Protein–RNA interactions for Protein: Q505G4

Rtl6, Retrotransposon Gag-like protein 6, mousemouse

Predictions only

Length 243 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rtl6Q505G4 Runx1-202ENSMUST00000113956 4738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Rtl6Q505G4 Olfr658-202ENSMUST00000210641 2915 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Rtl6Q505G4 Olfr658-201ENSMUST00000089296 2912 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Rtl6Q505G4 Ly6e-210ENSMUST00000188866 2068 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Rtl6Q505G4 Cldn12-201ENSMUST00000060947 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Rtl6Q505G4 Plekhn1-203ENSMUST00000217885 1982 ntTSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Rtl6Q505G4 G630016G05Rik-202ENSMUST00000156095 3398 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Rtl6Q505G4 Pafah2-201ENSMUST00000105869 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Rtl6Q505G4 Rasgef1b-203ENSMUST00000146396 3339 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Rtl6Q505G4 Cd8b1-201ENSMUST00000065248 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Rtl6Q505G4 Pars2-202ENSMUST00000106781 3046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Rtl6Q505G4 Ubap1-201ENSMUST00000072866 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Rtl6Q505G4 Adamts16-202ENSMUST00000109694 3378 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Rtl6Q505G4 Smim1-208ENSMUST00000143047 3373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Rtl6Q505G4 Acacb-201ENSMUST00000031583 8482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Rtl6Q505G4 Pcgf2-203ENSMUST00000103149 817 ntTSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Rtl6Q505G4 Ighg2c-201ENSMUST00000103416 1214 ntAPPRIS P5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Rtl6Q505G4 Gm14190-201ENSMUST00000105073 153 ntAPPRIS P1 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Rtl6Q505G4 Wsb2-ps-201ENSMUST00000117937 1217 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
Rtl6Q505G4 Gm15610-201ENSMUST00000120584 195 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
Rtl6Q505G4 Platr29-201ENSMUST00000130022 830 ntTSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Rtl6Q505G4 Prdx5-203ENSMUST00000149261 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Rtl6Q505G4 Gm14249-201ENSMUST00000156239 1017 ntTSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Rtl6Q505G4 Gm25881-201ENSMUST00000157783 103 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
Rtl6Q505G4 Ubl5-206ENSMUST00000161486 794 ntTSL 2 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Rtl6Q505G4 Fundc1-204ENSMUST00000176638 448 ntTSL 3 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Rtl6Q505G4 Gm28287-201ENSMUST00000186612 546 ntTSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Rtl6Q505G4 Gm28686-201ENSMUST00000187404 609 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
Rtl6Q505G4 Gm29019-202ENSMUST00000188623 564 ntTSL 2 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Rtl6Q505G4 Gm28778-201ENSMUST00000190734 785 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Rtl6Q505G4 Gm43184-201ENSMUST00000197247 542 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
Rtl6Q505G4 Gm43068-201ENSMUST00000201095 1273 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
Rtl6Q505G4 Gm4157-201ENSMUST00000211647 679 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
Rtl6Q505G4 Mt3-202ENSMUST00000211915 440 ntTSL 3 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Rtl6Q505G4 8030455M16Rik-201ENSMUST00000213014 902 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Rtl6Q505G4 Gm9797-202ENSMUST00000218003 294 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
Rtl6Q505G4 AC133602.1-201ENSMUST00000227510 509 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
Rtl6Q505G4 Polr2d-201ENSMUST00000025106 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Rtl6Q505G4 Azgp1-201ENSMUST00000035390 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Rtl6Q505G4 Fam25c-201ENSMUST00000052126 408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Rtl6Q505G4 Mia-201ENSMUST00000071986 566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Rtl6Q505G4 Pip4k2b-201ENSMUST00000018691 5053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Rtl6Q505G4 Mrvi1-202ENSMUST00000125758 5953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Rtl6Q505G4 Acsf3-202ENSMUST00000212781 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Rtl6Q505G4 4933431E20Rik-201ENSMUST00000131345 5407 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Rtl6Q505G4 Limk2-201ENSMUST00000101638 3514 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Rtl6Q505G4 Cic-212ENSMUST00000169266 8221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Rtl6Q505G4 Efna1-202ENSMUST00000118587 1632 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Rtl6Q505G4 Neil1-202ENSMUST00000186410 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Rtl6Q505G4 Gm19692-201ENSMUST00000203856 2084 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
