Protein–RNA interactions for Protein: Q78JN3

Eci3, Enoyl-CoA delta isomerase 3, peroxisomal, mousemouse

Predictions only

Length 317 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Eci3Q78JN3 1700069L16Rik-203ENSMUST00000162388 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Eci3Q78JN3 1700030M09Rik-202ENSMUST00000181679 964 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Eci3Q78JN3 Gm19287-201ENSMUST00000203190 358 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Eci3Q78JN3 Olfr284-202ENSMUST00000206647 966 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Eci3Q78JN3 Ggps1-204ENSMUST00000221713 667 ntTSL 3 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Eci3Q78JN3 Mal-201ENSMUST00000028853 486 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Eci3Q78JN3 Rnase2b-201ENSMUST00000075648 759 ntAPPRIS P1 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Eci3Q78JN3 Hhipl2-201ENSMUST00000065900 2525 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Eci3Q78JN3 Fosb-201ENSMUST00000003640 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Eci3Q78JN3 Myo18a-207ENSMUST00000102488 7409 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Eci3Q78JN3 Aicda-201ENSMUST00000043301 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Eci3Q78JN3 Rnf214-208ENSMUST00000161187 2847 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Eci3Q78JN3 Fam71f1-201ENSMUST00000090487 1584 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Eci3Q78JN3 Gstcd-201ENSMUST00000029651 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Eci3Q78JN3 Cd163l1-201ENSMUST00000084460 3454 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Eci3Q78JN3 Zc3hc1-203ENSMUST00000115184 1504 ntTSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Eci3Q78JN3 A430033K04Rik-203ENSMUST00000198958 2264 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Eci3Q78JN3 Pcdhb14-201ENSMUST00000052387 8695 ntAPPRIS P1 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Eci3Q78JN3 1700030J22Rik-201ENSMUST00000070577 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Eci3Q78JN3 Henmt1-205ENSMUST00000196533 1491 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Eci3Q78JN3 Sel1l-204ENSMUST00000167466 5544 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Eci3Q78JN3 Myo1b-201ENSMUST00000018561 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Eci3Q78JN3 Psapl1-201ENSMUST00000052224 2548 ntAPPRIS P1 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Eci3Q78JN3 Crispld2-201ENSMUST00000034282 2898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Eci3Q78JN3 Sept11-201ENSMUST00000074733 5028 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Eci3Q78JN3 Rimbp2-204ENSMUST00000198941 6446 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Eci3Q78JN3 Ankrd33-201ENSMUST00000070875 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Eci3Q78JN3 Trim11-202ENSMUST00000108809 3522 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Eci3Q78JN3 Fmnl1-202ENSMUST00000042286 3806 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Eci3Q78JN3 Lck-208ENSMUST00000167288 2074 ntTSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Eci3Q78JN3 Vrk1-201ENSMUST00000021539 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Eci3Q78JN3 AC091458.1-201ENSMUST00000220902 1361 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
Eci3Q78JN3 Uspl1-201ENSMUST00000050472 3757 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Eci3Q78JN3 Mfsd4b5-203ENSMUST00000164566 2372 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Eci3Q78JN3 Gm43720-201ENSMUST00000159067 6411 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Eci3Q78JN3 Tbc1d14-204ENSMUST00000130417 2665 ntTSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Eci3Q78JN3 H2-Ob-204ENSMUST00000173764 1319 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Eci3Q78JN3 Wdcp-202ENSMUST00000085793 1992 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Eci3Q78JN3 Igsf9-202ENSMUST00000111235 4205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Eci3Q78JN3 Olfm4-201ENSMUST00000088735 1640 ntTSL 2 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Eci3Q78JN3 Stxbp5l-204ENSMUST00000114781 3544 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Eci3Q78JN3 Prx-201ENSMUST00000065487 4497 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Eci3Q78JN3 Gm6370-201ENSMUST00000110611 1142 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Eci3Q78JN3 Gm14127-201ENSMUST00000117906 678 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
Eci3Q78JN3 Gm11511-201ENSMUST00000118146 540 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
Eci3Q78JN3 Rpl3-ps1-201ENSMUST00000120557 1210 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
Eci3Q78JN3 Rbm3-ps-201ENSMUST00000121422 465 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
