Protein–RNA interactions for Protein: Q60764

Mkrn3, Probable E3 ubiquitin-protein ligase makorin-3, mousemouse

Predictions only

Length 544 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mkrn3Q60764 Asphd1-201ENSMUST00000052937 730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Mkrn3Q60764 Lrch1-201ENSMUST00000088970 4694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Mkrn3Q60764 Mtif3-202ENSMUST00000066675 4927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Mkrn3Q60764 Aaas-201ENSMUST00000041208 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Mkrn3Q60764 Exoc6b-203ENSMUST00000160197 5439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Mkrn3Q60764 Adam32-201ENSMUST00000119720 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Mkrn3Q60764 Slc38a10-204ENSMUST00000103018 4578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Mkrn3Q60764 AC122840.1-201ENSMUST00000220915 3334 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
Mkrn3Q60764 Snx6-201ENSMUST00000005798 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Mkrn3Q60764 Chtop-201ENSMUST00000001043 3257 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Mkrn3Q60764 Ptprk-202ENSMUST00000218276 4754 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Mkrn3Q60764 Crybg2-213ENSMUST00000227683 5578 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Mkrn3Q60764 Sp6-201ENSMUST00000047997 3546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Mkrn3Q60764 Myocd-201ENSMUST00000101042 2585 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Mkrn3Q60764 Abi1-203ENSMUST00000093171 2411 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Mkrn3Q60764 4933424N20Rik-201ENSMUST00000200749 1463 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
Mkrn3Q60764 Nrf1-207ENSMUST00000115206 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Mkrn3Q60764 Ccnb2-ps-202ENSMUST00000170898 2296 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
Mkrn3Q60764 Gm15411-201ENSMUST00000133243 3488 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Mkrn3Q60764 Ccdc151-202ENSMUST00000115336 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Mkrn3Q60764 Plekhb1-205ENSMUST00000107046 2793 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Mkrn3Q60764 Lysmd1-201ENSMUST00000066386 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Mkrn3Q60764 Pars2-202ENSMUST00000106781 3046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Mkrn3Q60764 Rabep2-202ENSMUST00000106407 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Mkrn3Q60764 Tfdp2-204ENSMUST00000179065 2213 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Mkrn3Q60764 Oxr1-204ENSMUST00000110297 4596 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Mkrn3Q60764 Cdc7-204ENSMUST00000118261 3129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Mkrn3Q60764 Bptf-202ENSMUST00000106762 11847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Mkrn3Q60764 Eif4ebp2-202ENSMUST00000167087 1422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Mkrn3Q60764 Pga5-201ENSMUST00000025647 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Mkrn3Q60764 Pip5k1a-206ENSMUST00000107236 3618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Mkrn3Q60764 Rab11a-208ENSMUST00000172298 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Mkrn3Q60764 Ttc33-203ENSMUST00000118193 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Mkrn3Q60764 Serpinb12-201ENSMUST00000081277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Mkrn3Q60764 Gm36957-201ENSMUST00000192982 2824 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
Mkrn3Q60764 Lrrc57-203ENSMUST00000102498 1901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Mkrn3Q60764 Sgsm1-203ENSMUST00000112324 1102 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Mkrn3Q60764 Gm13674-201ENSMUST00000121276 823 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
Mkrn3Q60764 Gm8356-202ENSMUST00000164917 984 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Mkrn3Q60764 Rps13-201ENSMUST00000170953 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Mkrn3Q60764 Stard10-207ENSMUST00000173270 670 ntTSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Mkrn3Q60764 Mymx-203ENSMUST00000178858 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Mkrn3Q60764 Gm21118-202ENSMUST00000187418 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Mkrn3Q60764 Gm29199-201ENSMUST00000187766 775 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
Mkrn3Q60764 Sox2ot-207ENSMUST00000196987 727 ntTSL 3 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Mkrn3Q60764 Gm18290-201ENSMUST00000202900 844 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
Mkrn3Q60764 1700011D18Rik-201ENSMUST00000205762 277 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
Mkrn3Q60764 Gm45186-201ENSMUST00000206874 478 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