Rtl6Q505G4 Slc25a22-203ENSMUST00000106007 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Rtl6Q505G4 Ikbip-201ENSMUST00000020149 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Rtl6Q505G4 Ecd-201ENSMUST00000022344 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Rtl6Q505G4 Pfkp-201ENSMUST00000021614 2679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Rtl6Q505G4 Cldn18-202ENSMUST00000112882 1750 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Rtl6Q505G4 Gm43267-201ENSMUST00000199664 1796 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
Rtl6Q505G4 Stat3-202ENSMUST00000103114 6042 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Rtl6Q505G4 Dcc-202ENSMUST00000114943 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Rtl6Q505G4 Chtop-201ENSMUST00000001043 3257 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Rtl6Q505G4 Lrfn5-201ENSMUST00000055815 4410 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Rtl6Q505G4 Gm9333-201ENSMUST00000205452 1323 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
Rtl6Q505G4 Olfr139-204ENSMUST00000214111 1311 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Rtl6Q505G4 Ewsr1-201ENSMUST00000063232 1320 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Rtl6Q505G4 Luc7l-201ENSMUST00000025023 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Rtl6Q505G4 Igsf3-201ENSMUST00000043983 7371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Rtl6Q505G4 Fosb-201ENSMUST00000003640 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Rtl6Q505G4 Hk2-201ENSMUST00000000642 5513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Rtl6Q505G4 Pbrm1-208ENSMUST00000112098 6566 ntTSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Rtl6Q505G4 Tmx3-201ENSMUST00000025515 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Rtl6Q505G4 Sstr3-201ENSMUST00000053239 3928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Rtl6Q505G4 Ppip5k1-202ENSMUST00000110625 5226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Rtl6Q505G4 Olfr222-203ENSMUST00000215339 2166 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Rtl6Q505G4 Maml3-201ENSMUST00000118075 5450 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Rtl6Q505G4 Pnpla6-212ENSMUST00000208002 4444 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Rtl6Q505G4 Plekhm1-201ENSMUST00000041272 5968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Rtl6Q505G4 Tas1r2-201ENSMUST00000030510 3047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Rtl6Q505G4 Gjd4-201ENSMUST00000041007 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Rtl6Q505G4 Cntnap4-201ENSMUST00000034225 4848 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Rtl6Q505G4 Nynrin-201ENSMUST00000100529 6990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Rtl6Q505G4 Ripor1-201ENSMUST00000043531 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Rtl6Q505G4 Prrt3-204ENSMUST00000205075 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Rtl6Q505G4 Lnx1-204ENSMUST00000117388 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Rtl6Q505G4 Haus6-201ENSMUST00000070607 6158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Rtl6Q505G4 Acsf3-201ENSMUST00000015160 2206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Rtl6Q505G4 Abcc10-201ENSMUST00000047970 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Rtl6Q505G4 Rab14-201ENSMUST00000028238 3081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Rtl6Q505G4 Fcho1-201ENSMUST00000093444 3073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Rtl6Q505G4 AC129931.1-201ENSMUST00000228865 1861 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
Rtl6Q505G4 Slx4ip-206ENSMUST00000180277 2723 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Rtl6Q505G4 Mzf1-201ENSMUST00000069289 3597 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Rtl6Q505G4 Lyzl6-202ENSMUST00000107014 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Rtl6Q505G4 Gm12566-201ENSMUST00000121479 359 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
Rtl6Q505G4 Ankrd29-202ENSMUST00000122408 850 ntTSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Rtl6Q505G4 Pcbd2-202ENSMUST00000124968 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Rtl6Q505G4 Pabpc1l2a-ps-201ENSMUST00000128361 513 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
Rtl6Q505G4 Smpd4-223ENSMUST00000172182 516 ntTSL 3 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Rtl6Q505G4 Gm18734-201ENSMUST00000172937 808 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
Rtl6Q505G4 1700095B10Rik-201ENSMUST00000182349 978 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Rtl6Q505G4 Gm3332-201ENSMUST00000189337 928 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
Rtl6Q505G4 Gm42629-201ENSMUST00000199063 1102 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.7 ms