Protein–RNA interactions for Protein: Q7TMI3

Uhrf2, E3 ubiquitin-protein ligase UHRF2, mousemouse

Predictions only

Length 803 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Uhrf2Q7TMI3 AC166344.1-202ENSMUST00000224139 234 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
Uhrf2Q7TMI3 Psmb2-201ENSMUST00000030642 859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Uhrf2Q7TMI3 Trappc4-201ENSMUST00000034623 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Uhrf2Q7TMI3 E430018J23Rik-203ENSMUST00000165495 3324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Uhrf2Q7TMI3 Zfp646-201ENSMUST00000050383 6310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Uhrf2Q7TMI3 Dbx2-201ENSMUST00000054244 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Uhrf2Q7TMI3 Col9a1-202ENSMUST00000088349 3059 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Uhrf2Q7TMI3 Oasl1-201ENSMUST00000031540 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Uhrf2Q7TMI3 Bdkrb2-201ENSMUST00000001652 3792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Uhrf2Q7TMI3 Tsc2-201ENSMUST00000097373 6018 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Uhrf2Q7TMI3 AC124577.2-201ENSMUST00000217413 2420 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
Uhrf2Q7TMI3 Tcf25-202ENSMUST00000108840 2582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Uhrf2Q7TMI3 Fpr1-201ENSMUST00000061516 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Uhrf2Q7TMI3 Slurp1-202ENSMUST00000190433 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Uhrf2Q7TMI3 Neurod6-201ENSMUST00000044767 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Uhrf2Q7TMI3 Ascc1-202ENSMUST00000164083 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Uhrf2Q7TMI3 Txlna-201ENSMUST00000046425 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Uhrf2Q7TMI3 Eps8l2-201ENSMUST00000026577 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Uhrf2Q7TMI3 Sgk1-213ENSMUST00000164659 2602 ntTSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Uhrf2Q7TMI3 Gm15987-201ENSMUST00000141700 2231 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Uhrf2Q7TMI3 Ephb2-203ENSMUST00000105846 3653 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Uhrf2Q7TMI3 Robo1-201ENSMUST00000023600 7563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Uhrf2Q7TMI3 Synpo2l-202ENSMUST00000117386 3979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Uhrf2Q7TMI3 Gusb-201ENSMUST00000026613 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Uhrf2Q7TMI3 Cln8-201ENSMUST00000027554 6857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Uhrf2Q7TMI3 1700110I01Rik-201ENSMUST00000112775 1671 ntTSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Uhrf2Q7TMI3 Kalrn-211ENSMUST00000114966 3857 ntTSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Uhrf2Q7TMI3 Lamp5-201ENSMUST00000057503 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Uhrf2Q7TMI3 Gm15172-201ENSMUST00000118945 1046 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
Uhrf2Q7TMI3 Rpl3-ps1-201ENSMUST00000120557 1210 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
Uhrf2Q7TMI3 Mogat1-201ENSMUST00000012331 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Uhrf2Q7TMI3 Gm45711-202ENSMUST00000164175 979 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Uhrf2Q7TMI3 Creb3-206ENSMUST00000167751 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Uhrf2Q7TMI3 Celf2-225ENSMUST00000183091 2177 ntTSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Uhrf2Q7TMI3 Gm3096-201ENSMUST00000185770 364 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
Uhrf2Q7TMI3 Gm9230-201ENSMUST00000188228 532 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
Uhrf2Q7TMI3 2810405F17Rik-201ENSMUST00000189334 1117 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
Uhrf2Q7TMI3 Polr2i-201ENSMUST00000019882 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Uhrf2Q7TMI3 Nos3-201ENSMUST00000030834 4132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Uhrf2Q7TMI3 Pglyrp1-201ENSMUST00000032573 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Uhrf2Q7TMI3 Gm10312-201ENSMUST00000078515 489 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
Uhrf2Q7TMI3 Tmem129-201ENSMUST00000019439 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Uhrf2Q7TMI3 Madd-213ENSMUST00000111376 5927 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Uhrf2Q7TMI3 Madd-206ENSMUST00000099725 5905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Uhrf2Q7TMI3 Pdcd1-201ENSMUST00000027507 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Uhrf2Q7TMI3 Kat6b-201ENSMUST00000069648 7649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Uhrf2Q7TMI3 Vcp-201ENSMUST00000030164 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Uhrf2Q7TMI3 Sh3gl3-206ENSMUST00000179318 1489 ntTSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Uhrf2Q7TMI3 Gm45677-201ENSMUST00000209975 1341 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
