Protein–RNA interactions for Protein: Q6VGS5

Ccdc88c, Protein Daple, mousemouse

Predictions only

Length 2,009 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc88cQ6VGS5 Arntl2-202ENSMUST00000111636 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Ccdc88cQ6VGS5 Cd55b-201ENSMUST00000112488 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Ccdc88cQ6VGS5 Aldoart2-201ENSMUST00000080123 1658 ntAPPRIS P1 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Ccdc88cQ6VGS5 Wdfy1-204ENSMUST00000113512 4551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Ccdc88cQ6VGS5 Wdfy1-205ENSMUST00000113513 4551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Ccdc88cQ6VGS5 Wdfy1-206ENSMUST00000113514 4551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Ccdc88cQ6VGS5 Wdfy1-207ENSMUST00000113515 4551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Ccdc88cQ6VGS5 Gm24891-201ENSMUST00000104391 136 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
Ccdc88cQ6VGS5 Gstm4-202ENSMUST00000106670 777 ntTSL 3 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Ccdc88cQ6VGS5 Gm14395-201ENSMUST00000120494 563 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
Ccdc88cQ6VGS5 Gm14397-201ENSMUST00000124728 576 ntTSL 3 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Ccdc88cQ6VGS5 Gm12714-201ENSMUST00000143391 669 ntTSL 3 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Ccdc88cQ6VGS5 Gm8459-201ENSMUST00000162504 760 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
Ccdc88cQ6VGS5 Tro-208ENSMUST00000164071 891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Ccdc88cQ6VGS5 1700025F24Rik-201ENSMUST00000185238 894 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Ccdc88cQ6VGS5 1600010M07Rik-202ENSMUST00000188662 654 ntTSL 2 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Ccdc88cQ6VGS5 Gm44421-201ENSMUST00000205064 1221 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
Ccdc88cQ6VGS5 AC159890.1-201ENSMUST00000215382 684 ntTSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Ccdc88cQ6VGS5 Taar9-201ENSMUST00000041180 1047 ntAPPRIS P1 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Ccdc88cQ6VGS5 Plcd1-201ENSMUST00000010804 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Ccdc88cQ6VGS5 Akap10-203ENSMUST00000108710 3394 ntTSL 2 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Ccdc88cQ6VGS5 Tor3a-201ENSMUST00000079625 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Ccdc88cQ6VGS5 Tnn-201ENSMUST00000039178 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Ccdc88cQ6VGS5 Ankrd34c-202ENSMUST00000185470 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Ccdc88cQ6VGS5 Tsku-206ENSMUST00000179780 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Ccdc88cQ6VGS5 Btnl4-201ENSMUST00000065841 1761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Ccdc88cQ6VGS5 Gm13990-201ENSMUST00000151391 2701 ntTSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Ccdc88cQ6VGS5 Egr1-202ENSMUST00000165033 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Ccdc88cQ6VGS5 Nlrx1-202ENSMUST00000168499 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Ccdc88cQ6VGS5 Prc1-206ENSMUST00000173824 2912 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Ccdc88cQ6VGS5 Gabarapl2-201ENSMUST00000034428 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Ccdc88cQ6VGS5 Wif1-201ENSMUST00000020439 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Ccdc88cQ6VGS5 Erich3-203ENSMUST00000189969 3460 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
Ccdc88cQ6VGS5 Snph-202ENSMUST00000094456 4607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Ccdc88cQ6VGS5 Tnnt3-211ENSMUST00000105949 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Ccdc88cQ6VGS5 Cetn2-203ENSMUST00000114551 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Ccdc88cQ6VGS5 Gm13888-201ENSMUST00000119148 422 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
Ccdc88cQ6VGS5 Csf1-204ENSMUST00000120654 821 ntTSL 3 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Ccdc88cQ6VGS5 Acy1-211ENSMUST00000216400 1030 ntTSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Ccdc88cQ6VGS5 Rsg1-201ENSMUST00000097813 985 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Ccdc88cQ6VGS5 Dhx57-201ENSMUST00000038166 4918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Ccdc88cQ6VGS5 Cacnb4-206ENSMUST00000178799 7981 ntTSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Ccdc88cQ6VGS5 Tgfb2-206ENSMUST00000195201 3485 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Ccdc88cQ6VGS5 Arfgap1-202ENSMUST00000108859 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Ccdc88cQ6VGS5 Gm21358-201ENSMUST00000191645 1659 ntBASIC12.97□□□□□ -0.33
