Protein–RNA interactions for Protein: Q3USS0

Gm6899, Predicted gene 6899, mousemouse

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Length 134 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm6899Q3USS0 Plch2-201ENSMUST00000105631 5053 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Gm6899Q3USS0 Rpl22-204ENSMUST00000139685 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Gm6899Q3USS0 Lyplal1-201ENSMUST00000045388 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Gm6899Q3USS0 Mxd1-201ENSMUST00000001184 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Gm6899Q3USS0 Gm33366-201ENSMUST00000195583 3827 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
Gm6899Q3USS0 Lmbr1-203ENSMUST00000196321 3422 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Gm6899Q3USS0 Slc8a2-201ENSMUST00000168693 4171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Gm6899Q3USS0 Gabrr1-201ENSMUST00000029947 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Gm6899Q3USS0 Ap3d1-201ENSMUST00000020420 4805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Gm6899Q3USS0 Gm44999-201ENSMUST00000207456 1493 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
Gm6899Q3USS0 Gm12198-201ENSMUST00000154068 1809 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Gm6899Q3USS0 Gypa-201ENSMUST00000063359 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Gm6899Q3USS0 Grm2-201ENSMUST00000023959 4711 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Gm6899Q3USS0 Adamts7-202ENSMUST00000113060 5098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Gm6899Q3USS0 Cryz-208ENSMUST00000192462 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Gm6899Q3USS0 Hk1-202ENSMUST00000099691 4278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Gm6899Q3USS0 Ppp6r3-202ENSMUST00000113997 4952 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Gm6899Q3USS0 1700010I14Rik-201ENSMUST00000024650 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Gm6899Q3USS0 Tmem178b-201ENSMUST00000061740 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Gm6899Q3USS0 Gpcpd1-204ENSMUST00000110136 3546 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Gm6899Q3USS0 Satb2-201ENSMUST00000042857 6277 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Gm6899Q3USS0 Col3a1-201ENSMUST00000087883 5564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Gm6899Q3USS0 Gadl1-202ENSMUST00000119291 1729 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Gm6899Q3USS0 Rcor3-201ENSMUST00000073279 3748 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Gm6899Q3USS0 Dtx1-201ENSMUST00000031607 4035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Gm6899Q3USS0 Gm2238-201ENSMUST00000192074 3669 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
Gm6899Q3USS0 Dcaf11-203ENSMUST00000117701 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Gm6899Q3USS0 Zfp593-201ENSMUST00000030644 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Gm6899Q3USS0 Gpr155-203ENSMUST00000112043 3284 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Gm6899Q3USS0 A430033K04Rik-203ENSMUST00000198958 2264 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Gm6899Q3USS0 Axl-202ENSMUST00000085948 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Gm6899Q3USS0 Cep164-204ENSMUST00000213154 6105 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Gm6899Q3USS0 Lgals12-201ENSMUST00000079902 2590 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Gm6899Q3USS0 Trim11-202ENSMUST00000108809 3522 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Gm6899Q3USS0 Trgv2-201ENSMUST00000103563 491 ntAPPRIS P1 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Gm6899Q3USS0 Gm25076-201ENSMUST00000104098 132 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
Gm6899Q3USS0 Skap1-206ENSMUST00000107663 742 ntTSL 3 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Gm6899Q3USS0 Fam129a-203ENSMUST00000111875 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Gm6899Q3USS0 Gm12218-201ENSMUST00000117666 399 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
Gm6899Q3USS0 Gm16341-201ENSMUST00000126385 377 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Gm6899Q3USS0 Gm11772-201ENSMUST00000136542 532 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Gm6899Q3USS0 2310057J18Rik-204ENSMUST00000152363 1043 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Gm6899Q3USS0 Gm29067-201ENSMUST00000190821 470 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
Gm6899Q3USS0 3110080O07Rik-201ENSMUST00000193469 1021 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
Gm6899Q3USS0 Gm43520-201ENSMUST00000197996 164 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
Gm6899Q3USS0 Chn2-212ENSMUST00000204115 783 ntTSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Gm6899Q3USS0 Gm44421-201ENSMUST00000205064 1221 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
Gm6899Q3USS0 Mrnip-201ENSMUST00000020647 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Gm6899Q3USS0 Pgpep1l-202ENSMUST00000207874 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Gm6899Q3USS0 Gm5996-201ENSMUST00000211110 718 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
