Protein–RNA interactions for Protein: Q3URE1

Acsf3, Acyl-CoA synthetase family member 3, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 583 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Acsf3Q3URE1 Mob3a-201ENSMUST00000003438 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Acsf3Q3URE1 F730043M19Rik-204ENSMUST00000148740 3312 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Acsf3Q3URE1 Syvn1-207ENSMUST00000156550 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Acsf3Q3URE1 Spg20-202ENSMUST00000107971 3567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Acsf3Q3URE1 Fosb-202ENSMUST00000207334 3664 ntTSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Acsf3Q3URE1 Gja8-201ENSMUST00000062944 6940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Acsf3Q3URE1 Otub2-202ENSMUST00000101094 3228 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Acsf3Q3URE1 Nxph2-201ENSMUST00000102945 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Acsf3Q3URE1 Trav13-1-201ENSMUST00000103651 331 ntAPPRIS P1 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Acsf3Q3URE1 Chtop-201ENSMUST00000001043 3257 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Acsf3Q3URE1 Tnnt3-206ENSMUST00000105944 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Acsf3Q3URE1 Tnnt3-210ENSMUST00000105948 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Acsf3Q3URE1 Tnnt3-212ENSMUST00000105950 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Acsf3Q3URE1 Epb41-207ENSMUST00000105975 5235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Acsf3Q3URE1 Slc25a22-203ENSMUST00000106007 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Acsf3Q3URE1 Cyp2d34-201ENSMUST00000109515 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Acsf3Q3URE1 Cdk2ap1-204ENSMUST00000111474 1286 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Acsf3Q3URE1 Gm6580-201ENSMUST00000117504 1357 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
Acsf3Q3URE1 Gm8566-201ENSMUST00000120174 465 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
Acsf3Q3URE1 Mrps17-207ENSMUST00000121813 868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Acsf3Q3URE1 Elmod3-204ENSMUST00000141833 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Acsf3Q3URE1 Gm11494-201ENSMUST00000142279 1738 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Acsf3Q3URE1 Gm23699-201ENSMUST00000158835 135 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
Acsf3Q3URE1 Tmem40-205ENSMUST00000166254 811 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Acsf3Q3URE1 Cysltr2-202ENSMUST00000169168 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Acsf3Q3URE1 Tnnt3-224ENSMUST00000169299 1013 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Acsf3Q3URE1 Tnnt3-226ENSMUST00000180152 1067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Acsf3Q3URE1 Gm8100-201ENSMUST00000182906 988 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
Acsf3Q3URE1 Neil1-202ENSMUST00000186410 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Acsf3Q3URE1 Gm42682-201ENSMUST00000198349 1265 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
Acsf3Q3URE1 Srrt-212ENSMUST00000199243 2988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Acsf3Q3URE1 Gm43378-201ENSMUST00000199336 582 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
Acsf3Q3URE1 Gm19287-201ENSMUST00000203190 358 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
Acsf3Q3URE1 Gm4316-201ENSMUST00000212411 2617 ntTSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Acsf3Q3URE1 Mxd3-201ENSMUST00000021941 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Acsf3Q3URE1 Trim55-201ENSMUST00000029139 2595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Acsf3Q3URE1 Cacng5-201ENSMUST00000039071 3705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Acsf3Q3URE1 Nudt7-201ENSMUST00000066514 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Acsf3Q3URE1 Gpr139-201ENSMUST00000084650 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Acsf3Q3URE1 Ip6k2-201ENSMUST00000085018 1846 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Acsf3Q3URE1 Kif26b-201ENSMUST00000160789 6216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
Acsf3Q3URE1 Myo5b-203ENSMUST00000121875 6065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.7
Acsf3Q3URE1 Cers6-201ENSMUST00000028426 7038 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
Acsf3Q3URE1 Tti2-202ENSMUST00000209851 3133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
Acsf3Q3URE1 Chrdl1-204ENSMUST00000166406 2605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
