Protein–RNA interactions for Protein: Q78IS1

Tmed3, Transmembrane emp24 domain-containing protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 221 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmed3Q78IS1 AC121804.3-201ENSMUST00000223420 295 ntBASIC9.75□□□□□ -0.85
Tmed3Q78IS1 AC131187.1-201ENSMUST00000224567 809 ntBASIC9.75□□□□□ -0.85
Tmed3Q78IS1 Cox7a2l-201ENSMUST00000025095 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Tmed3Q78IS1 Cidea-201ENSMUST00000025404 1164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Tmed3Q78IS1 Bccip-201ENSMUST00000033282 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Tmed3Q78IS1 Lce3b-201ENSMUST00000046234 562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Tmed3Q78IS1 Crygn-201ENSMUST00000047119 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Tmed3Q78IS1 Kcnip2-203ENSMUST00000086993 1005 ntTSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Tmed3Q78IS1 Abcg1-201ENSMUST00000024829 3610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Tmed3Q78IS1 Xpc-201ENSMUST00000032182 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Tmed3Q78IS1 Pex26-203ENSMUST00000120066 3861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Tmed3Q78IS1 AC158777.1-201ENSMUST00000226216 1724 ntBASIC9.75□□□□□ -0.85
Tmed3Q78IS1 Lpin3-201ENSMUST00000040872 3458 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Tmed3Q78IS1 Atp2b2-202ENSMUST00000101044 4586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Tmed3Q78IS1 Nipal3-202ENSMUST00000105856 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Tmed3Q78IS1 Atxn7l3-203ENSMUST00000107134 3712 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.75□□□□□ -0.85
Tmed3Q78IS1 Txlng-204ENSMUST00000112316 3715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Tmed3Q78IS1 Tom1-201ENSMUST00000078847 1769 ntTSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Tmed3Q78IS1 Kng2-203ENSMUST00000115349 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Tmed3Q78IS1 Ddb2-201ENSMUST00000028696 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Tmed3Q78IS1 Ampd2-201ENSMUST00000078912 3368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.75□□□□□ -0.85
Tmed3Q78IS1 Plekhb1-203ENSMUST00000107044 1806 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Tmed3Q78IS1 Gm19178-201ENSMUST00000217524 1819 ntBASIC9.75□□□□□ -0.85
Tmed3Q78IS1 Gm7357-201ENSMUST00000195361 2991 ntBASIC9.75□□□□□ -0.85
Tmed3Q78IS1 Specc1-208ENSMUST00000201624 2518 ntTSL 5 BASIC9.75□□□□□ -0.85
Tmed3Q78IS1 Kdm3a-202ENSMUST00000167220 4853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Tmed3Q78IS1 Abhd14b-209ENSMUST00000216130 1624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.74□□□□□ -0.85
Tmed3Q78IS1 Cct5-201ENSMUST00000022842 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Tmed3Q78IS1 Gk2-201ENSMUST00000059657 1880 ntAPPRIS P1 BASIC9.74□□□□□ -0.85
Tmed3Q78IS1 Gm2109-201ENSMUST00000189326 1409 ntTSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Tmed3Q78IS1 Gm16348-202ENSMUST00000146654 2385 ntTSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Tmed3Q78IS1 Gm42826-201ENSMUST00000197548 2639 ntBASIC9.74□□□□□ -0.85
Tmed3Q78IS1 Ttc33-203ENSMUST00000118193 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Tmed3Q78IS1 Gm15883-201ENSMUST00000153562 1690 ntTSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Tmed3Q78IS1 5033403F01Rik-201ENSMUST00000181376 1678 ntTSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Tmed3Q78IS1 Gm14340-201ENSMUST00000148700 1913 ntTSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Tmed3Q78IS1 Mrps17-206ENSMUST00000121339 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Tmed3Q78IS1 Atxn2l-206ENSMUST00000206577 3894 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.74□□□□□ -0.85
Tmed3Q78IS1 Tec-201ENSMUST00000071944 2659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Tmed3Q78IS1 Dcun1d3-203ENSMUST00000106519 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.74□□□□□ -0.85
Tmed3Q78IS1 Dnajb4-201ENSMUST00000029669 1497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.74□□□□□ -0.85
Tmed3Q78IS1 Gm26747-201ENSMUST00000180597 1716 ntTSL 5 BASIC9.74□□□□□ -0.85
Tmed3Q78IS1 Camk1g-201ENSMUST00000016323 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Tmed3Q78IS1 Ctso-201ENSMUST00000029649 3468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Tmed3Q78IS1 Pip5k1a-201ENSMUST00000005768 3480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.74□□□□□ -0.85
Tmed3Q78IS1 Dchs1-201ENSMUST00000078482 10754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.74□□□□□ -0.85
Tmed3Q78IS1 Usp45-202ENSMUST00000065111 6003 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.74□□□□□ -0.85
Tmed3Q78IS1 Zfp944-201ENSMUST00000115535 2784 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.74□□□□□ -0.85
