Protein–RNA interactions for Protein: Q60520

Sin3a, Paired amphipathic helix protein Sin3a, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,274 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sin3aQ60520 Spata3-211ENSMUST00000159876 760 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Sin3aQ60520 Gm8459-201ENSMUST00000162504 760 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Sin3aQ60520 Gm2965-201ENSMUST00000198365 343 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Sin3aQ60520 Gm43050-202ENSMUST00000201152 651 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Sin3aQ60520 Cby1-201ENSMUST00000023064 1119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Sin3aQ60520 Abhd14a-201ENSMUST00000048685 1256 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Sin3aQ60520 Mettl5-201ENSMUST00000060447 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Sin3aQ60520 Olfr959-201ENSMUST00000079178 1055 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Sin3aQ60520 Col9a1-202ENSMUST00000088349 3059 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Sin3aQ60520 Lpar1-205ENSMUST00000107575 3421 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Sin3aQ60520 Olfr279-202ENSMUST00000205772 5330 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Sin3aQ60520 Gm2670-201ENSMUST00000180668 2804 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Sin3aQ60520 Camkv-204ENSMUST00000194206 2827 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Sin3aQ60520 Nhs-202ENSMUST00000087085 8805 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Sin3aQ60520 Maip1-201ENSMUST00000027114 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Sin3aQ60520 Pkn1-208ENSMUST00000144258 2995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Sin3aQ60520 Tfr2-206ENSMUST00000198783 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Sin3aQ60520 Rab19-201ENSMUST00000031986 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Sin3aQ60520 Dck-201ENSMUST00000031311 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Sin3aQ60520 Styk1-202ENSMUST00000121078 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Sin3aQ60520 Slc4a9-202ENSMUST00000115694 2861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Sin3aQ60520 Cecr2-202ENSMUST00000112686 9212 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Sin3aQ60520 Hdac7-201ENSMUST00000079838 3985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Sin3aQ60520 Msantd1-201ENSMUST00000050535 2793 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Sin3aQ60520 Slamf7-204ENSMUST00000194531 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Sin3aQ60520 BC024139-202ENSMUST00000089654 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Sin3aQ60520 Tcf4-243ENSMUST00000202057 1941 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Sin3aQ60520 Ctr9-201ENSMUST00000005749 4300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Sin3aQ60520 Scpep1-201ENSMUST00000000287 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Sin3aQ60520 Mir680-2-201ENSMUST00000102163 110 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Sin3aQ60520 Gm23251-201ENSMUST00000103773 110 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Sin3aQ60520 Ppil6-201ENSMUST00000105507 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Sin3aQ60520 Fam110a-202ENSMUST00000109863 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Sin3aQ60520 Myl2-203ENSMUST00000111751 889 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Sin3aQ60520 Gm11783-201ENSMUST00000119549 885 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Sin3aQ60520 Cep97-206ENSMUST00000122280 1057 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Sin3aQ60520 B9d1os-201ENSMUST00000137010 674 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Sin3aQ60520 Gm20495-201ENSMUST00000173902 235 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Sin3aQ60520 Gm29087-201ENSMUST00000186462 645 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Sin3aQ60520 Gm28982-201ENSMUST00000186895 512 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Sin3aQ60520 5330413P13Rik-205ENSMUST00000210961 913 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Sin3aQ60520 Mcee-201ENSMUST00000037205 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Sin3aQ60520 H3f3a-201ENSMUST00000081026 888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Sin3aQ60520 Elmsan1-201ENSMUST00000046266 6848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Sin3aQ60520 A530013C23Rik-202ENSMUST00000141923 3489 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Sin3aQ60520 Gm15513-201ENSMUST00000140646 1569 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Sin3aQ60520 Bdkrb2-201ENSMUST00000001652 3792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Sin3aQ60520 Phka2-203ENSMUST00000112377 3947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Sin3aQ60520 Dcaf4-201ENSMUST00000021645 2008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Sin3aQ60520 