Protein–RNA interactions for Protein: Q7TMX5

Shq1, Protein SHQ1 homolog, mousemouse

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Length 569 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Shq1Q7TMX5 Mcm6-201ENSMUST00000027601 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Shq1Q7TMX5 Dlg4-203ENSMUST00000108588 3457 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Shq1Q7TMX5 Gm26616-202ENSMUST00000195676 3107 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Shq1Q7TMX5 Gm17276-201ENSMUST00000180839 2782 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Shq1Q7TMX5 Slc26a5-201ENSMUST00000030878 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Shq1Q7TMX5 Neu2-207ENSMUST00000172222 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Shq1Q7TMX5 Dock4-201ENSMUST00000037488 8552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Shq1Q7TMX5 Lrrc27-201ENSMUST00000016124 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Shq1Q7TMX5 Tmem138-201ENSMUST00000025568 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Shq1Q7TMX5 Rab19-201ENSMUST00000031986 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Shq1Q7TMX5 Poc1b-201ENSMUST00000020113 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Shq1Q7TMX5 Zc3h6-202ENSMUST00000110320 4916 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Shq1Q7TMX5 Ift22-205ENSMUST00000200157 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Shq1Q7TMX5 Bckdk-202ENSMUST00000124533 1792 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Shq1Q7TMX5 Tspan1-201ENSMUST00000030465 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Shq1Q7TMX5 Ntsr1-202ENSMUST00000170448 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Shq1Q7TMX5 Extl3-203ENSMUST00000225633 6013 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Shq1Q7TMX5 Apol7c-201ENSMUST00000062562 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Shq1Q7TMX5 Tgm2-201ENSMUST00000103122 3596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Shq1Q7TMX5 Dnmbp-205ENSMUST00000212396 6100 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Shq1Q7TMX5 Nppa-201ENSMUST00000103230 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Shq1Q7TMX5 Vsir-202ENSMUST00000105459 1290 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Shq1Q7TMX5 Ostm1-202ENSMUST00000105497 770 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Shq1Q7TMX5 Gm12218-201ENSMUST00000117666 399 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Shq1Q7TMX5 Gm11578-201ENSMUST00000118530 459 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Shq1Q7TMX5 Gm28038-201ENSMUST00000143119 378 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Shq1Q7TMX5 Gm13572-201ENSMUST00000153675 559 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Shq1Q7TMX5 Gm20471-201ENSMUST00000172793 626 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Shq1Q7TMX5 E030018B13Rik-201ENSMUST00000177638 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Shq1Q7TMX5 1700065I16Rik-201ENSMUST00000185277 512 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Shq1Q7TMX5 Gm18499-201ENSMUST00000220808 1021 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Shq1Q7TMX5 Fam228a-203ENSMUST00000220978 861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Shq1Q7TMX5 Gm5641-201ENSMUST00000091130 1488 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Shq1Q7TMX5 Vps4b-201ENSMUST00000094646 4633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Shq1Q7TMX5 A530072M11Rik-201ENSMUST00000151122 1852 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Shq1Q7TMX5 Gm19692-201ENSMUST00000203856 2084 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Shq1Q7TMX5 Sfxn3-203ENSMUST00000111954 2867 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Shq1Q7TMX5 Zfp362-202ENSMUST00000106072 2812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Shq1Q7TMX5 Pcdha11-201ENSMUST00000115658 5359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Shq1Q7TMX5 Klc2-204ENSMUST00000116563 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Shq1Q7TMX5 Klf11-201ENSMUST00000020982 4086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Shq1Q7TMX5 Nxf2-202ENSMUST00000113187 2316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Shq1Q7TMX5 Zfp810-201ENSMUST00000086278 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Shq1Q7TMX5 Actb-201ENSMUST00000100497 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Shq1Q7TMX5 Nars-201ENSMUST00000025483 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Shq1Q7TMX5 Eif4g3-203ENSMUST00000084215 8134 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Shq1Q7TMX5 Celf4-201ENSMUST00000025117 2899 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Shq1Q7TMX5 Clps-202ENSMUST00000114785 369 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Shq1Q7TMX5 Gm13445-201ENSMUST00000121664 307 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Shq1Q7TMX5 Gm28306-201ENSMUST00000191315 