Protein–RNA interactions for Protein: Q64347

Clcn1, Chloride channel protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 994 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clcn1Q64347 Tbc1d4-209ENSMUST00000161991 6483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Clcn1Q64347 Gm29050-201ENSMUST00000190732 2528 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Clcn1Q64347 Rgs9bp-201ENSMUST00000069912 6590 ntAPPRIS P1 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Clcn1Q64347 Brd3-202ENSMUST00000077737 5272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Clcn1Q64347 Ntng1-208ENSMUST00000133268 5587 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Clcn1Q64347 Arhgef2-219ENSMUST00000176500 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Clcn1Q64347 Irs1-201ENSMUST00000069799 9144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Clcn1Q64347 Cadm1-203ENSMUST00000114547 4444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Clcn1Q64347 Pcsk7-201ENSMUST00000039059 3876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Clcn1Q64347 Plch2-210ENSMUST00000176194 5619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Clcn1Q64347 Msra-201ENSMUST00000067927 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Clcn1Q64347 AC159314.1-201ENSMUST00000216917 3485 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Clcn1Q64347 Slx4ip-201ENSMUST00000028737 2556 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Clcn1Q64347 Aurkc-203ENSMUST00000207711 1320 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Clcn1Q64347 Fnbp4-201ENSMUST00000013759 4691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Clcn1Q64347 Armcx2-201ENSMUST00000035559 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Clcn1Q64347 Kalrn-210ENSMUST00000114964 2693 ntTSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Clcn1Q64347 Serpinb12-202ENSMUST00000112724 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Clcn1Q64347 Clic3-201ENSMUST00000102918 791 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Clcn1Q64347 Nudt1-205ENSMUST00000110827 744 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Clcn1Q64347 1700080O16Rik-202ENSMUST00000114866 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Clcn1Q64347 Gm25509-201ENSMUST00000116985 106 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
Clcn1Q64347 n-R5s84-201ENSMUST00000122591 109 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
Clcn1Q64347 Gm3150-201ENSMUST00000166418 204 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
Clcn1Q64347 4930535L15Rik-201ENSMUST00000175891 536 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Clcn1Q64347 Ccl19-ps3-201ENSMUST00000179634 324 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
Clcn1Q64347 Gm12407-201ENSMUST00000180219 324 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
Clcn1Q64347 Gm27241-202ENSMUST00000185013 570 ntTSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Clcn1Q64347 Gm42518-201ENSMUST00000196277 938 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
Clcn1Q64347 4930405N21Rik-201ENSMUST00000199950 1200 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
Clcn1Q64347 Gm43974-201ENSMUST00000205080 684 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
Clcn1Q64347 Gm45113-201ENSMUST00000207518 165 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
Clcn1Q64347 Gm3285-201ENSMUST00000218443 908 ntAPPRIS P1 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Clcn1Q64347 4930423D24Rik-202ENSMUST00000219785 554 ntTSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Clcn1Q64347 Fam25c-201ENSMUST00000052126 408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Clcn1Q64347 Sprr2a2-202ENSMUST00000090871 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Clcn1Q64347 n-R5s211-201ENSMUST00000093689 119 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
Clcn1Q64347 Lipe-201ENSMUST00000003207 3613 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Clcn1Q64347 Fam45a-202ENSMUST00000119633 2267 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Clcn1Q64347 Wbp1l-201ENSMUST00000099376 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Clcn1Q64347 Gm18198-201ENSMUST00000204986 1551 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
Clcn1Q64347 Rassf8-201ENSMUST00000032388 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Clcn1Q64347 Sdr9c7-201ENSMUST00000047134 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Clcn1Q64347 Gipc3-201ENSMUST00000045102 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Clcn1Q64347 2410131K14Rik-201ENSMUST00000049138 5649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Clcn1Q64347 Duoxa1-202ENSMUST00000110537 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Clcn1Q64347 Scyl2-201ENSMUST00000092227 3566 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Clcn1Q64347 Gm18983-201ENSMUST00000222884 2729 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
