Protein–RNA interactions for Protein: Q7TS74

Ckap2l, Cytoskeleton-associated protein 2-like, mousemouse

Predictions only

Length 745 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ckap2lQ7TS74 Gm26956-201ENSMUST00000182176 986 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Ckap2lQ7TS74 Gm9136-201ENSMUST00000193368 454 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Ckap2lQ7TS74 Gm5149-201ENSMUST00000199768 620 ntTSL 3 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Ckap2lQ7TS74 Gabra1-201ENSMUST00000020707 4688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Ckap2lQ7TS74 Nanos3-202ENSMUST00000210202 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Ckap2lQ7TS74 Gm45720-201ENSMUST00000211881 484 ntTSL 3 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Ckap2lQ7TS74 Gm18935-201ENSMUST00000212692 664 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Ckap2lQ7TS74 AC153962.4-201ENSMUST00000217878 242 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Ckap2lQ7TS74 AC153929.1-201ENSMUST00000219009 303 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Ckap2lQ7TS74 AC158523.3-201ENSMUST00000220664 864 ntTSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Ckap2lQ7TS74 Gm33115-201ENSMUST00000220913 743 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Ckap2lQ7TS74 Fam241b-201ENSMUST00000027719 771 ntTSL 3 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Ckap2lQ7TS74 Egr2-201ENSMUST00000048289 2965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Ckap2lQ7TS74 Gm10478-201ENSMUST00000084451 396 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Ckap2lQ7TS74 Srp54b-202ENSMUST00000218879 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Ckap2lQ7TS74 Zfp957-202ENSMUST00000161649 2751 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Ckap2lQ7TS74 Lsp1-211ENSMUST00000149521 1910 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Ckap2lQ7TS74 Igsf1-204ENSMUST00000114893 2671 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Ckap2lQ7TS74 Sgk1-203ENSMUST00000100036 2476 ntTSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Ckap2lQ7TS74 Sgk1-201ENSMUST00000020145 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Ckap2lQ7TS74 Rbl2-210ENSMUST00000211136 4504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Ckap2lQ7TS74 Tpra1-218ENSMUST00000203185 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Ckap2lQ7TS74 Svopl-202ENSMUST00000096040 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Ckap2lQ7TS74 Serpine1-201ENSMUST00000041388 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Ckap2lQ7TS74 Elavl2-204ENSMUST00000107110 3671 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Ckap2lQ7TS74 Bms1-201ENSMUST00000032237 4345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Ckap2lQ7TS74 Tmcc3os-201ENSMUST00000146744 2912 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Ckap2lQ7TS74 BC004004-201ENSMUST00000064709 2803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Ckap2lQ7TS74 Svop-201ENSMUST00000058472 3379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Ckap2lQ7TS74 Atp6v1c2-208ENSMUST00000221129 1425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Ckap2lQ7TS74 Prps1-201ENSMUST00000033809 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Ckap2lQ7TS74 Pros1-201ENSMUST00000023629 3303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Ckap2lQ7TS74 Ikzf4-203ENSMUST00000221150 2213 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Ckap2lQ7TS74 Raph1-204ENSMUST00000140485 10024 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Ckap2lQ7TS74 Smtn-203ENSMUST00000075118 3117 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Ckap2lQ7TS74 Piezo2-202ENSMUST00000047480 10724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Ckap2lQ7TS74 Pip5k1b-201ENSMUST00000025800 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Ckap2lQ7TS74 Alox12-201ENSMUST00000000329 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Ckap2lQ7TS74 Uimc1-201ENSMUST00000026997 2931 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Ckap2lQ7TS74 1700003D09Rik-201ENSMUST00000141929 1389 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Ckap2lQ7TS74 Ddx11-205ENSMUST00000224497 4141 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Ckap2lQ7TS74 Aldh3a1-202ENSMUST00000108716 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Ckap2lQ7TS74 Bach1-201ENSMUST00000026703 5867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Ckap2lQ7TS74 Olfr288-202ENSMUST00000165379 2083 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Ckap2lQ7TS74 Mymx-201ENSMUST00000113529 442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Ckap2lQ7TS74 Gm11755-201ENSMUST00000144096 891 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Ckap2lQ7TS74 Crb3-205ENSMUST00000169543 778 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Ckap2lQ7TS74 Gsdmcl-ps-204ENSMUST00000191285 637 ntTSL 3 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Ckap2lQ7TS74 Gm20083-202ENSMUST00000206663 1008 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Ckap2lQ7TS74 