Protein–RNA interactions for Protein: Q64213

Sf1, Splicing factor 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 653 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sf1Q64213 Cyp4x1-201ENSMUST00000051400 1524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Sf1Q64213 Armcx3-202ENSMUST00000086880 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Sf1Q64213 Rnh1-202ENSMUST00000167493 1656 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Sf1Q64213 Ube2c-201ENSMUST00000001439 2191 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Sf1Q64213 Alms1-ps1-201ENSMUST00000159498 2166 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Sf1Q64213 Celf2-225ENSMUST00000183091 2177 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Sf1Q64213 Mob3a-201ENSMUST00000003438 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Sf1Q64213 Ip6k3-201ENSMUST00000025046 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Sf1Q64213 Pparg-204ENSMUST00000203732 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Sf1Q64213 Phldb2-201ENSMUST00000036355 5483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Sf1Q64213 Terb1-201ENSMUST00000064576 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Sf1Q64213 Ralgps2-207ENSMUST00000188656 2481 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Sf1Q64213 Smarca1-205ENSMUST00000141084 1965 ntTSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Sf1Q64213 Aldh3b2-201ENSMUST00000143380 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Sf1Q64213 Grsf1-202ENSMUST00000113234 2286 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Sf1Q64213 Tfe3-204ENSMUST00000115677 2943 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Sf1Q64213 Gm9279-201ENSMUST00000223175 1606 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Sf1Q64213 AC130671.2-201ENSMUST00000227224 1621 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Sf1Q64213 Sorcs1-205ENSMUST00000209413 4398 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Sf1Q64213 Clec16a-201ENSMUST00000038145 3730 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Sf1Q64213 Brap-202ENSMUST00000111765 3861 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Sf1Q64213 Scoc-202ENSMUST00000167525 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Sf1Q64213 Csnk1a1-202ENSMUST00000163205 3204 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Sf1Q64213 Csrnp3-207ENSMUST00000145598 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Sf1Q64213 4930430F08Rik-201ENSMUST00000054471 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Sf1Q64213 Usp3-211ENSMUST00000174387 1901 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Sf1Q64213 Rpl35a-204ENSMUST00000115078 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Sf1Q64213 Gm13888-201ENSMUST00000119148 422 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
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Sf1Q64213 Gm6019-201ENSMUST00000148369 736 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Sf1Q64213 Gm22144-201ENSMUST00000157402 102 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Sf1Q64213 Taf9-201ENSMUST00000167256 1230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Sf1Q64213 Gm17391-201ENSMUST00000171036 126 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Sf1Q64213 Dusp13-211ENSMUST00000183943 779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Sf1Q64213 Creb1-209ENSMUST00000190348 1260 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Sf1Q64213 Gm28694-201ENSMUST00000190681 722 ntTSL 3 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Sf1Q64213 Gm17831-201ENSMUST00000205579 900 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Sf1Q64213 Gm45484-201ENSMUST00000210310 1141 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Sf1Q64213 Togaram1-207ENSMUST00000223166 6386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Sf1Q64213 Fam151b-201ENSMUST00000040106 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Sf1Q64213 Rasgef1b-203ENSMUST00000146396 3339 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Sf1Q64213 Oxnad1-201ENSMUST00000022462 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Sf1Q64213 Dhx30-212ENSMUST00000197928 4441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Sf1Q64213 Lgr5-201ENSMUST00000020350 4714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Sf1Q64213 Ednrb-203ENSMUST00000227824 2669 ntAPPRIS P1 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Sf1Q64213 Npy5r-203ENSMUST00000212563 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Sf1Q64213 4931406C07Rik-203ENSMUST00000180339 2756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Sf1Q64213 Ccpg1-208ENSMUST00000150826 2939 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Sf1Q64213 Smim1-208ENSMUST00000143047 3373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Sf1Q64213 Sik2-205ENSMUST00000176663 4107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.55
Sf1Q64213 Rbms1-201ENSMUST00000028347 4436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Sf1Q64213 Tmem266-202ENSMUST00000085754 4417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Sf1Q64213 Mrgprg-201ENSMUST00000058092 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
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Sf1Q64213 Myocd-201ENSMUST00000101042 2585 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Sf1Q64213 Lrp8-206ENSMUST00000126573 2590 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.55
Sf1Q64213 Adipor2-202ENSMUST00000169744 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Sf1Q64213 Sf1-208ENSMUST00000131252 4353 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Sf1Q64213 Sh3tc1-201ENSMUST00000070203 4549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Sf1Q64213 Synpo-202ENSMUST00000115318 4479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
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Sf1Q64213 Jak3-201ENSMUST00000051995 4019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Sf1Q64213 1110032A03Rik-201ENSMUST00000042468 2082 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Sf1Q64213 Gm43807-201ENSMUST00000200678 1781 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Sf1Q64213 Ly75-202ENSMUST00000112533 6901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
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Sf1Q64213 Mpv17l-201ENSMUST00000023360 3087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
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Sf1Q64213 Spata20-201ENSMUST00000041705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Sf1Q64213 Shtn1-201ENSMUST00000047511 4081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Sf1Q64213 Als2cl-201ENSMUST00000084926 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Sf1Q64213 Samd4b-201ENSMUST00000040531 4349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Sf1Q64213 Rab11fip5-201ENSMUST00000060837 4035 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Sf1Q64213 Tagln2-202ENSMUST00000111230 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Sf1Q64213 Cstad-201ENSMUST00000102853 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Sf1Q64213 Ttc4-202ENSMUST00000106772 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Sf1Q64213 Cdc42se1-204ENSMUST00000107201 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Sf1Q64213 Gsg1-202ENSMUST00000111909 1087 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
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Sf1Q64213 Gm14291-201ENSMUST00000143645 804 ntTSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Sf1Q64213 Gm11290-203ENSMUST00000147811 314 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Sf1Q64213 Gm20535-201ENSMUST00000173157 1268 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Sf1Q64213 Gm4310-201ENSMUST00000177847 889 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Sf1Q64213 8030442B05Rik-201ENSMUST00000192626 1035 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Sf1Q64213 Gm38117-201ENSMUST00000194653 939 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Sf1Q64213 Ighv1-60-201ENSMUST00000195816 405 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Sf1Q64213 Gm5714-201ENSMUST00000197343 566 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Sf1Q64213 Qdpr-209ENSMUST00000198258 1172 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Sf1Q64213 Fam168a-204ENSMUST00000207564 1083 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Sf1Q64213 Ddo-207ENSMUST00000216830 806 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Sf1Q64213 Colec11-203ENSMUST00000220836 887 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Sf1Q64213 Tie1-201ENSMUST00000047421 4091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Sf1Q64213 AI314180-202ENSMUST00000102889 7045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Sf1Q64213 0610038B21Rik-201ENSMUST00000181420 1687 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Sf1Q64213 Gfi1b-201ENSMUST00000028156 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Sf1Q64213 Dph7-201ENSMUST00000028351 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Sf1Q64213 Apol7e-201ENSMUST00000096358 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Sf1Q64213 Accsl-201ENSMUST00000099690 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47 ms