Protein–RNA interactions for Protein: Q6PCN3

Ttbk1, Tau-tubulin kinase 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,308 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttbk1Q6PCN3 Gm25554-201ENSMUST00000158075 113 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Ttbk1Q6PCN3 Kif4-ps-202ENSMUST00000185083 652 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Ttbk1Q6PCN3 Gm43249-201ENSMUST00000200464 458 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Ttbk1Q6PCN3 E230014E18Rik-201ENSMUST00000215920 859 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ttbk1Q6PCN3 Fxyd2-211ENSMUST00000216289 668 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ttbk1Q6PCN3 Gm9758-201ENSMUST00000035980 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ttbk1Q6PCN3 Krtap19-5-201ENSMUST00000053460 483 ntAPPRIS P1 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ttbk1Q6PCN3 4930572O03Rik-201ENSMUST00000092696 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ttbk1Q6PCN3 Bag6-203ENSMUST00000172571 3599 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ttbk1Q6PCN3 Ctbp1-212ENSMUST00000202962 3595 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ttbk1Q6PCN3 Coro6-202ENSMUST00000052515 1476 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ttbk1Q6PCN3 Smok4a-201ENSMUST00000074512 1455 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Ttbk1Q6PCN3 Wdr81-204ENSMUST00000173320 6908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ttbk1Q6PCN3 Hmox1-201ENSMUST00000005548 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ttbk1Q6PCN3 Ibtk-201ENSMUST00000039213 5650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ttbk1Q6PCN3 Usp10-210ENSMUST00000144458 3726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ttbk1Q6PCN3 A530083I20Rik-201ENSMUST00000180486 2421 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ttbk1Q6PCN3 Zfp385b-203ENSMUST00000111830 2642 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ttbk1Q6PCN3 Adck1-202ENSMUST00000166940 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ttbk1Q6PCN3 Folr1-203ENSMUST00000106983 1307 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ttbk1Q6PCN3 Kcne3-202ENSMUST00000170954 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ttbk1Q6PCN3 Acin1-219ENSMUST00000148754 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ttbk1Q6PCN3 Mboat2-201ENSMUST00000078902 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ttbk1Q6PCN3 Rabgef1-203ENSMUST00000119797 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ttbk1Q6PCN3 Scube1-203ENSMUST00000076060 3913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ttbk1Q6PCN3 Fuca2-201ENSMUST00000060212 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ttbk1Q6PCN3 Caskin2-201ENSMUST00000041684 4929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ttbk1Q6PCN3 Fgfr3-215ENSMUST00000202138 3960 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ttbk1Q6PCN3 Kndc1-201ENSMUST00000053445 7299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ttbk1Q6PCN3 Pemt-202ENSMUST00000102692 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ttbk1Q6PCN3 Hist1h4i-201ENSMUST00000102977 727 ntAPPRIS P1 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ttbk1Q6PCN3 Gm8019-201ENSMUST00000119317 587 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Ttbk1Q6PCN3 Cideb-201ENSMUST00000001497 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ttbk1Q6PCN3 Tex35-201ENSMUST00000027884 909 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ttbk1Q6PCN3 Acyp1-201ENSMUST00000008966 648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ttbk1Q6PCN3 Nhlh2-203ENSMUST00000198675 3943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ttbk1Q6PCN3 Ptpn2-202ENSMUST00000120934 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ttbk1Q6PCN3 Gm8110-202ENSMUST00000211297 1782 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ttbk1Q6PCN3 Dnajc14-207ENSMUST00000219508 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ttbk1Q6PCN3 Grm1-201ENSMUST00000044306 6930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ttbk1Q6PCN3 Vax2os-203ENSMUST00000155159 4063 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ttbk1Q6PCN3 Rspo2-203ENSMUST00000226810 3091 ntAPPRIS P1 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ttbk1Q6PCN3 Pitpnm3-202ENSMUST00000108508 6450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ttbk1Q6PCN3 Myo10-202ENSMUST00000110457 8125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ttbk1Q6PCN3 Gm13305-201ENSMUST00000098121 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ttbk1Q6PCN3 Vrk1-204ENSMUST00000220629 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ttbk1Q6PCN3 Lrrc56-202ENSMUST00000070458 2502 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ttbk1Q6PCN3 Gm7701-201ENSMUST00000163185 1479 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Ttbk1Q6PCN3 Slc34a1-201ENSMUST00000057167 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ttbk1Q6PCN3 Litaf-201ENSMUST00000023143 