Protein–RNA interactions for Protein: Q6IFX3

Krt40, Keratin, type I cytoskeletal 40, mousemouse

Predictions only

Length 439 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krt40Q6IFX3 Syt1-202ENSMUST00000105276 4820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Krt40Q6IFX3 Pfkfb2-208ENSMUST00000187089 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Krt40Q6IFX3 Oc90-202ENSMUST00000079776 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Krt40Q6IFX3 Arntl2-202ENSMUST00000111636 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Krt40Q6IFX3 Neu2-207ENSMUST00000172222 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Krt40Q6IFX3 Tgfbr2-201ENSMUST00000035014 3476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Krt40Q6IFX3 Shank2-203ENSMUST00000105902 8988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Krt40Q6IFX3 Alox5-202ENSMUST00000164547 1854 ntTSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Krt40Q6IFX3 Slc24a5-201ENSMUST00000070353 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Krt40Q6IFX3 1700082M22Rik-201ENSMUST00000067136 2022 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Krt40Q6IFX3 Hnrnpf-201ENSMUST00000035493 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Krt40Q6IFX3 Bpgm-201ENSMUST00000045372 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Krt40Q6IFX3 Tcf12-201ENSMUST00000034755 4621 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Krt40Q6IFX3 Lgals3bp-201ENSMUST00000043722 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Krt40Q6IFX3 Tapbpl-201ENSMUST00000043422 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Krt40Q6IFX3 Cpt1c-206ENSMUST00000212836 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
Krt40Q6IFX3 4932443L11Rik-202ENSMUST00000177130 2827 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
Krt40Q6IFX3 Phyhipl-201ENSMUST00000046513 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
Krt40Q6IFX3 Slc27a2-201ENSMUST00000061491 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
Krt40Q6IFX3 Nuak2-202ENSMUST00000082125 3107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
Krt40Q6IFX3 Adipor2-202ENSMUST00000169744 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
Krt40Q6IFX3 Kcnab2-201ENSMUST00000030768 3533 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
Krt40Q6IFX3 Arhgef2-203ENSMUST00000170653 4238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
Krt40Q6IFX3 Klhl18-201ENSMUST00000068025 4530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
Krt40Q6IFX3 Rbl1-201ENSMUST00000029170 4862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
Krt40Q6IFX3 A230006K03Rik-201ENSMUST00000107533 977 ntTSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Krt40Q6IFX3 Map7d2-202ENSMUST00000112470 1350 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Krt40Q6IFX3 Lhx6-201ENSMUST00000112960 3345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Krt40Q6IFX3 Mdh1b-201ENSMUST00000114094 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Krt40Q6IFX3 Gm15549-201ENSMUST00000121595 622 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
Krt40Q6IFX3 Rbm18-202ENSMUST00000122456 781 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Krt40Q6IFX3 Gm12446-201ENSMUST00000123933 798 ntTSL 3 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Krt40Q6IFX3 Rnf170-201ENSMUST00000014022 3929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Krt40Q6IFX3 Mroh1-204ENSMUST00000159218 5085 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Krt40Q6IFX3 Rsrc1-206ENSMUST00000162036 1406 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Krt40Q6IFX3 Gm28727-201ENSMUST00000176549 443 ntTSL 3 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Krt40Q6IFX3 Gm9358-201ENSMUST00000183067 927 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
Krt40Q6IFX3 Gm28388-201ENSMUST00000186262 437 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
Krt40Q6IFX3 1600010M07Rik-202ENSMUST00000188662 654 ntTSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Krt40Q6IFX3 Pde1c-209ENSMUST00000203372 3147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Krt40Q6IFX3 Gm5996-201ENSMUST00000211110 718 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
Krt40Q6IFX3 Pla2g15-204ENSMUST00000212963 2578 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Krt40Q6IFX3 Gm3285-201ENSMUST00000218443 908 ntAPPRIS P1 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Krt40Q6IFX3 Mmp19-203ENSMUST00000219404 2236 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Krt40Q6IFX3 Tmprss4-201ENSMUST00000034599 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Krt40Q6IFX3 Taar9-201ENSMUST00000041180 1047 ntAPPRIS P1 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Krt40Q6IFX3 Olfr411-201ENSMUST00000080365 1049 ntAPPRIS P1 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Krt40Q6IFX3 Lhfpl5-201ENSMUST00000080780 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Krt40Q6IFX3 Lzts3-202ENSMUST00000089561 4169 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Krt40Q6IFX3 