Gm17931-201ENSMUST00000208132 634 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Ckap2lQ7TS74 Gm30285-201ENSMUST00000214614 422 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Ckap2lQ7TS74 Cplx3-202ENSMUST00000215487 594 ntTSL 3 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Ckap2lQ7TS74 Tpd52l1-205ENSMUST00000215515 857 ntTSL 2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Ckap2lQ7TS74 Trappc4-206ENSMUST00000217163 1185 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Ckap2lQ7TS74 Gm8712-201ENSMUST00000221090 701 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Ckap2lQ7TS74 AC154222.2-201ENSMUST00000225848 607 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Ckap2lQ7TS74 Olfr368-201ENSMUST00000053990 985 ntAPPRIS P1 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Ckap2lQ7TS74 Rhoj-203ENSMUST00000118966 4892 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Ckap2lQ7TS74 Th-202ENSMUST00000105929 1950 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Ckap2lQ7TS74 Ces2a-201ENSMUST00000034346 1960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Ckap2lQ7TS74 Fcrl1-201ENSMUST00000072480 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Ckap2lQ7TS74 Il1rap-206ENSMUST00000174202 2306 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Ckap2lQ7TS74 Trpv1-203ENSMUST00000108470 2667 ntTSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Ckap2lQ7TS74 Sox8-201ENSMUST00000025003 3000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Ckap2lQ7TS74 Wdr36-201ENSMUST00000053663 3281 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Ckap2lQ7TS74 Egfr-202ENSMUST00000102884 2943 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Ckap2lQ7TS74 6430571L13Rik-201ENSMUST00000042581 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Ckap2lQ7TS74 Hsd3b6-202ENSMUST00000170847 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Ckap2lQ7TS74 Kcnk2-206ENSMUST00000193319 1548 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Ckap2lQ7TS74 Lrtm2-204ENSMUST00000168793 3407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Ckap2lQ7TS74 Tbl2-204ENSMUST00000153183 7488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Ckap2lQ7TS74 Gm20696-201ENSMUST00000155466 3560 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Ckap2lQ7TS74 Tctn1-201ENSMUST00000111738 5717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Ckap2lQ7TS74 Hs3st1-202ENSMUST00000117944 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Ckap2lQ7TS74 Gm45272-203ENSMUST00000211111 1693 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Ckap2lQ7TS74 Nek5-202ENSMUST00000209656 2253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Ckap2lQ7TS74 Far2-201ENSMUST00000032443 3480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Ckap2lQ7TS74 Radil-203ENSMUST00000110784 3106 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Ckap2lQ7TS74 Spesp1-201ENSMUST00000056949 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Ckap2lQ7TS74 Birc3-201ENSMUST00000013949 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.51
Ckap2lQ7TS74 Abcb8-201ENSMUST00000073076 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.51
Ckap2lQ7TS74 Uprt-201ENSMUST00000087867 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.51
Ckap2lQ7TS74 Atg9b-201ENSMUST00000059401 3902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Ckap2lQ7TS74 Mtmr4-201ENSMUST00000092802 5525 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Ckap2lQ7TS74 Pabpc1-201ENSMUST00000001809 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Ckap2lQ7TS74 Nup210-201ENSMUST00000032179 7037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Ckap2lQ7TS74 Tgm2-201ENSMUST00000103122 3596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Ckap2lQ7TS74 Dnmt3a-203ENSMUST00000111186 5424 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Ckap2lQ7TS74 Lcp2-202ENSMUST00000109329 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Ckap2lQ7TS74 Prf1-202ENSMUST00000219375 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Ckap2lQ7TS74 Trpv4-205ENSMUST00000112225 3226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Ckap2lQ7TS74 Mmp25-201ENSMUST00000024696 3373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Ckap2lQ7TS74 Sox9-201ENSMUST00000000579 4135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Ckap2lQ7TS74 Ntng2-202ENSMUST00000071201 1881 ntTSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Ckap2lQ7TS74 Ikzf2-202ENSMUST00000187184 2013 ntTSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Ckap2lQ7TS74 Gm14127-201ENSMUST00000117906 678 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
Ckap2lQ7TS74 Gm15906-201ENSMUST00000124746 323 ntTSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Ckap2lQ7TS74 1110028F11Rik-201ENSMUST00000137077 837 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Ckap2lQ7TS74 Gm13133-201ENSMUST00000143888 736 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Ckap2lQ7TS74 Pdxk-ps-202ENSMUST00000160550 876 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 86.5 ms