Protein–RNA interactions for Protein: Q62318

Trim28, Transcription intermediary factor 1-beta, mousemouse

Predictions only

Length 834 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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Trim28Q62318 Fem1a-201ENSMUST00000060253 6816 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
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Trim28Q62318 Samd4-201ENSMUST00000022386 4564 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Trim28Q62318 Syvn1-207ENSMUST00000156550 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Trim28Q62318 Dmrtc1b-203ENSMUST00000118842 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Trim28Q62318 Agtrap-201ENSMUST00000030865 3996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Trim28Q62318 Llgl2-201ENSMUST00000103032 3551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Trim28Q62318 Hsd17b6-203ENSMUST00000219447 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Trim28Q62318 Gm43102-201ENSMUST00000201004 2324 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Trim28Q62318 Tbx4-203ENSMUST00000108047 3153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Trim28Q62318 Cchcr1-205ENSMUST00000173903 3054 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Trim28Q62318 Arid5a-208ENSMUST00000137906 5504 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Trim28Q62318 Lgr5-208ENSMUST00000173740 2508 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Trim28Q62318 Gpa33-202ENSMUST00000060833 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
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