Gm43102-201ENSMUST00000201004 2324 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Sin3aQ60520 Mospd2-203ENSMUST00000112248 2487 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Sin3aQ60520 Pfkfb2-208ENSMUST00000187089 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Sin3aQ60520 Dph7-201ENSMUST00000028351 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Sin3aQ60520 Mirt1-203ENSMUST00000181539 2259 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Sin3aQ60520 St6gal1-201ENSMUST00000023601 4506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Sin3aQ60520 Myo18a-221ENSMUST00000167856 6132 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Sin3aQ60520 Foxred1-201ENSMUST00000043805 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Sin3aQ60520 Lck-208ENSMUST00000167288 2074 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Sin3aQ60520 Gm4409-201ENSMUST00000130734 1919 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Sin3aQ60520 Lin37-202ENSMUST00000108164 1312 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Sin3aQ60520 Mfsd14b-203ENSMUST00000155487 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Sin3aQ60520 Ubxn10-201ENSMUST00000105809 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Sin3aQ60520 Acrbp-202ENSMUST00000088294 1883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Sin3aQ60520 Stra6-202ENSMUST00000085677 2725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Sin3aQ60520 Gm29771-201ENSMUST00000193142 1423 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Sin3aQ60520 A430033K04Rik-203ENSMUST00000198958 2264 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Sin3aQ60520 Ccdc163-202ENSMUST00000106462 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Sin3aQ60520 Inca1-202ENSMUST00000108541 1150 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Sin3aQ60520 Styxl1-205ENSMUST00000111164 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Sin3aQ60520 Rpsa-ps12-201ENSMUST00000120596 892 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Sin3aQ60520 Inca1-205ENSMUST00000126114 1189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Sin3aQ60520 Gm4131-201ENSMUST00000186010 1264 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Sin3aQ60520 Gm38151-201ENSMUST00000195085 289 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Sin3aQ60520 AC155637.1-201ENSMUST00000218560 636 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Sin3aQ60520 CT009713.8-201ENSMUST00000225448 560 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Sin3aQ60520 Cox6a2-201ENSMUST00000033049 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Sin3aQ60520 Inca1-201ENSMUST00000073625 1218 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Sin3aQ60520 Krtap19-1-201ENSMUST00000081334 493 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Sin3aQ60520 Rps6ka6-203ENSMUST00000096348 4151 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Sin3aQ60520 Nnt-203ENSMUST00000109204 3198 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Sin3aQ60520 Fam161a-203ENSMUST00000109557 1947 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Sin3aQ60520 Spag16-202ENSMUST00000113940 3559 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Sin3aQ60520 Arhgef16-207ENSMUST00000169623 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Sin3aQ60520 Tunar-201ENSMUST00000180458 3282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Sin3aQ60520 Nfasc-203ENSMUST00000163770 3903 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Sin3aQ60520 Susd4-201ENSMUST00000085724 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Sin3aQ60520 Gabpb1-206ENSMUST00000110425 4153 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Sin3aQ60520 Cdc42ep2-201ENSMUST00000055458 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Sin3aQ60520 Lgr5-208ENSMUST00000173740 2508 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Sin3aQ60520 Aldh3b2-201ENSMUST00000143380 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Sin3aQ60520 Gm44755-201ENSMUST00000207830 2102 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Sin3aQ60520 Cd55b-201ENSMUST00000112488 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Sin3aQ60520 C77080-203ENSMUST00000106051 5049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Sin3aQ60520 Gm21939-201ENSMUST00000221137 2773 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Sin3aQ60520 Rbm14-202ENSMUST00000113793 3508 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Sin3aQ60520 Gm9544-201ENSMUST00000223349 2482 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Sin3aQ60520 Gm9129-201ENSMUST00000218173 1689 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Sin3aQ60520 Nek1-209ENSMUST00000211672 5109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Sin3aQ60520 Gm14071-201ENSMUST00000117817 509 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Sin3aQ60520 Mageb17-ps-201ENSMUST00000117902 919 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.5 ms