Tmed3Q78IS1 Zfp873-203ENSMUST00000209622 2284 ntTSL 2 BASIC9.74□□□□□ -0.85
Tmed3Q78IS1 Erc2-201ENSMUST00000090302 6083 ntTSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Tmed3Q78IS1 Gm24231-201ENSMUST00000104315 133 ntBASIC9.74□□□□□ -0.85
Tmed3Q78IS1 Mmab-203ENSMUST00000123256 1277 ntTSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Tmed3Q78IS1 Pcp2-204ENSMUST00000136105 504 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Tmed3Q78IS1 1110028F11Rik-201ENSMUST00000137077 837 ntTSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Tmed3Q78IS1 Gm26308-201ENSMUST00000157768 69 ntBASIC9.74□□□□□ -0.85
Tmed3Q78IS1 Trav13d-3-201ENSMUST00000179512 391 ntAPPRIS P1 BASIC9.74□□□□□ -0.85
Tmed3Q78IS1 Trav13n-3-201ENSMUST00000179580 337 ntAPPRIS P1 BASIC9.74□□□□□ -0.85
Tmed3Q78IS1 Gm11214-201ENSMUST00000184252 552 ntAPPRIS P1 BASIC9.74□□□□□ -0.85
Tmed3Q78IS1 Gm38225-201ENSMUST00000194001 393 ntBASIC9.74□□□□□ -0.85
Tmed3Q78IS1 Gm44492-201ENSMUST00000197012 141 ntBASIC9.74□□□□□ -0.85
Tmed3Q78IS1 Gm33785-201ENSMUST00000222961 886 ntTSL 5 BASIC9.74□□□□□ -0.85
Tmed3Q78IS1 Olfr324-201ENSMUST00000054683 1122 ntAPPRIS P2 BASIC9.74□□□□□ -0.85
Tmed3Q78IS1 Cyp2d40-201ENSMUST00000055721 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Tmed3Q78IS1 Pmf1-201ENSMUST00000056370 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Tmed3Q78IS1 Rnaseh2a-201ENSMUST00000065049 1006 ntTSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Tmed3Q78IS1 Gm9945-201ENSMUST00000067523 932 ntAPPRIS P1 BASIC9.74□□□□□ -0.85
Tmed3Q78IS1 Gtpbp10-201ENSMUST00000088842 941 ntTSL 5 BASIC9.74□□□□□ -0.85
Tmed3Q78IS1 Gm1627-201ENSMUST00000188504 2588 ntTSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Tmed3Q78IS1 Gm10531-201ENSMUST00000193527 2303 ntBASIC9.74□□□□□ -0.85
Tmed3Q78IS1 Sh3bgrl-201ENSMUST00000033598 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Tmed3Q78IS1 Pif1-201ENSMUST00000047099 3685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Tmed3Q78IS1 Arxes1-201ENSMUST00000057625 1580 ntAPPRIS P1 BASIC9.74□□□□□ -0.85
Tmed3Q78IS1 Btbd7-206ENSMUST00000223554 8157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Tmed3Q78IS1 AC154537.1-201ENSMUST00000226101 1304 ntBASIC9.74□□□□□ -0.85
Tmed3Q78IS1 1700061G19Rik-201ENSMUST00000025048 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Tmed3Q78IS1 Eef1d-205ENSMUST00000109972 1624 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Tmed3Q78IS1 Zfp647-201ENSMUST00000048854 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Tmed3Q78IS1 Rbm14-202ENSMUST00000113793 3508 ntTSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Tmed3Q78IS1 Dglucy-201ENSMUST00000069782 3295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Tmed3Q78IS1 Rcbtb2-223ENSMUST00000170677 3573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Tmed3Q78IS1 Avil-201ENSMUST00000026500 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Tmed3Q78IS1 Phactr2-201ENSMUST00000079698 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.74□□□□□ -0.85
Tmed3Q78IS1 Olfr569-202ENSMUST00000217024 4741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.74□□□□□ -0.85
Tmed3Q78IS1 Hdac9-206ENSMUST00000209990 3072 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.74□□□□□ -0.85
Tmed3Q78IS1 C920006O11Rik-201ENSMUST00000180974 1444 ntTSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
Tmed3Q78IS1 Tubgcp5-205ENSMUST00000205796 3448 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
Tmed3Q78IS1 Celsr3-201ENSMUST00000024238 11547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
Tmed3Q78IS1 Gm35715-201ENSMUST00000197421 2054 ntTSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
Tmed3Q78IS1 Gid8-202ENSMUST00000078687 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
Tmed3Q78IS1 Bpifb9a-201ENSMUST00000088924 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
Tmed3Q78IS1 Gtf2h3-201ENSMUST00000031333 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
Tmed3Q78IS1 Zfp512-201ENSMUST00000076264 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
Tmed3Q78IS1 Thsd7b-201ENSMUST00000040311 3895 ntTSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
Tmed3Q78IS1 Sh2d2a-202ENSMUST00000107581 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
Tmed3Q78IS1 Znrf1-202ENSMUST00000166859 3650 ntTSL 5 BASIC9.73□□□□□ -0.85
Tmed3Q78IS1 Gm19656-201ENSMUST00000208543 4610 ntTSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
Tmed3Q78IS1 Cass4-201ENSMUST00000099061 3731 ntTSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
Tmed3Q78IS1 Ccdc40-201ENSMUST00000035935 4979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
Tmed3Q78IS1 Exoc3l4-210ENSMUST00000223050 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
Tmed3Q78IS1 Eif4e1b-206ENSMUST00000132728 1897 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 83.8 ms