Protein–RNA interactions for Protein: Q6DFW0

Guanine nucleotide exchange C9orf72 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 481 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q6DFW0 Gm14441-201ENSMUST00000121960 540 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
Q6DFW0 4933406I18Rik-201ENSMUST00000124673 905 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Q6DFW0 Kcnmb4os1-201ENSMUST00000134586 824 ntTSL 2 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Q6DFW0 Gm829-202ENSMUST00000146622 722 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Q6DFW0 6530403H02Rik-204ENSMUST00000183276 659 ntTSL 3 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Q6DFW0 Pcbd1-201ENSMUST00000020298 789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Q6DFW0 Gm5950-201ENSMUST00000213337 772 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
Q6DFW0 Tpd52l1-203ENSMUST00000213639 827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Q6DFW0 Fn3k-201ENSMUST00000026175 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Q6DFW0 Tmem247-201ENSMUST00000042172 752 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Q6DFW0 Fmr1nb-202ENSMUST00000071848 842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Q6DFW0 Tbc1d14-210ENSMUST00000140607 4649 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Q6DFW0 Corin-202ENSMUST00000167460 4639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Q6DFW0 Gm45187-201ENSMUST00000207697 2760 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Q6DFW0 Zfp941-201ENSMUST00000080651 2791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Q6DFW0 Herc3-201ENSMUST00000031823 3596 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Q6DFW0 Gm17089-201ENSMUST00000171098 1394 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Q6DFW0 Gm4780-202ENSMUST00000215200 2644 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
Q6DFW0 Synpo2l-202ENSMUST00000117386 3979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Q6DFW0 Cep76-201ENSMUST00000097542 3979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Q6DFW0 Lgals8-201ENSMUST00000099820 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Q6DFW0 Gpr155-203ENSMUST00000112043 3284 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Q6DFW0 H2-Q1-201ENSMUST00000073208 2024 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Q6DFW0 Aldh3a2-203ENSMUST00000108715 2578 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Q6DFW0 Sfrp4-203ENSMUST00000222464 4049 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Q6DFW0 Gm38140-201ENSMUST00000193617 2755 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
Q6DFW0 Phyhipl-201ENSMUST00000046513 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Q6DFW0 Atp4a-204ENSMUST00000170371 3447 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Q6DFW0 Sorcs1-202ENSMUST00000111756 3617 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Q6DFW0 Sorcs1-207ENSMUST00000211008 3617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Q6DFW0 Ccpg1-201ENSMUST00000037977 3151 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Q6DFW0 Mroh1-201ENSMUST00000092595 5111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Q6DFW0 Pdzd7-203ENSMUST00000169459 3903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Q6DFW0 Hbs1l-209ENSMUST00000219915 2733 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Q6DFW0 Myo16-201ENSMUST00000042103 6725 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Q6DFW0 5830417I10Rik-201ENSMUST00000135913 6190 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
Q6DFW0 Crkl-201ENSMUST00000006293 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Q6DFW0 Amz2-203ENSMUST00000103061 1832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Q6DFW0 Inca1-203ENSMUST00000108542 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Q6DFW0 Mrpl55-203ENSMUST00000108785 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Q6DFW0 Gm13205-201ENSMUST00000123548 562 ntTSL 3 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Q6DFW0 Gm15906-201ENSMUST00000124746 323 ntTSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Q6DFW0 Gm14019-201ENSMUST00000131514 403 ntTSL 3 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Q6DFW0 Mymx-203ENSMUST00000178858 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Q6DFW0 Gm28379-201ENSMUST00000186450 554 ntTSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Q6DFW0 Gm38979-201ENSMUST00000207099 698 ntTSL 3 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Q6DFW0 AC159747.1-201ENSMUST00000219903 265 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
