145 8843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
IfnkQ7TSL0 Prdm1-201ENSMUST00000039174 5281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.42□□□□□ -0.74
IfnkQ7TSL0 Mest-210ENSMUST00000157040 2383 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
IfnkQ7TSL0 Gm39168-201ENSMUST00000210181 1423 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
IfnkQ7TSL0 Gem-202ENSMUST00000108304 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
IfnkQ7TSL0 Abhd18-203ENSMUST00000159774 4455 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
IfnkQ7TSL0 Ank3-205ENSMUST00000092433 5072 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
IfnkQ7TSL0 AC091458.1-201ENSMUST00000220902 1361 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
IfnkQ7TSL0 Sirt2-209ENSMUST00000170068 1585 ntTSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
IfnkQ7TSL0 Pnpo-202ENSMUST00000107629 681 ntTSL 3 BASIC10.41□□□□□ -0.74
IfnkQ7TSL0 Rgs19-204ENSMUST00000108772 779 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
IfnkQ7TSL0 Mrpl2-203ENSMUST00000113430 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
IfnkQ7TSL0 Klk12-201ENSMUST00000014063 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
IfnkQ7TSL0 Atp6v0e-201ENSMUST00000015719 794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
IfnkQ7TSL0 Gm17227-202ENSMUST00000170286 1016 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
IfnkQ7TSL0 Stard10-207ENSMUST00000173270 670 ntTSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
IfnkQ7TSL0 Gm42627-201ENSMUST00000197347 224 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
IfnkQ7TSL0 AC148334.1-201ENSMUST00000220853 370 ntTSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
IfnkQ7TSL0 CT025535.1-201ENSMUST00000227172 491 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
IfnkQ7TSL0 Cfc1-201ENSMUST00000027298 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
IfnkQ7TSL0 Fam241b-201ENSMUST00000027719 771 ntTSL 3 BASIC10.41□□□□□ -0.74
IfnkQ7TSL0 Med8-202ENSMUST00000073881 1052 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
IfnkQ7TSL0 Atp9a-201ENSMUST00000029060 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
IfnkQ7TSL0 Sh2d2a-202ENSMUST00000107581 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
IfnkQ7TSL0 Zdhhc20-201ENSMUST00000089473 5186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
IfnkQ7TSL0 A930024N18Rik-201ENSMUST00000181251 3955 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
IfnkQ7TSL0 Stx7-205ENSMUST00000220041 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
IfnkQ7TSL0 Flvcr2-201ENSMUST00000040461 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
IfnkQ7TSL0 Crybg3-205ENSMUST00000172910 2870 ntTSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
IfnkQ7TSL0 Myo16-203ENSMUST00000207477 7169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
IfnkQ7TSL0 Gm28774-201ENSMUST00000187087 1498 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
IfnkQ7TSL0 Fam172a-201ENSMUST00000091459 3892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
IfnkQ7TSL0 Tas1r2-202ENSMUST00000166773 2524 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
IfnkQ7TSL0 Kcnmb3-201ENSMUST00000164954 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
IfnkQ7TSL0 Rprd1b-203ENSMUST00000109518 4399 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
IfnkQ7TSL0 Lnx1-202ENSMUST00000087161 2753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
IfnkQ7TSL0 Fmnl1-202ENSMUST00000042286 3806 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
IfnkQ7TSL0 Erlin2-201ENSMUST00000033873 4838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
IfnkQ7TSL0 Mpv17-202ENSMUST00000200744 1653 ntTSL 2 BASIC10.41□□□□□ -0.74
IfnkQ7TSL0 Fndc8-201ENSMUST00000018988 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
IfnkQ7TSL0 AI314180-202ENSMUST00000102889 7045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
IfnkQ7TSL0 Gm15446-201ENSMUST00000112544 2417 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.41□□□□□ -0.74
IfnkQ7TSL0 Ssh1-201ENSMUST00000077689 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
IfnkQ7TSL0 Sorcs1-202ENSMUST00000111756 3617 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
IfnkQ7TSL0 Nxpe5-204ENSMUST00000161047 2379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
IfnkQ7TSL0 Sorcs1-207ENSMUST00000211008 3617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
IfnkQ7TSL0 Dpysl4-201ENSMUST00000026551 3552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
IfnkQ7TSL0 Ift22-205ENSMUST00000200157 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
IfnkQ7TSL0 Gm37580-201ENSMUST00000192408 2800 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
IfnkQ7TSL0 Timm22-201ENSMUST00000021203 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
IfnkQ7TSL0 Ckap2-201ENSMUST00000046916 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
IfnkQ7TSL0 Spats2l-203ENSMUST00000164302 2088 ntTSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
IfnkQ7TSL0 Kng2-203ENSMUST00000115349 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
IfnkQ7TSL0 Gm20425-201ENSMUST00000166836 3028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
IfnkQ7TSL0 Cpne9-201ENSMUST00000041203 2777 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
IfnkQ7TSL0 Rps9-202ENSMUST00000108623 1347 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
IfnkQ7TSL0 Wdr82-201ENSMUST00000020490 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
IfnkQ7TSL0 Atp6v1d-201ENSMUST00000021536 3667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
IfnkQ7TSL0 Serpina1b-202ENSMUST00000164454 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
IfnkQ7TSL0 Gm8110-202ENSMUST00000211297 1782 ntTSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
IfnkQ7TSL0 Nfic-203ENSMUST00000105321 6237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
IfnkQ7TSL0 Neurog3-201ENSMUST00000050103 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
IfnkQ7TSL0 Nccrp1-201ENSMUST00000057974 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
IfnkQ7TSL0 Actl7a-201ENSMUST00000095079 1513 ntAPPRIS P1 BASIC10.4□□□□□ -0.74
IfnkQ7TSL0 Dis3l-201ENSMUST00000068367 3605 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
IfnkQ7TSL0 Slc6a1-201ENSMUST00000032454 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
IfnkQ7TSL0 Hs6st2-201ENSMUST00000088172 4318 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
IfnkQ7TSL0 Phf21a-209ENSMUST00000111297 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
IfnkQ7TSL0 Phf21a-201ENSMUST00000044036 6187 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
IfnkQ7TSL0 Pigp-205ENSMUST00000113917 805 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
IfnkQ7TSL0 Colca2-201ENSMUST00000114427 1263 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.4□□□□□ -0.74
IfnkQ7TSL0 Cdk4-202ENSMUST00000120226 714 ntTSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
IfnkQ7TSL0 Serf1-203ENSMUST00000132053 516 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
IfnkQ7TSL0 Myl3-203ENSMUST00000136695 614 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.4□□□□□ -0.74
IfnkQ7TSL0 Gm12199-201ENSMUST00000137567 517 ntTSL 3 BASIC10.4□□□□□ -0.74
IfnkQ7TSL0 2410080I02Rik-201ENSMUST00000142712 414 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
IfnkQ7TSL0 Aif1-203ENSMUST00000172693 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
IfnkQ7TSL0 Gm9034-201ENSMUST00000182071 1005 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 62.6 ms