Ccdc88cQ6VGS5 Oprm1-205ENSMUST00000078634 1695 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Ccdc88cQ6VGS5 Lsp1-211ENSMUST00000149521 1910 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Ccdc88cQ6VGS5 Rabep1-203ENSMUST00000100928 3860 ntTSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Ccdc88cQ6VGS5 Tmem176b-202ENSMUST00000164733 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Ccdc88cQ6VGS5 A430057M04Rik-201ENSMUST00000169054 3835 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Ccdc88cQ6VGS5 Spock3-202ENSMUST00000117377 3066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Ccdc88cQ6VGS5 A130077B15Rik-201ENSMUST00000219429 2547 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Ccdc88cQ6VGS5 Fxyd5-212ENSMUST00000162733 2998 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Ccdc88cQ6VGS5 Nudt8-201ENSMUST00000155405 3904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Ccdc88cQ6VGS5 Gm11246-201ENSMUST00000120880 345 ntBASIC12.97□□□□□ -0.33
Ccdc88cQ6VGS5 Dnmt3bos-201ENSMUST00000124988 718 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Ccdc88cQ6VGS5 Smlr1-201ENSMUST00000179685 669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Ccdc88cQ6VGS5 Gm28388-201ENSMUST00000186262 437 ntBASIC12.97□□□□□ -0.33
Ccdc88cQ6VGS5 Mllt11-204ENSMUST00000198948 793 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Ccdc88cQ6VGS5 1110019B22Rik-202ENSMUST00000218396 989 ntTSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Ccdc88cQ6VGS5 AC153929.1-201ENSMUST00000219009 303 ntBASIC12.97□□□□□ -0.33
Ccdc88cQ6VGS5 Runx1-202ENSMUST00000113956 4738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Ccdc88cQ6VGS5 Gm19817-201ENSMUST00000199764 2132 ntBASIC12.97□□□□□ -0.33
Ccdc88cQ6VGS5 Gm14169-201ENSMUST00000124676 2519 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Ccdc88cQ6VGS5 Gid8-202ENSMUST00000078687 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Ccdc88cQ6VGS5 Sectm1b-201ENSMUST00000039309 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Ccdc88cQ6VGS5 Ikbkg-205ENSMUST00000114129 2222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Ccdc88cQ6VGS5 Cyfip1-201ENSMUST00000032629 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Ccdc88cQ6VGS5 Gm10785-201ENSMUST00000156242 1583 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Ccdc88cQ6VGS5 Stau1-201ENSMUST00000049412 2840 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Ccdc88cQ6VGS5 AC166836.1-201ENSMUST00000219933 1795 ntBASIC12.97□□□□□ -0.33
Ccdc88cQ6VGS5 Hspa14-201ENSMUST00000027961 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Ccdc88cQ6VGS5 Tapbpl-201ENSMUST00000043422 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Ccdc88cQ6VGS5 2410131K14Rik-201ENSMUST00000049138 5649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Ccdc88cQ6VGS5 Rab11fip1-203ENSMUST00000209377 3769 ntTSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Ccdc88cQ6VGS5 Gm28424-201ENSMUST00000187393 1319 ntBASIC12.97□□□□□ -0.33
Ccdc88cQ6VGS5 Mip-201ENSMUST00000026455 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Ccdc88cQ6VGS5 Kctd10-202ENSMUST00000102581 3103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Ccdc88cQ6VGS5 Tgfbr3-201ENSMUST00000031224 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Ccdc88cQ6VGS5 Xndc1-201ENSMUST00000094130 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Ccdc88cQ6VGS5 Ndrg2-201ENSMUST00000004673 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Ccdc88cQ6VGS5 Pink1-202ENSMUST00000105816 1465 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Ccdc88cQ6VGS5 AU015791-201ENSMUST00000223443 1457 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Ccdc88cQ6VGS5 Cideb-201ENSMUST00000001497 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Ccdc88cQ6VGS5 Prss36-208ENSMUST00000156152 1132 ntTSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Ccdc88cQ6VGS5 Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Ccdc88cQ6VGS5 Gm34821-201ENSMUST00000208399 1031 ntTSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Ccdc88cQ6VGS5 Ercc2-201ENSMUST00000062831 3578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Ccdc88cQ6VGS5 Grid2-201ENSMUST00000095852 5860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Ccdc88cQ6VGS5 Psg23-201ENSMUST00000057810 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Ccdc88cQ6VGS5 Celf3-201ENSMUST00000029784 2744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Ccdc88cQ6VGS5 Cd33-202ENSMUST00000039861 1791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Ccdc88cQ6VGS5 Cry2-201ENSMUST00000090559 3976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Ccdc88cQ6VGS5 Gdf10-201ENSMUST00000168727 5210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Ccdc88cQ6VGS5 Ebf3-203ENSMUST00000168203 3724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Ccdc88cQ6VGS5 Vrk1-201ENSMUST00000021539 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Ccdc88cQ6VGS5 Cpeb3-212ENSMUST00000154376 5671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Ccdc88cQ6VGS5 Aars2-201ENSMUST00000024733 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Ccdc88cQ6VGS5 Nrf1-220ENSMUST00000170535 1527 ntTSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Ccdc88cQ6VGS5 Cpne1-201ENSMUST00000079312 1683 ntTSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 64 ms