Gm6899Q3USS0 C330004P14Rik-201ENSMUST00000218833 628 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Gm6899Q3USS0 Gm18856-203ENSMUST00000222015 483 ntTSL 2 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Gm6899Q3USS0 AC122350.1-201ENSMUST00000228135 533 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
Gm6899Q3USS0 1600002K03Rik-201ENSMUST00000041882 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Gm6899Q3USS0 Galntl6-202ENSMUST00000098757 2210 ntTSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Gm6899Q3USS0 Fam78a-201ENSMUST00000056406 4107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Gm6899Q3USS0 Psapl1-201ENSMUST00000052224 2548 ntAPPRIS P1 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Gm6899Q3USS0 6230400D17Rik-201ENSMUST00000180987 1554 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Gm6899Q3USS0 Gm4593-201ENSMUST00000205334 1555 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Gm6899Q3USS0 Nudt13-207ENSMUST00000224311 1574 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
Gm6899Q3USS0 Sept8-204ENSMUST00000121334 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Gm6899Q3USS0 Cacna1g-203ENSMUST00000103166 8104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Gm6899Q3USS0 Diaph2-207ENSMUST00000167619 8439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Gm6899Q3USS0 Ube2c-201ENSMUST00000001439 2191 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Gm6899Q3USS0 Stx11-202ENSMUST00000163425 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Gm6899Q3USS0 Sv2a-201ENSMUST00000035371 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Gm6899Q3USS0 E030013I19Rik-201ENSMUST00000148089 2754 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Gm6899Q3USS0 Rsl24d1-201ENSMUST00000034738 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Gm6899Q3USS0 Cyp4x1-201ENSMUST00000051400 1524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Gm6899Q3USS0 Dpysl5-203ENSMUST00000114729 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Gm6899Q3USS0 Ppp1r18-202ENSMUST00000122899 2743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Gm6899Q3USS0 Tmprss3-201ENSMUST00000024833 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Gm6899Q3USS0 Phka1-204ENSMUST00000119229 6025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Gm6899Q3USS0 Rsbn1-201ENSMUST00000051139 4762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Gm6899Q3USS0 Gm37600-201ENSMUST00000193764 3292 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
Gm6899Q3USS0 Vsx2-201ENSMUST00000021665 3270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Gm6899Q3USS0 Mmel1-203ENSMUST00000105634 2669 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Gm6899Q3USS0 Cln3-201ENSMUST00000032962 2386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Gm6899Q3USS0 A130010J15Rik-204ENSMUST00000161235 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Gm6899Q3USS0 Psmc2-201ENSMUST00000030769 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Gm6899Q3USS0 Tpd52l2-202ENSMUST00000069712 1799 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Gm6899Q3USS0 Epb41l2-207ENSMUST00000218903 4115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Gm6899Q3USS0 Abcb8-201ENSMUST00000073076 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Gm6899Q3USS0 Chd4-203ENSMUST00000112392 6652 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Gm6899Q3USS0 Camta2-203ENSMUST00000108544 4632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Gm6899Q3USS0 Zfp108-203ENSMUST00000206777 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Gm6899Q3USS0 Cfb-202ENSMUST00000128767 2751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Gm6899Q3USS0 Gsdmcl-ps-203ENSMUST00000188367 1375 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Gm6899Q3USS0 Fggy-201ENSMUST00000043335 1910 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Gm6899Q3USS0 B230317F23Rik-201ENSMUST00000052189 2472 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Gm6899Q3USS0 Lats2-207ENSMUST00000173990 3834 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Gm6899Q3USS0 Flt4-201ENSMUST00000020617 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Gm6899Q3USS0 Gm26615-201ENSMUST00000181522 3201 ntTSL 2 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Gm6899Q3USS0 Gm5740-201ENSMUST00000211003 1857 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Gm6899Q3USS0 Muc3-201ENSMUST00000041226 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Gm6899Q3USS0 Oard1-202ENSMUST00000167180 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Gm6899Q3USS0 Catsper3-201ENSMUST00000021961 1330 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Gm6899Q3USS0 Bcl11b-201ENSMUST00000066060 8111 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Gm6899Q3USS0 Rnf44-218ENSMUST00000177950 3941 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Gm6899Q3USS0 Prr36-201ENSMUST00000168386 4616 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
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