Acsf3Q3URE1 5930412G12Rik-201ENSMUST00000091324 2403 ntTSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Acsf3Q3URE1 Lrmp-201ENSMUST00000032396 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Acsf3Q3URE1 9430038I01Rik-203ENSMUST00000120340 4643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Acsf3Q3URE1 Gabpb1-206ENSMUST00000110425 4153 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Acsf3Q3URE1 Olfr56-202ENSMUST00000102785 1930 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Acsf3Q3URE1 Gm8522-201ENSMUST00000118416 1929 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Acsf3Q3URE1 Prr3-203ENSMUST00000172429 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Acsf3Q3URE1 Gm43807-201ENSMUST00000200678 1781 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Acsf3Q3URE1 Abcd3-201ENSMUST00000029770 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Acsf3Q3URE1 Acacb-201ENSMUST00000031583 8482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Acsf3Q3URE1 Smtn-202ENSMUST00000020721 3335 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Acsf3Q3URE1 Grhl2-201ENSMUST00000022895 4947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Acsf3Q3URE1 AC130671.2-201ENSMUST00000227224 1621 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Acsf3Q3URE1 4930563E18Rik-201ENSMUST00000180948 1553 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Acsf3Q3URE1 Spred2-201ENSMUST00000093298 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Acsf3Q3URE1 Pcgf2-202ENSMUST00000103148 1438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Acsf3Q3URE1 Spata48-201ENSMUST00000020410 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Acsf3Q3URE1 Hbs1l-201ENSMUST00000020153 2793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Acsf3Q3URE1 Gm15541-201ENSMUST00000147449 2713 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Acsf3Q3URE1 Gm4755-201ENSMUST00000181803 2647 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Acsf3Q3URE1 Parvg-201ENSMUST00000023074 2619 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Acsf3Q3URE1 Rpl35a-204ENSMUST00000115078 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Acsf3Q3URE1 Gm7851-201ENSMUST00000117574 323 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
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Acsf3Q3URE1 Dmrtc1a-202ENSMUST00000119624 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
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Acsf3Q3URE1 Pcbd2-202ENSMUST00000124968 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Acsf3Q3URE1 Gm15884-201ENSMUST00000143765 643 ntTSL 3 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Acsf3Q3URE1 Gm11683-201ENSMUST00000147006 918 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Acsf3Q3URE1 D630008O14Rik-202ENSMUST00000149909 1043 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Acsf3Q3URE1 Spata3-210ENSMUST00000153247 884 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Acsf3Q3URE1 Gm23085-201ENSMUST00000157849 293 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Acsf3Q3URE1 5430405H02Rik-202ENSMUST00000176134 1196 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Acsf3Q3URE1 Gm8888-201ENSMUST00000177677 381 ntAPPRIS P1 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Acsf3Q3URE1 Gm29087-201ENSMUST00000186462 645 ntTSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Acsf3Q3URE1 Gm29264-201ENSMUST00000191240 1264 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Acsf3Q3URE1 Gm2965-201ENSMUST00000198365 343 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Acsf3Q3URE1 Acy1-208ENSMUST00000214275 1284 ntTSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Acsf3Q3URE1 1700027J07Rik-202ENSMUST00000215747 1060 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Acsf3Q3URE1 Net1-206ENSMUST00000222504 447 ntTSL 3 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Acsf3Q3URE1 AC151275.1-201ENSMUST00000224870 585 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Acsf3Q3URE1 Spcs1-203ENSMUST00000226374 592 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Acsf3Q3URE1 Lcn8-201ENSMUST00000038482 651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Acsf3Q3URE1 Gm10288-201ENSMUST00000084614 537 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Acsf3Q3URE1 Ighg1-202ENSMUST00000194304 2482 ntAPPRIS P5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Acsf3Q3URE1 Fosb-203ENSMUST00000207716 3546 ntTSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Acsf3Q3URE1 Entpd8-203ENSMUST00000114380 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Acsf3Q3URE1 Tirap-203ENSMUST00000176531 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Acsf3Q3URE1 Sparc-201ENSMUST00000018737 2300 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Acsf3Q3URE1 Eif2s1-201ENSMUST00000071230 3405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Acsf3Q3URE1 Lrfn5-201ENSMUST00000055815 4410 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Acsf3Q3URE1 Zdhhc20-205ENSMUST00000226057 2179 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.1 ms