Mkrn3Q60764 Gm45554-202ENSMUST00000210964 1090 ntTSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Mkrn3Q60764 Olfr1335-202ENSMUST00000219094 1148 ntAPPRIS P2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Mkrn3Q60764 AC161537.1-201ENSMUST00000226199 1015 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
Mkrn3Q60764 AC121912.1-201ENSMUST00000227525 1201 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
Mkrn3Q60764 1110017D15Rik-201ENSMUST00000030152 1114 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Mkrn3Q60764 Olfr1335-201ENSMUST00000084313 1148 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Mkrn3Q60764 Taar7e-201ENSMUST00000092656 1077 ntAPPRIS P1 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Mkrn3Q60764 Fam47e-202ENSMUST00000131166 1500 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Mkrn3Q60764 Mfsd13b-205ENSMUST00000216241 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Mkrn3Q60764 Fancc-218ENSMUST00000220684 2006 ntTSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Mkrn3Q60764 Fuca2-201ENSMUST00000060212 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Mkrn3Q60764 Steap3-202ENSMUST00000112640 2752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Mkrn3Q60764 Fam78a-201ENSMUST00000056406 4107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Mkrn3Q60764 Xlr5a-203ENSMUST00000114521 1474 ntTSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Mkrn3Q60764 Cdkl2-203ENSMUST00000113140 2559 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Mkrn3Q60764 Tle1-201ENSMUST00000030095 2569 ntTSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Mkrn3Q60764 Acap2-201ENSMUST00000058033 6493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Mkrn3Q60764 Cdnf-201ENSMUST00000036350 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Mkrn3Q60764 E2f3-201ENSMUST00000102948 5097 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Mkrn3Q60764 Cplx1-201ENSMUST00000046892 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Mkrn3Q60764 Tcf4-240ENSMUST00000201781 2779 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Mkrn3Q60764 Actg2-201ENSMUST00000075161 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Mkrn3Q60764 Lypd1-202ENSMUST00000159417 6464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Mkrn3Q60764 Kif1c-204ENSMUST00000137119 6596 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Mkrn3Q60764 Brd2-202ENSMUST00000095347 2617 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Mkrn3Q60764 Treh-201ENSMUST00000034609 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Mkrn3Q60764 Atp6v1h-201ENSMUST00000044369 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Mkrn3Q60764 Olfr1140-201ENSMUST00000214723 1421 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Mkrn3Q60764 Abcg5-201ENSMUST00000066175 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Mkrn3Q60764 Olfr239-202ENSMUST00000213731 3690 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Mkrn3Q60764 AC126444.1-201ENSMUST00000225938 1768 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
Mkrn3Q60764 Gsdme-205ENSMUST00000170142 2133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Mkrn3Q60764 Recql-201ENSMUST00000032370 2112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Mkrn3Q60764 Cd19-204ENSMUST00000206325 2452 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Mkrn3Q60764 Smim14-205ENSMUST00000139122 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Mkrn3Q60764 Adam22-203ENSMUST00000088744 9245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Mkrn3Q60764 Rev3l-201ENSMUST00000019986 10713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Mkrn3Q60764 Ptpn2-203ENSMUST00000122412 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Mkrn3Q60764 Ttc3-201ENSMUST00000117648 7417 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Mkrn3Q60764 Itk-202ENSMUST00000101306 1185 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Mkrn3Q60764 Ccdc28b-202ENSMUST00000106035 821 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Mkrn3Q60764 Mogat1-202ENSMUST00000113524 1228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Mkrn3Q60764 Pbdc1-202ENSMUST00000119477 1239 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Mkrn3Q60764 Gm15979-201ENSMUST00000149741 590 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Mkrn3Q60764 2010001A14Rik-203ENSMUST00000152790 714 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Mkrn3Q60764 Asb17os-201ENSMUST00000156292 496 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Mkrn3Q60764 Ftl1-ps2-201ENSMUST00000169477 549 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
Mkrn3Q60764 Gm20417-201ENSMUST00000174784 425 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Mkrn3Q60764 Raet1e-202ENSMUST00000178026 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Mkrn3Q60764 Gm2383-201ENSMUST00000181461 807 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
Mkrn3Q60764 Gm29405-201ENSMUST00000187204 370 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Mkrn3Q60764 Gm28585-201ENSMUST00000187587 442 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 72.3 ms