Q6DFW0 H2-M10.2-201ENSMUST00000023845 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Q6DFW0 Sirt5-201ENSMUST00000066804 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Q6DFW0 Ttll10-202ENSMUST00000051509 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Q6DFW0 Zfp536-202ENSMUST00000175941 4423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Q6DFW0 Erich3-203ENSMUST00000189969 3460 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
Q6DFW0 Phldb2-201ENSMUST00000036355 5483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Q6DFW0 Prdx2-202ENSMUST00000109733 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Q6DFW0 Elavl2-207ENSMUST00000107118 3797 ntTSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Q6DFW0 CT010498.2-201ENSMUST00000225690 1659 ntAPPRIS P1 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Q6DFW0 Radil-203ENSMUST00000110784 3106 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Q6DFW0 Lck-208ENSMUST00000167288 2074 ntTSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Q6DFW0 Foxn2-201ENSMUST00000112238 5085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Q6DFW0 Mfsd4b5-203ENSMUST00000164566 2372 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Q6DFW0 Glis3-209ENSMUST00000162022 7514 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Q6DFW0 Mki67-201ENSMUST00000033310 10061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Q6DFW0 Dip2c-201ENSMUST00000166299 4822 ntTSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Q6DFW0 Fut8-203ENSMUST00000177595 2980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Q6DFW0 Nom1-201ENSMUST00000001611 9219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Q6DFW0 Pif1-203ENSMUST00000134538 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Q6DFW0 Igfn1-203ENSMUST00000166193 8989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Q6DFW0 4933431M02Rik-201ENSMUST00000203905 1432 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Q6DFW0 Strada-202ENSMUST00000103072 1517 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Q6DFW0 Tcof1-202ENSMUST00000175934 4595 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Q6DFW0 Rsc1a1-201ENSMUST00000105782 1749 ntAPPRIS P1 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Q6DFW0 Clasp1-216ENSMUST00000189738 5373 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Q6DFW0 Atad2-201ENSMUST00000038194 5684 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Q6DFW0 Pcdh12-203ENSMUST00000194012 2702 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Q6DFW0 Mbd1-202ENSMUST00000224047 2838 ntAPPRIS P1 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Q6DFW0 Kat7-203ENSMUST00000103159 3248 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Q6DFW0 Slc12a9-201ENSMUST00000039991 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Q6DFW0 Mmp25-201ENSMUST00000024696 3373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Q6DFW0 Tspan14-202ENSMUST00000224209 2477 ntAPPRIS P1 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Q6DFW0 A130010J15Rik-204ENSMUST00000161235 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Q6DFW0 Serpina1b-203ENSMUST00000186166 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Q6DFW0 Grm1-203ENSMUST00000105561 4435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Q6DFW0 1700003D09Rik-201ENSMUST00000141929 1389 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Q6DFW0 Gm25214-201ENSMUST00000104573 129 ntBASIC12.11□□□□□ -0.47
Q6DFW0 Mia-202ENSMUST00000121848 572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Q6DFW0 4930515B02Rik-201ENSMUST00000140588 591 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Q6DFW0 Egfl7-209ENSMUST00000150404 892 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Q6DFW0 Gm15395-201ENSMUST00000153724 702 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Q6DFW0 Gm29199-201ENSMUST00000187766 775 ntBASIC12.11□□□□□ -0.47
Q6DFW0 Gm29585-203ENSMUST00000188089 835 ntTSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Q6DFW0 Gsdmcl-ps-204ENSMUST00000191285 637 ntTSL 3 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Q6DFW0 Gm42797-201ENSMUST00000197573 494 ntTSL 3 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Q6DFW0 4930504D19Rik-201ENSMUST00000204799 349 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Q6DFW0 Gm33115-201ENSMUST00000220913 743 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Q6DFW0 CT485787.1-201ENSMUST00000225617 968 ntBASIC12.11□□□□□ -0.47
Q6DFW0 Trex2-201ENSMUST00000033738 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Q6DFW0 Gm8420-201ENSMUST00000097103 598 ntBASIC12.11□□□□□ -0.47
Q6DFW0 Clvs2-204ENSMUST00000161692 4283 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Q6DFW0 Xpnpep1-211ENSMUST00000183274 2120 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Q6DFW0 Fxr1-206ENSMUST00000198051 2127 ntTSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.9 ms