C530008M17Rik-204ENSMUST00000121160 6921 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Krt40Q6IFX3 Kalrn-211ENSMUST00000114966 3857 ntTSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Krt40Q6IFX3 Syvn1-207ENSMUST00000156550 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Krt40Q6IFX3 Rbm12b2-201ENSMUST00000063839 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Krt40Q6IFX3 Cc2d1a-202ENSMUST00000117424 3262 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Krt40Q6IFX3 Fbln7-202ENSMUST00000110324 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Krt40Q6IFX3 Myocd-201ENSMUST00000101042 2585 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Krt40Q6IFX3 Gm2464-201ENSMUST00000180838 2551 ntTSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Krt40Q6IFX3 Gm35339-201ENSMUST00000208833 5090 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Krt40Q6IFX3 Alpi-201ENSMUST00000113270 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Krt40Q6IFX3 Ino80c-203ENSMUST00000141489 2207 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Krt40Q6IFX3 AC164702.1-201ENSMUST00000220135 2212 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
Krt40Q6IFX3 Gid8-202ENSMUST00000078687 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Krt40Q6IFX3 Gm13561-201ENSMUST00000136879 1826 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Krt40Q6IFX3 2900041M22Rik-201ENSMUST00000155384 1784 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Krt40Q6IFX3 Tbata-201ENSMUST00000035894 1506 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Krt40Q6IFX3 AU015791-201ENSMUST00000223443 1457 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Krt40Q6IFX3 Brd4-202ENSMUST00000114475 2731 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Krt40Q6IFX3 D030025P21Rik-202ENSMUST00000220643 3987 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
Krt40Q6IFX3 Olfr22-ps1-201ENSMUST00000115991 1237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Krt40Q6IFX3 Mir1901-201ENSMUST00000122616 78 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
Krt40Q6IFX3 B230119M05Rik-201ENSMUST00000154072 979 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Krt40Q6IFX3 H1foo-203ENSMUST00000161969 1122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Krt40Q6IFX3 Crhr2-204ENSMUST00000164012 1263 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Krt40Q6IFX3 Mocs2-203ENSMUST00000164737 745 ntTSL 3 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Krt40Q6IFX3 Gm18159-201ENSMUST00000174516 1070 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
Krt40Q6IFX3 Gm29560-201ENSMUST00000191526 881 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Krt40Q6IFX3 1700003I16Rik-201ENSMUST00000205198 1058 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Krt40Q6IFX3 Gm45219-201ENSMUST00000205602 465 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
Krt40Q6IFX3 Gm18856-203ENSMUST00000222015 483 ntTSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Krt40Q6IFX3 Tff2-201ENSMUST00000024826 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Krt40Q6IFX3 Apoc4-201ENSMUST00000003071 538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Krt40Q6IFX3 Pgpep1l-201ENSMUST00000032770 953 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Krt40Q6IFX3 Prm3-201ENSMUST00000050864 410 ntAPPRIS P1 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Krt40Q6IFX3 Cmbl-201ENSMUST00000070918 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Krt40Q6IFX3 Vsx1-201ENSMUST00000046095 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Krt40Q6IFX3 Ptdss2-201ENSMUST00000026568 3624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Krt40Q6IFX3 Grsf1-202ENSMUST00000113234 2286 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Krt40Q6IFX3 Aldh4a1-201ENSMUST00000039818 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Krt40Q6IFX3 Hectd1-201ENSMUST00000042052 8988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Krt40Q6IFX3 Mamld1-202ENSMUST00000114629 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Krt40Q6IFX3 Mcpt9-201ENSMUST00000095798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Krt40Q6IFX3 Jarid2-201ENSMUST00000044608 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Krt40Q6IFX3 Dnaic2-202ENSMUST00000092469 2799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Krt40Q6IFX3 Bmp7-201ENSMUST00000009143 3670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Krt40Q6IFX3 Srp54a-202ENSMUST00000220578 4498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Krt40Q6IFX3 4931406C07Rik-202ENSMUST00000178977 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Krt40Q6IFX3 Msh5-202ENSMUST00000097338 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Krt40Q6IFX3 Sdc4-201ENSMUST00000017153 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Krt40Q6IFX3 Gm37600-201ENSMUST00000193764 3292 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Krt40Q6IFX3 Cdc37l1-208ENSMUST00000225310 4079 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
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