Clcn1Q64347 Igtp-202ENSMUST00000094169 1767 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Clcn1Q64347 Klhl18-201ENSMUST00000068025 4530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Clcn1Q64347 Bdnf-205ENSMUST00000111045 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Clcn1Q64347 Gm15610-201ENSMUST00000120584 195 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
Clcn1Q64347 Gm44805-202ENSMUST00000150569 587 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Clcn1Q64347 Slc14a1-203ENSMUST00000160639 2047 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Clcn1Q64347 Gm15744-201ENSMUST00000161734 213 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
Clcn1Q64347 Nlrp5-ps-202ENSMUST00000173220 1294 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
Clcn1Q64347 Pfdn6-202ENSMUST00000173363 871 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Clcn1Q64347 Gm3551-201ENSMUST00000190750 664 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
Clcn1Q64347 9530097N15Rik-201ENSMUST00000197819 1068 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
Clcn1Q64347 Gm44421-201ENSMUST00000205064 1221 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
Clcn1Q64347 Gm44506-201ENSMUST00000206278 965 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
Clcn1Q64347 Gm19091-201ENSMUST00000208120 978 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
Clcn1Q64347 AC120394.2-201ENSMUST00000213905 702 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Clcn1Q64347 Olfr1419-203ENSMUST00000217617 3087 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Clcn1Q64347 Rxfp3-201ENSMUST00000058007 4275 ntAPPRIS P1 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Clcn1Q64347 Arhgap39-201ENSMUST00000036176 4500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Clcn1Q64347 2900097C17Rik-202ENSMUST00000192863 4915 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
Clcn1Q64347 Gm9796-201ENSMUST00000062249 2250 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
Clcn1Q64347 Mtdh-201ENSMUST00000022865 6919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Clcn1Q64347 Mdga2-201ENSMUST00000037181 9833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Clcn1Q64347 Ahi1-201ENSMUST00000105525 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Clcn1Q64347 Tti2-202ENSMUST00000209851 3133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Clcn1Q64347 Lrrc18-204ENSMUST00000120951 1511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.02
Clcn1Q64347 Nxph1-202ENSMUST00000160300 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Clcn1Q64347 Mamdc4-202ENSMUST00000114223 3998 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.02
Clcn1Q64347 Entpd5-203ENSMUST00000110272 4972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Clcn1Q64347 Ttc23-202ENSMUST00000107470 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.02
Clcn1Q64347 Gm28047-201ENSMUST00000184772 1611 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Clcn1Q64347 Gm37391-201ENSMUST00000194891 2318 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Clcn1Q64347 Rapgef3-204ENSMUST00000128775 3586 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Clcn1Q64347 AC164441.2-201ENSMUST00000220818 2746 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Clcn1Q64347 Rbm39-201ENSMUST00000029149 2711 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Clcn1Q64347 Pik3cd-203ENSMUST00000105689 3132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Clcn1Q64347 Fbxo41-202ENSMUST00000161078 6562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Clcn1Q64347 Fmo2-202ENSMUST00000111510 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Clcn1Q64347 Nsf-202ENSMUST00000103075 3766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Clcn1Q64347 Ncmap-201ENSMUST00000064481 1448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Clcn1Q64347 Hspa9-201ENSMUST00000025217 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Clcn1Q64347 Gm25880-201ENSMUST00000104331 132 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Clcn1Q64347 Ptges3l-203ENSMUST00000107252 853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Clcn1Q64347 A230006K03Rik-201ENSMUST00000107533 977 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Clcn1Q64347 4631405J19Rik-204ENSMUST00000145926 936 ntTSL 3 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Clcn1Q64347 Acat3-202ENSMUST00000160378 987 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Clcn1Q64347 Dpf3-206ENSMUST00000177959 1298 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Clcn1Q64347 Gm7137-201ENSMUST00000180161 711 ntAPPRIS P1 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Clcn1Q64347 Psmb6-201ENSMUST00000018430 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Clcn1Q64347 2310074N15Rik-201ENSMUST00000198276 582 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Clcn1Q64347 Gm21221-201ENSMUST00000202876 1073 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Clcn1Q64347 Gm35549-202ENSMUST00000203656 1009 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Clcn1Q64347 Gm8342-201ENSMUST00000209839 757 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.9 ms