Eci3Q78JN3 Fez1-208ENSMUST00000163816 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Eci3Q78JN3 Commd6-203ENSMUST00000168587 519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Eci3Q78JN3 Crb3-205ENSMUST00000169543 778 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Eci3Q78JN3 Gm7008-202ENSMUST00000170019 402 ntTSL 2 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Eci3Q78JN3 Cd180-203ENSMUST00000170878 842 ntTSL 3 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Eci3Q78JN3 Cd180-205ENSMUST00000172138 518 ntTSL 2 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Eci3Q78JN3 Gm6309-201ENSMUST00000174320 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Eci3Q78JN3 Gm28638-201ENSMUST00000188152 288 ntTSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Eci3Q78JN3 1700065D16Rik-203ENSMUST00000189279 393 ntTSL 2 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Eci3Q78JN3 Gm19187-201ENSMUST00000206781 892 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
Eci3Q78JN3 CT033793.1-201ENSMUST00000216883 565 ntTSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Eci3Q78JN3 AC132384.14-201ENSMUST00000219346 1147 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
Eci3Q78JN3 Dhrs2-201ENSMUST00000022820 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Eci3Q78JN3 Pcgf1-201ENSMUST00000092614 866 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Eci3Q78JN3 Slc2a7-201ENSMUST00000059893 1578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Eci3Q78JN3 Fam26e-201ENSMUST00000069125 5323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Eci3Q78JN3 Gm13093-201ENSMUST00000126212 2485 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Eci3Q78JN3 Gpr45-201ENSMUST00000114761 1546 ntAPPRIS P1 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Eci3Q78JN3 Smndc1-201ENSMUST00000025997 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Eci3Q78JN3 Cdnf-201ENSMUST00000036350 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Eci3Q78JN3 Gtf3c1-204ENSMUST00000205659 6570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Eci3Q78JN3 Tmem246-201ENSMUST00000042750 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Eci3Q78JN3 Gm26510-201ENSMUST00000180468 1796 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Eci3Q78JN3 Ascc1-202ENSMUST00000164083 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Eci3Q78JN3 Ctps2-205ENSMUST00000112302 3223 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Eci3Q78JN3 Uqcc1-203ENSMUST00000109632 2313 ntTSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Eci3Q78JN3 Ticam2-201ENSMUST00000070084 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Eci3Q78JN3 Gm26794-201ENSMUST00000180810 4312 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Eci3Q78JN3 Npy5r-202ENSMUST00000211920 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Eci3Q78JN3 Zfp286-211ENSMUST00000207597 1668 ntTSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Eci3Q78JN3 Mamld1-202ENSMUST00000114629 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Eci3Q78JN3 Ehmt1-203ENSMUST00000102938 4680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Eci3Q78JN3 Rnf180-205ENSMUST00000226044 3279 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Eci3Q78JN3 Klhl29-202ENSMUST00000218384 2716 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Eci3Q78JN3 Olfr541-203ENSMUST00000210357 1642 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Eci3Q78JN3 Als2-204ENSMUST00000163058 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Eci3Q78JN3 1300017J02Rik-202ENSMUST00000123530 1874 ntTSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Eci3Q78JN3 Rps13-203ENSMUST00000205490 1317 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Eci3Q78JN3 Xrra1-202ENSMUST00000207855 1334 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Eci3Q78JN3 Pdzd7-203ENSMUST00000169459 3903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Eci3Q78JN3 Pabpc4-204ENSMUST00000106243 3111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Eci3Q78JN3 A130010J15Rik-204ENSMUST00000161235 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Eci3Q78JN3 Vmn2r-ps25-201ENSMUST00000202322 2321 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Eci3Q78JN3 Gtf3c1-201ENSMUST00000055506 6961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Eci3Q78JN3 Zfp108-202ENSMUST00000205982 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Eci3Q78JN3 Col9a1-202ENSMUST00000088349 3059 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Eci3Q78JN3 Trav13d-4-201ENSMUST00000103607 264 ntAPPRIS P1 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Eci3Q78JN3 Dixdc1-204ENSMUST00000118707 989 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Eci3Q78JN3 Dmrtc1a-202ENSMUST00000119624 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Eci3Q78JN3 Gm13061-201ENSMUST00000137962 664 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Eci3Q78JN3 Rps13-ps2-201ENSMUST00000182017 453 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Eci3Q78JN3 Gm9192-201ENSMUST00000183221 985 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Eci3Q78JN3 Trav13-4-dv7-202ENSMUST00000184905 264 ntAPPRIS P1 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 76.9 ms