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ttbk1Q6PCN3 Ighv1-56-201ENSMUST00000103527 294 ntAPPRIS P1 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ttbk1Q6PCN3 Mir453-201ENSMUST00000104732 82 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Ttbk1Q6PCN3 Gm11554-201ENSMUST00000105056 890 ntAPPRIS P1 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ttbk1Q6PCN3 Anxa8-202ENSMUST00000120077 1208 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ttbk1Q6PCN3 Gm20703-201ENSMUST00000175668 385 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ttbk1Q6PCN3 1700009J07Rik-202ENSMUST00000185309 920 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ttbk1Q6PCN3 Gm2594-201ENSMUST00000214774 742 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Ttbk1Q6PCN3 Gm9487-201ENSMUST00000216600 472 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Ttbk1Q6PCN3 AC107752.1-201ENSMUST00000219362 469 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Ttbk1Q6PCN3 Aven-202ENSMUST00000099588 791 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ttbk1Q6PCN3 1600020E01Rik-206ENSMUST00000204663 2007 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ttbk1Q6PCN3 Spata5-209ENSMUST00000198968 2916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ttbk1Q6PCN3 Paupar-201ENSMUST00000194826 3482 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Ttbk1Q6PCN3 Ppp1r9b-202ENSMUST00000107748 3095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ttbk1Q6PCN3 Gm26543-201ENSMUST00000180729 2221 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Ttbk1Q6PCN3 Ccne2-201ENSMUST00000029866 3006 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Ttbk1Q6PCN3 Kdm3a-214ENSMUST00000207023 4753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
Ttbk1Q6PCN3 Rcsd1-201ENSMUST00000040357 2622 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Ttbk1Q6PCN3 Ero1lb-201ENSMUST00000071973 4239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Ttbk1Q6PCN3 Tekt3-201ENSMUST00000035732 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ttbk1Q6PCN3 Styxl1-203ENSMUST00000111162 726 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ttbk1Q6PCN3 Gm14397-201ENSMUST00000124728 576 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ttbk1Q6PCN3 Erg-208ENSMUST00000176345 1222 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ttbk1Q6PCN3 Gm5267-201ENSMUST00000191574 1045 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Ttbk1Q6PCN3 Gm18010-201ENSMUST00000203553 202 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Ttbk1Q6PCN3 AC122840.4-201ENSMUST00000221310 1285 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ttbk1Q6PCN3 AC164556.1-201ENSMUST00000221318 751 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Ttbk1Q6PCN3 AC154305.4-201ENSMUST00000224520 614 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Ttbk1Q6PCN3 AC169511.1-201ENSMUST00000227639 995 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Ttbk1Q6PCN3 Olfr63-201ENSMUST00000067840 955 ntAPPRIS P1 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ttbk1Q6PCN3 Krtap12-1-201ENSMUST00000092370 656 ntAPPRIS P1 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ttbk1Q6PCN3 Ablim1-211ENSMUST00000111555 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ttbk1Q6PCN3 Lipe-208ENSMUST00000206861 3171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ttbk1Q6PCN3 Epha8-201ENSMUST00000030420 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ttbk1Q6PCN3 Apaf1-207ENSMUST00000161987 2710 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ttbk1Q6PCN3 Arhgap27-204ENSMUST00000107024 3976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ttbk1Q6PCN3 Ccndbp1-202ENSMUST00000099488 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ttbk1Q6PCN3 Lrpprc-201ENSMUST00000112308 4393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ttbk1Q6PCN3 Rtbdn-204ENSMUST00000152378 2322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ttbk1Q6PCN3 Ptk2-201ENSMUST00000110036 4184 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ttbk1Q6PCN3 Dll1-201ENSMUST00000014917 3581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ttbk1Q6PCN3 Tuba1a-201ENSMUST00000097014 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ttbk1Q6PCN3 Vcl-201ENSMUST00000022369 5267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ttbk1Q6PCN3 Fam222b-201ENSMUST00000073705 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ttbk1Q6PCN3 1810030O07Rik-201ENSMUST00000060108 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ttbk1Q6PCN3 Gm6755-201ENSMUST00000100598 864 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Ttbk1Q6PCN3 Gm6740-201ENSMUST00000100617 864 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Ttbk1Q6PCN3 Ighv1-80-201ENSMUST00000103547 351 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ttbk1Q6PCN3 Trav12-3-201ENSMUST00000103657 442 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ttbk1Q6PCN3 Gm11540-201ENSMUST00000117457 780 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 84.4 ms