Uhrf2Q7TMI3 Lbr-201ENSMUST00000005003 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Uhrf2Q7TMI3 Ldhd-201ENSMUST00000070004 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Uhrf2Q7TMI3 Mb21d1-202ENSMUST00000070742 4049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Uhrf2Q7TMI3 Tcof1-204ENSMUST00000176630 4529 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Uhrf2Q7TMI3 Cacna1c-219ENSMUST00000189389 6603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Uhrf2Q7TMI3 Vmn1r45-206ENSMUST00000227977 3297 ntAPPRIS P1 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Uhrf2Q7TMI3 Dclk1-204ENSMUST00000196745 7962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Uhrf2Q7TMI3 Siglec1-203ENSMUST00000110227 5790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Uhrf2Q7TMI3 Gm43760-201ENSMUST00000202120 3015 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
Uhrf2Q7TMI3 Cyp26b1-202ENSMUST00000168003 4170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Uhrf2Q7TMI3 Cyp26b1-201ENSMUST00000077705 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Uhrf2Q7TMI3 Limk2-201ENSMUST00000101638 3514 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Uhrf2Q7TMI3 Fcer2a-201ENSMUST00000005678 2242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Uhrf2Q7TMI3 6430571L13Rik-201ENSMUST00000042581 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Uhrf2Q7TMI3 Nr5a2-202ENSMUST00000168126 3446 ntTSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Uhrf2Q7TMI3 Arpp21-223ENSMUST00000162097 3952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Uhrf2Q7TMI3 Lef1-201ENSMUST00000029611 3482 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Uhrf2Q7TMI3 Gm23270-201ENSMUST00000104055 131 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
Uhrf2Q7TMI3 Gm6370-201ENSMUST00000110611 1142 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
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Uhrf2Q7TMI3 Asb17os-201ENSMUST00000156292 496 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Uhrf2Q7TMI3 Gm20537-202ENSMUST00000173131 889 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Uhrf2Q7TMI3 Gm6309-201ENSMUST00000174320 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Uhrf2Q7TMI3 Gm36937-201ENSMUST00000192957 429 ntTSL 3 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Uhrf2Q7TMI3 Gm31256-201ENSMUST00000194705 506 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
Uhrf2Q7TMI3 Hax1-206ENSMUST00000197786 857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Uhrf2Q7TMI3 Gm43438-201ENSMUST00000198133 379 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
Uhrf2Q7TMI3 Gm43630-201ENSMUST00000201550 776 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
Uhrf2Q7TMI3 AC153929.1-201ENSMUST00000219009 303 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
Uhrf2Q7TMI3 Prss34-201ENSMUST00000037453 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Uhrf2Q7TMI3 Fam25c-201ENSMUST00000052126 408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Uhrf2Q7TMI3 9030624J02Rik-202ENSMUST00000059390 5097 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Uhrf2Q7TMI3 Plscr1-201ENSMUST00000093801 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Uhrf2Q7TMI3 Foxn4-201ENSMUST00000044790 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Uhrf2Q7TMI3 Bub3-203ENSMUST00000207442 3414 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Uhrf2Q7TMI3 Hao1-201ENSMUST00000028704 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Uhrf2Q7TMI3 Wdr92-201ENSMUST00000046955 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Uhrf2Q7TMI3 Trhr2-201ENSMUST00000044123 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Uhrf2Q7TMI3 Ints6l-207ENSMUST00000186445 3608 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Uhrf2Q7TMI3 Lats2-207ENSMUST00000173990 3834 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Uhrf2Q7TMI3 E030013I19Rik-201ENSMUST00000148089 2754 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Uhrf2Q7TMI3 Mlc1-201ENSMUST00000042594 2783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Uhrf2Q7TMI3 Thsd4-206ENSMUST00000171654 8522 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Uhrf2Q7TMI3 Nrg1-211ENSMUST00000208497 2096 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Uhrf2Q7TMI3 Pmaip1-201ENSMUST00000025399 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Uhrf2Q7TMI3 Dph6-201ENSMUST00000028640 2632 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Uhrf2Q7TMI3 Pgbd5-203ENSMUST00000136892 1739 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Uhrf2Q7TMI3 Irx3os-203ENSMUST00000133528 1354 ntTSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.72
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