529 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Shq1Q7TMX5 2900089D17Rik-201ENSMUST00000124015 2475 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Shq1Q7TMX5 Mroh1-204ENSMUST00000159218 5085 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Shq1Q7TMX5 Trpv4-201ENSMUST00000071968 3228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Shq1Q7TMX5 4932431P20Rik-201ENSMUST00000098602 1340 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Shq1Q7TMX5 Rnf182-201ENSMUST00000059986 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Shq1Q7TMX5 Gm10728-201ENSMUST00000194292 1829 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Shq1Q7TMX5 Gm36995-201ENSMUST00000126170 5727 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Shq1Q7TMX5 Ly6e-210ENSMUST00000188866 2068 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Shq1Q7TMX5 Kyat1-202ENSMUST00000113659 1367 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Shq1Q7TMX5 Chrdl1-204ENSMUST00000166406 2605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Shq1Q7TMX5 Gm45546-201ENSMUST00000211053 2394 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Shq1Q7TMX5 Tsc2-221ENSMUST00000228412 5432 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Shq1Q7TMX5 Samd4-202ENSMUST00000100672 4165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Shq1Q7TMX5 Bcl2l15-202ENSMUST00000106822 1902 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Shq1Q7TMX5 Sh3bp5l-201ENSMUST00000073128 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Shq1Q7TMX5 Slc24a5-201ENSMUST00000070353 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Shq1Q7TMX5 Tpra1-218ENSMUST00000203185 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Shq1Q7TMX5 Platr19-201ENSMUST00000171380 1466 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Shq1Q7TMX5 Wdr92-201ENSMUST00000046955 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Shq1Q7TMX5 Btnl7-ps-201ENSMUST00000023469 1763 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Shq1Q7TMX5 Gm853-201ENSMUST00000023884 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Shq1Q7TMX5 Hdac5-203ENSMUST00000107151 4852 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Shq1Q7TMX5 Rab3c-202ENSMUST00000223922 2398 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Shq1Q7TMX5 Tomm5-202ENSMUST00000107808 679 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Shq1Q7TMX5 Oprl1-204ENSMUST00000108767 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Shq1Q7TMX5 Gm14274-201ENSMUST00000117182 615 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Shq1Q7TMX5 Rpl10-ps1-201ENSMUST00000119438 645 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Shq1Q7TMX5 Rbm3os-201ENSMUST00000124018 839 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Shq1Q7TMX5 Gm13558-201ENSMUST00000140464 554 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Shq1Q7TMX5 1810021B22Rik-201ENSMUST00000150364 652 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Shq1Q7TMX5 Gm16030-201ENSMUST00000159098 603 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Shq1Q7TMX5 Gm28529-201ENSMUST00000186159 387 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Shq1Q7TMX5 Gm6423-201ENSMUST00000204315 934 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Shq1Q7TMX5 CT025602.2-201ENSMUST00000226553 772 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Shq1Q7TMX5 Cxcl1-201ENSMUST00000031327 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Shq1Q7TMX5 Hk1-202ENSMUST00000099691 4278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Shq1Q7TMX5 Rad18-204ENSMUST00000113182 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Shq1Q7TMX5 Pcgf5-211ENSMUST00000225920 6443 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Shq1Q7TMX5 Abca3-201ENSMUST00000039013 6476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Shq1Q7TMX5 Cr1l-201ENSMUST00000075451 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Shq1Q7TMX5 Brd4-201ENSMUST00000003726 5955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Shq1Q7TMX5 Cysltr2-202ENSMUST00000169168 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Shq1Q7TMX5 Dpp9-201ENSMUST00000038794 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Shq1Q7TMX5 Usp5-202ENSMUST00000122110 3076 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Shq1Q7TMX5 Cyb561d1-201ENSMUST00000065664 4058 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Shq1Q7TMX5 Grip1-212ENSMUST00000147356 4145 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Shq1Q7TMX5 Ptp4a3-202ENSMUST00000163582 3808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Shq1Q7TMX5 Stat3-203ENSMUST00000127638 4516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Shq1Q7TMX5 Lrrc20-201ENSMUST00000049242 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Shq1Q7TMX5 Tfcp2-201ENSMUST00000009877 3250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
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