Protein–RNA interactions for Protein: Q60841

Reln, Reelin, mousemouse

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Length 3,461 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RelnQ60841 BC034090-204ENSMUST00000186156 4873 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
RelnQ60841 Rnh1-202ENSMUST00000167493 1656 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
RelnQ60841 Itsn1-206ENSMUST00000113999 5393 ntTSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
RelnQ60841 Tfe3-204ENSMUST00000115677 2943 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
RelnQ60841 Trit1-201ENSMUST00000102649 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
RelnQ60841 9430093N23Rik-201ENSMUST00000152494 515 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
RelnQ60841 Gm25343-201ENSMUST00000157460 107 ntBASIC10.08□□□□□ -0.8
RelnQ60841 Gm43244-201ENSMUST00000196994 1285 ntBASIC10.08□□□□□ -0.8
RelnQ60841 Gm45783-201ENSMUST00000210877 656 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.08□□□□□ -0.8
RelnQ60841 Cypt12-201ENSMUST00000029080 550 ntAPPRIS P1 BASIC10.08□□□□□ -0.8
RelnQ60841 Ces2f-203ENSMUST00000212926 1430 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
RelnQ60841 Pou4f2-201ENSMUST00000034115 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
RelnQ60841 Klhl8-202ENSMUST00000112811 2577 ntTSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
RelnQ60841 Vcp-201ENSMUST00000030164 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
RelnQ60841 Stat5a-203ENSMUST00000107357 3605 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
RelnQ60841 Fbxl22-201ENSMUST00000056890 3935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
RelnQ60841 Rnf180-205ENSMUST00000226044 3279 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.07□□□□□ -0.8
RelnQ60841 Fcer2a-201ENSMUST00000005678 2242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
RelnQ60841 Lrp8-203ENSMUST00000106732 2648 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
RelnQ60841 Med1-202ENSMUST00000092735 2627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
RelnQ60841 Poc1a-201ENSMUST00000072206 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
RelnQ60841 Ercc2-202ENSMUST00000108460 3485 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
RelnQ60841 Zfp365-201ENSMUST00000064656 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
RelnQ60841 Pdzk1ip1-202ENSMUST00000106548 887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
RelnQ60841 Gm12705-201ENSMUST00000129460 872 ntTSL 2 BASIC10.07□□□□□ -0.8
RelnQ60841 Gm16283-201ENSMUST00000149935 522 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
RelnQ60841 Gm14275-201ENSMUST00000152112 430 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
RelnQ60841 Gm5529-201ENSMUST00000165691 891 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
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RelnQ60841 Slc35f6-205ENSMUST00000196740 1972 ntTSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
RelnQ60841 2700038G22Rik-201ENSMUST00000181574 1375 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
RelnQ60841 Duxf3-201ENSMUST00000174056 1486 ntTSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
RelnQ60841 Shroom4-202ENSMUST00000103005 4839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
RelnQ60841 Sgsm2-202ENSMUST00000081799 4873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
RelnQ60841 Wdr20rt-201ENSMUST00000046331 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
RelnQ60841 Trbv31-201ENSMUST00000103300 334 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.07□□□□□ -0.8
RelnQ60841 Sh2d1a-203ENSMUST00000115070 782 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
RelnQ60841 Gm4943-201ENSMUST00000132879 424 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
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RelnQ60841 2410002F23Rik-220ENSMUST00000191537 872 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
RelnQ60841 D5Ertd605e-201ENSMUST00000201128 1081 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
RelnQ60841 Ptma-201ENSMUST00000045897 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
RelnQ60841 Gm10134-201ENSMUST00000074761 381 ntAPPRIS P1 BASIC10.07□□□□□ -0.8
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RelnQ60841 Smtn-204ENSMUST00000110011 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
RelnQ60841 Susd4-201ENSMUST00000085724 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
RelnQ60841 Grpel1-201ENSMUST00000031099 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
RelnQ60841 Fbrsl1-202ENSMUST00000069483 4720 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
RelnQ60841 Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
RelnQ60841 Gm39204-201ENSMUST00000210045 1307 ntTSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
RelnQ60841 Shtn1-202ENSMUST00000163821 3767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
RelnQ60841 Baz1a-205ENSMUST00000173433 5788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
RelnQ60841 Fzd6-201ENSMUST00000022906 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
RelnQ60841 Lrrc75aos2-202ENSMUST00000128647 1227 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
RelnQ60841 Xbp1-204ENSMUST00000149623 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.06□□□□□ -0.8
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RelnQ60841 Gm29261-201ENSMUST00000188535 678 ntTSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
RelnQ60841 1700088E04Rik-211ENSMUST00000190730 691 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
RelnQ60841 Gal-201ENSMUST00000025842 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
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RelnQ60841 Atp2b3-202ENSMUST00000088429 4483 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
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RelnQ60841 Lsm3-201ENSMUST00000040607 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
RelnQ60841 Rpl35a-201ENSMUST00000078804 491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
RelnQ60841 Fcer1g-201ENSMUST00000079957 674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
RelnQ60841 Klk1b5-201ENSMUST00000074359 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
RelnQ60841 C1qtnf6-201ENSMUST00000023075 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
RelnQ60841 Slc4a1-201ENSMUST00000006749 4545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
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RelnQ60841 Ly6e-210ENSMUST00000188866 2068 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.06□□□□□ -0.8
RelnQ60841 Trmt61b-202ENSMUST00000137830 2572 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
RelnQ60841 Ap1s2-203ENSMUST00000112294 3199 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
RelnQ60841 Hgs-203ENSMUST00000106205 2898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
RelnQ60841 Emp1-202ENSMUST00000111907 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
RelnQ60841 Birc3-201ENSMUST00000013949 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
RelnQ60841 Tmf1-201ENSMUST00000095664 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
RelnQ60841 Fam47e-203ENSMUST00000146417 1357 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
RelnQ60841 Gm14071-201ENSMUST00000117817 509 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
RelnQ60841 Gm26550-201ENSMUST00000180699 1184 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
RelnQ60841 Gm29593-201ENSMUST00000189827 620 ntTSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
RelnQ60841 Gm19605-205ENSMUST00000221712 677 ntTSL 3 BASIC10.06□□□□□ -0.8
RelnQ60841 1110034G24Rik-201ENSMUST00000061891 1076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
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